Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERD8

Parvg, Gamma-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvgQ9ERD8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34,19■■■■□ 3,06
ParvgQ9ERD8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34,16■■■■□ 3,06
ParvgQ9ERD8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34,16■■■■□ 3,06
ParvgQ9ERD8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34,13■■■■□ 3,05
ParvgQ9ERD8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,05
ParvgQ9ERD8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34,07■■■■□ 3,04
ParvgQ9ERD8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC34,04■■■■□ 3,04
ParvgQ9ERD8 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC34■■■■□ 3,03
ParvgQ9ERD8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,99■■■■□ 3,03
ParvgQ9ERD8 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,98■■■■□ 3,03
ParvgQ9ERD8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33,85■■■■□ 3,01
ParvgQ9ERD8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,85■■■■□ 3,01
ParvgQ9ERD8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC33,84■■■■□ 3,01
ParvgQ9ERD8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,83■■■■□ 3,01
ParvgQ9ERD8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,82■■■■□ 3
ParvgQ9ERD8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33,79■■■■□ 3
ParvgQ9ERD8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC33,75■■■□□ 2,99
ParvgQ9ERD8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC33,72■■■□□ 2,99
ParvgQ9ERD8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
ParvgQ9ERD8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,69■■■□□ 2,98
ParvgQ9ERD8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,68■■■□□ 2,98
ParvgQ9ERD8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,65■■■□□ 2,98
ParvgQ9ERD8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,6■■■□□ 2,97
ParvgQ9ERD8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,58■■■□□ 2,97
ParvgQ9ERD8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,53■■■□□ 2,96
ParvgQ9ERD8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,5■■■□□ 2,95
ParvgQ9ERD8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,49■■■□□ 2,95
ParvgQ9ERD8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC33,45■■■□□ 2,95
ParvgQ9ERD8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33,45■■■□□ 2,95
ParvgQ9ERD8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33,42■■■□□ 2,94
ParvgQ9ERD8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33,39■■■□□ 2,94
ParvgQ9ERD8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33,36■■■□□ 2,93
ParvgQ9ERD8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC33,34■■■□□ 2,93
ParvgQ9ERD8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC33,33■■■□□ 2,93
ParvgQ9ERD8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,33■■■□□ 2,93
ParvgQ9ERD8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33,27■■■□□ 2,92
ParvgQ9ERD8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,27■■■□□ 2,92
ParvgQ9ERD8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,24■■■□□ 2,91
ParvgQ9ERD8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,22■■■□□ 2,91
ParvgQ9ERD8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC33,19■■■□□ 2,9
ParvgQ9ERD8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
ParvgQ9ERD8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33,16■■■□□ 2,9
ParvgQ9ERD8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33,16■■■□□ 2,9
ParvgQ9ERD8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC33,15■■■□□ 2,9
ParvgQ9ERD8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33,12■■■□□ 2,89
ParvgQ9ERD8 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33,1■■■□□ 2,89
ParvgQ9ERD8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33,1■■■□□ 2,89
ParvgQ9ERD8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC33,09■■■□□ 2,89
ParvgQ9ERD8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,08■■■□□ 2,89
ParvgQ9ERD8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33,01■■■□□ 2,88
ParvgQ9ERD8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2,87
ParvgQ9ERD8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC32,99■■■□□ 2,87
ParvgQ9ERD8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC32,98■■■□□ 2,87
ParvgQ9ERD8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32,97■■■□□ 2,87
ParvgQ9ERD8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32,92■■■□□ 2,86
ParvgQ9ERD8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,86■■■□□ 2,85
ParvgQ9ERD8 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,84■■■□□ 2,85
ParvgQ9ERD8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,83■■■□□ 2,85
ParvgQ9ERD8 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,82■■■□□ 2,84
ParvgQ9ERD8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,8■■■□□ 2,84
ParvgQ9ERD8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,78■■■□□ 2,84
ParvgQ9ERD8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
ParvgQ9ERD8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
ParvgQ9ERD8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,76■■■□□ 2,83
ParvgQ9ERD8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC32,75■■■□□ 2,83
ParvgQ9ERD8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32,74■■■□□ 2,83
ParvgQ9ERD8 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC32,73■■■□□ 2,83
ParvgQ9ERD8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32,71■■■□□ 2,83
ParvgQ9ERD8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,71■■■□□ 2,83
ParvgQ9ERD8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC32,7■■■□□ 2,83
ParvgQ9ERD8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,65■■■□□ 2,82
ParvgQ9ERD8 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,59■■■□□ 2,81
ParvgQ9ERD8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32,58■■■□□ 2,81
ParvgQ9ERD8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,5■■■□□ 2,79
ParvgQ9ERD8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32,49■■■□□ 2,79
ParvgQ9ERD8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32,47■■■□□ 2,79
ParvgQ9ERD8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC32,46■■■□□ 2,79
ParvgQ9ERD8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32,45■■■□□ 2,78
ParvgQ9ERD8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
ParvgQ9ERD8 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,43■■■□□ 2,78
ParvgQ9ERD8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32,42■■■□□ 2,78
ParvgQ9ERD8 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
ParvgQ9ERD8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,4■■■□□ 2,78
ParvgQ9ERD8 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC32,38■■■□□ 2,77
ParvgQ9ERD8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32,37■■■□□ 2,77
ParvgQ9ERD8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32,37■■■□□ 2,77
ParvgQ9ERD8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,36■■■□□ 2,77
ParvgQ9ERD8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
ParvgQ9ERD8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC32,33■■■□□ 2,77
ParvgQ9ERD8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC32,32■■■□□ 2,76
ParvgQ9ERD8 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32,32■■■□□ 2,76
ParvgQ9ERD8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32,3■■■□□ 2,76
ParvgQ9ERD8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
ParvgQ9ERD8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32,3■■■□□ 2,76
ParvgQ9ERD8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32,3■■■□□ 2,76
ParvgQ9ERD8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32,28■■■□□ 2,76
ParvgQ9ERD8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32,27■■■□□ 2,76
ParvgQ9ERD8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32,25■■■□□ 2,75
ParvgQ9ERD8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC32,25■■■□□ 2,75
ParvgQ9ERD8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC32,23■■■□□ 2,75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25,8 ms