Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESF1

Otof, Otoferlin, mousemouse

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OtofQ9ESF1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
OtofQ9ESF1 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
OtofQ9ESF1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
OtofQ9ESF1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
OtofQ9ESF1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
OtofQ9ESF1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
OtofQ9ESF1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
OtofQ9ESF1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
OtofQ9ESF1 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
OtofQ9ESF1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
OtofQ9ESF1 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
OtofQ9ESF1 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
OtofQ9ESF1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
OtofQ9ESF1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
OtofQ9ESF1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
OtofQ9ESF1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
OtofQ9ESF1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
OtofQ9ESF1 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
OtofQ9ESF1 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
OtofQ9ESF1 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
OtofQ9ESF1 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
OtofQ9ESF1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OtofQ9ESF1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
OtofQ9ESF1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
OtofQ9ESF1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
OtofQ9ESF1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
OtofQ9ESF1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
OtofQ9ESF1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
OtofQ9ESF1 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
OtofQ9ESF1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
OtofQ9ESF1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
OtofQ9ESF1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
OtofQ9ESF1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
OtofQ9ESF1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
OtofQ9ESF1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OtofQ9ESF1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OtofQ9ESF1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.79■■■□□ 2.04
OtofQ9ESF1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
OtofQ9ESF1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
OtofQ9ESF1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
OtofQ9ESF1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
OtofQ9ESF1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
OtofQ9ESF1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
OtofQ9ESF1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
OtofQ9ESF1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
OtofQ9ESF1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
OtofQ9ESF1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
OtofQ9ESF1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
OtofQ9ESF1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
OtofQ9ESF1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OtofQ9ESF1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
OtofQ9ESF1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
OtofQ9ESF1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.56■■■□□ 2
OtofQ9ESF1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
OtofQ9ESF1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
OtofQ9ESF1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OtofQ9ESF1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
OtofQ9ESF1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
OtofQ9ESF1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
OtofQ9ESF1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
OtofQ9ESF1 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
OtofQ9ESF1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
OtofQ9ESF1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
OtofQ9ESF1 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
OtofQ9ESF1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OtofQ9ESF1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
OtofQ9ESF1 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
OtofQ9ESF1 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
OtofQ9ESF1 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
OtofQ9ESF1 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
OtofQ9ESF1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OtofQ9ESF1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
OtofQ9ESF1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OtofQ9ESF1 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
OtofQ9ESF1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
OtofQ9ESF1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OtofQ9ESF1 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
OtofQ9ESF1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
OtofQ9ESF1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
OtofQ9ESF1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
OtofQ9ESF1 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
OtofQ9ESF1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OtofQ9ESF1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
OtofQ9ESF1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OtofQ9ESF1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
OtofQ9ESF1 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
OtofQ9ESF1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
OtofQ9ESF1 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
OtofQ9ESF1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
OtofQ9ESF1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
OtofQ9ESF1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
OtofQ9ESF1 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
OtofQ9ESF1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OtofQ9ESF1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
OtofQ9ESF1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
OtofQ9ESF1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
OtofQ9ESF1 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
OtofQ9ESF1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OtofQ9ESF1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
OtofQ9ESF1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
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