Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3s1Q9DCR2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ap3s1Q9DCR2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ap3s1Q9DCR2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ap3s1Q9DCR2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ap3s1Q9DCR2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3s1Q9DCR2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Ap3s1Q9DCR2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3s1Q9DCR2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Ap3s1Q9DCR2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ap3s1Q9DCR2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ap3s1Q9DCR2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3s1Q9DCR2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ap3s1Q9DCR2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ap3s1Q9DCR2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ap3s1Q9DCR2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ap3s1Q9DCR2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3s1Q9DCR2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ap3s1Q9DCR2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ap3s1Q9DCR2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ap3s1Q9DCR2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ap3s1Q9DCR2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap3s1Q9DCR2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ap3s1Q9DCR2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3s1Q9DCR2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ap3s1Q9DCR2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ap3s1Q9DCR2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ap3s1Q9DCR2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Ap3s1Q9DCR2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ap3s1Q9DCR2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ap3s1Q9DCR2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ap3s1Q9DCR2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ap3s1Q9DCR2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3s1Q9DCR2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3s1Q9DCR2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3s1Q9DCR2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3s1Q9DCR2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ap3s1Q9DCR2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Ap3s1Q9DCR2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3s1Q9DCR2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ap3s1Q9DCR2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ap3s1Q9DCR2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3s1Q9DCR2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ap3s1Q9DCR2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3s1Q9DCR2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ap3s1Q9DCR2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3s1Q9DCR2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3s1Q9DCR2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3s1Q9DCR2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3s1Q9DCR2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3s1Q9DCR2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ap3s1Q9DCR2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ap3s1Q9DCR2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3s1Q9DCR2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ap3s1Q9DCR2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3s1Q9DCR2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ap3s1Q9DCR2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Ap3s1Q9DCR2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3s1Q9DCR2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3s1Q9DCR2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3s1Q9DCR2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3s1Q9DCR2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Ap3s1Q9DCR2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3s1Q9DCR2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3s1Q9DCR2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3s1Q9DCR2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ap3s1Q9DCR2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3s1Q9DCR2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3s1Q9DCR2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3s1Q9DCR2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ap3s1Q9DCR2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3s1Q9DCR2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ap3s1Q9DCR2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3s1Q9DCR2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ap3s1Q9DCR2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3s1Q9DCR2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3s1Q9DCR2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Ap3s1Q9DCR2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3s1Q9DCR2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3s1Q9DCR2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3s1Q9DCR2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ap3s1Q9DCR2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3s1Q9DCR2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3s1Q9DCR2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3s1Q9DCR2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3s1Q9DCR2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3s1Q9DCR2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3s1Q9DCR2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3s1Q9DCR2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ap3s1Q9DCR2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3s1Q9DCR2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3s1Q9DCR2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3s1Q9DCR2 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Ap3s1Q9DCR2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3s1Q9DCR2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Ap3s1Q9DCR2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3s1Q9DCR2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Ap3s1Q9DCR2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms