Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9H3

Mbd3l1, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l1Q9D9H3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Mbd3l1Q9D9H3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,79■■□□□ 1,4
Mbd3l1Q9D9H3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Mbd3l1Q9D9H3 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC23,7■■□□□ 1,38
Mbd3l1Q9D9H3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23,69■■□□□ 1,38
Mbd3l1Q9D9H3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,65■■□□□ 1,38
Mbd3l1Q9D9H3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,63■■□□□ 1,37
Mbd3l1Q9D9H3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,62■■□□□ 1,37
Mbd3l1Q9D9H3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,6■■□□□ 1,37
Mbd3l1Q9D9H3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Mbd3l1Q9D9H3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Mbd3l1Q9D9H3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Mbd3l1Q9D9H3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Mbd3l1Q9D9H3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Mbd3l1Q9D9H3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Mbd3l1Q9D9H3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Mbd3l1Q9D9H3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Mbd3l1Q9D9H3 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC23,41■■□□□ 1,34
Mbd3l1Q9D9H3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23,39■■□□□ 1,33
Mbd3l1Q9D9H3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,38■■□□□ 1,33
Mbd3l1Q9D9H3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,38■■□□□ 1,33
Mbd3l1Q9D9H3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Mbd3l1Q9D9H3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Mbd3l1Q9D9H3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Mbd3l1Q9D9H3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23,3■■□□□ 1,32
Mbd3l1Q9D9H3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Mbd3l1Q9D9H3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Mbd3l1Q9D9H3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Mbd3l1Q9D9H3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Mbd3l1Q9D9H3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Mbd3l1Q9D9H3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Mbd3l1Q9D9H3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Mbd3l1Q9D9H3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Mbd3l1Q9D9H3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Mbd3l1Q9D9H3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Mbd3l1Q9D9H3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Mbd3l1Q9D9H3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,2■■□□□ 1,3
Mbd3l1Q9D9H3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Mbd3l1Q9D9H3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Mbd3l1Q9D9H3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Mbd3l1Q9D9H3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23,14■■□□□ 1,3
Mbd3l1Q9D9H3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Mbd3l1Q9D9H3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,13■■□□□ 1,29
Mbd3l1Q9D9H3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Mbd3l1Q9D9H3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Mbd3l1Q9D9H3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Mbd3l1Q9D9H3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Mbd3l1Q9D9H3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23,1■■□□□ 1,29
Mbd3l1Q9D9H3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Mbd3l1Q9D9H3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,06■■□□□ 1,28
Mbd3l1Q9D9H3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,03■■□□□ 1,28
Mbd3l1Q9D9H3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Mbd3l1Q9D9H3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Mbd3l1Q9D9H3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,99■■□□□ 1,27
Mbd3l1Q9D9H3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,97■■□□□ 1,27
Mbd3l1Q9D9H3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Mbd3l1Q9D9H3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Mbd3l1Q9D9H3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,94■■□□□ 1,26
Mbd3l1Q9D9H3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Mbd3l1Q9D9H3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Mbd3l1Q9D9H3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Mbd3l1Q9D9H3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Mbd3l1Q9D9H3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Mbd3l1Q9D9H3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,91■■□□□ 1,26
Mbd3l1Q9D9H3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Mbd3l1Q9D9H3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Mbd3l1Q9D9H3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,88■■□□□ 1,25
Mbd3l1Q9D9H3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,87■■□□□ 1,25
Mbd3l1Q9D9H3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,87■■□□□ 1,25
Mbd3l1Q9D9H3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22,85■■□□□ 1,25
Mbd3l1Q9D9H3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Mbd3l1Q9D9H3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Mbd3l1Q9D9H3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Mbd3l1Q9D9H3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Mbd3l1Q9D9H3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Mbd3l1Q9D9H3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Mbd3l1Q9D9H3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Mbd3l1Q9D9H3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,81■■□□□ 1,24
Mbd3l1Q9D9H3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Mbd3l1Q9D9H3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Mbd3l1Q9D9H3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22,77■■□□□ 1,24
Mbd3l1Q9D9H3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Mbd3l1Q9D9H3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Mbd3l1Q9D9H3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22,76■■□□□ 1,23
Mbd3l1Q9D9H3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Mbd3l1Q9D9H3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22,75■■□□□ 1,23
Mbd3l1Q9D9H3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Mbd3l1Q9D9H3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Mbd3l1Q9D9H3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,73■■□□□ 1,23
Mbd3l1Q9D9H3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,73■■□□□ 1,23
Mbd3l1Q9D9H3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Mbd3l1Q9D9H3 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Mbd3l1Q9D9H3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22,7■■□□□ 1,22
Mbd3l1Q9D9H3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,68■■□□□ 1,22
Mbd3l1Q9D9H3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22,67■■□□□ 1,22
Mbd3l1Q9D9H3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22,65■■□□□ 1,22
Mbd3l1Q9D9H3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Mbd3l1Q9D9H3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22,65■■□□□ 1,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27,7 ms