Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,47■■■■■ 4,23
Clstn2Q9ER65 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41,45■■■■■ 4,23
Clstn2Q9ER65 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,36■■■■■ 4,21
Clstn2Q9ER65 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC41,34■■■■■ 4,21
Clstn2Q9ER65 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,33■■■■■ 4,21
Clstn2Q9ER65 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,21
Clstn2Q9ER65 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC41,22■■■■■ 4,19
Clstn2Q9ER65 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,19■■■■■ 4,18
Clstn2Q9ER65 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,06■■■■■ 4,16
Clstn2Q9ER65 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC41,03■■■■■ 4,16
Clstn2Q9ER65 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41,03■■■■■ 4,16
Clstn2Q9ER65 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,02■■■■■ 4,16
Clstn2Q9ER65 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC41,02■■■■■ 4,16
Clstn2Q9ER65 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,95■■■■■ 4,15
Clstn2Q9ER65 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,91■■■■■ 4,14
Clstn2Q9ER65 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,84■■■■■ 4,13
Clstn2Q9ER65 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40,83■■■■■ 4,13
Clstn2Q9ER65 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Clstn2Q9ER65 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Clstn2Q9ER65 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,65■■■■■ 4,1
Clstn2Q9ER65 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40,64■■■■■ 4,1
Clstn2Q9ER65 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC40,62■■■■■ 4,09
Clstn2Q9ER65 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC40,58■■■■■ 4,09
Clstn2Q9ER65 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,56■■■■■ 4,08
Clstn2Q9ER65 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC40,56■■■■■ 4,08
Clstn2Q9ER65 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC40,54■■■■■ 4,08
Clstn2Q9ER65 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,48■■■■■ 4,07
Clstn2Q9ER65 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC40,45■■■■■ 4,07
Clstn2Q9ER65 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Clstn2Q9ER65 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,4■■■■■ 4,06
Clstn2Q9ER65 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,37■■■■■ 4,05
Clstn2Q9ER65 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40,36■■■■■ 4,05
Clstn2Q9ER65 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,31■■■■■ 4,04
Clstn2Q9ER65 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC40,28■■■■■ 4,04
Clstn2Q9ER65 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,28■■■■■ 4,04
Clstn2Q9ER65 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,27■■■■■ 4,04
Clstn2Q9ER65 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40,27■■■■■ 4,04
Clstn2Q9ER65 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC40,2■■■■■ 4,03
Clstn2Q9ER65 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,18■■■■■ 4,02
Clstn2Q9ER65 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40,18■■■■■ 4,02
Clstn2Q9ER65 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40,17■■■■■ 4,02
Clstn2Q9ER65 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40,12■■■■■ 4,01
Clstn2Q9ER65 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40,12■■■■■ 4,01
Clstn2Q9ER65 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40,1■■■■■ 4,01
Clstn2Q9ER65 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40,01■■■■■ 4
Clstn2Q9ER65 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Clstn2Q9ER65 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Clstn2Q9ER65 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,98■■■■□ 3,99
Clstn2Q9ER65 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39,97■■■■□ 3,99
Clstn2Q9ER65 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,97■■■■□ 3,99
Clstn2Q9ER65 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,96■■■■□ 3,99
Clstn2Q9ER65 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,91■■■■□ 3,98
Clstn2Q9ER65 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39,9■■■■□ 3,98
Clstn2Q9ER65 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39,88■■■■□ 3,97
Clstn2Q9ER65 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Clstn2Q9ER65 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39,83■■■■□ 3,97
Clstn2Q9ER65 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,79■■■■□ 3,96
Clstn2Q9ER65 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39,78■■■■□ 3,96
Clstn2Q9ER65 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,77■■■■□ 3,96
Clstn2Q9ER65 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC39,77■■■■□ 3,96
Clstn2Q9ER65 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,77■■■■□ 3,96
Clstn2Q9ER65 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC39,71■■■■□ 3,95
Clstn2Q9ER65 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC39,65■■■■□ 3,94
Clstn2Q9ER65 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC39,6■■■■□ 3,93
Clstn2Q9ER65 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,6■■■■□ 3,93
Clstn2Q9ER65 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC39,49■■■■□ 3,91
Clstn2Q9ER65 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,47■■■■□ 3,91
Clstn2Q9ER65 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,47■■■■□ 3,91
Clstn2Q9ER65 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,44■■■■□ 3,9
Clstn2Q9ER65 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC39,43■■■■□ 3,9
Clstn2Q9ER65 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC39,43■■■■□ 3,9
Clstn2Q9ER65 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39,41■■■■□ 3,9
Clstn2Q9ER65 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Clstn2Q9ER65 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,4■■■■□ 3,9
Clstn2Q9ER65 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,38■■■■□ 3,89
Clstn2Q9ER65 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39,37■■■■□ 3,89
Clstn2Q9ER65 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC39,36■■■■□ 3,89
Clstn2Q9ER65 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,36■■■■□ 3,89
Clstn2Q9ER65 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Clstn2Q9ER65 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC39,34■■■■□ 3,89
Clstn2Q9ER65 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC39,27■■■■□ 3,88
Clstn2Q9ER65 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,27■■■■□ 3,88
Clstn2Q9ER65 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39,26■■■■□ 3,88
Clstn2Q9ER65 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,24■■■■□ 3,87
Clstn2Q9ER65 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Clstn2Q9ER65 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39,23■■■■□ 3,87
Clstn2Q9ER65 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39,22■■■■□ 3,87
Clstn2Q9ER65 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC39,22■■■■□ 3,87
Clstn2Q9ER65 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39,19■■■■□ 3,86
Clstn2Q9ER65 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Clstn2Q9ER65 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,19■■■■□ 3,86
Clstn2Q9ER65 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC39,15■■■■□ 3,86
Clstn2Q9ER65 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC39,15■■■■□ 3,86
Clstn2Q9ER65 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39,14■■■■□ 3,86
Clstn2Q9ER65 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC39,12■■■■□ 3,85
Clstn2Q9ER65 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,11■■■■□ 3,85
Clstn2Q9ER65 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
Clstn2Q9ER65 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,04■■■■□ 3,84
Clstn2Q9ER65 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39,03■■■■□ 3,84
Clstn2Q9ER65 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39■■■■□ 3,83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,2 ms