Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Snx5Q9D8U8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,17■■□□□ 1,62
Snx5Q9D8U8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Snx5Q9D8U8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Snx5Q9D8U8 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,1■■□□□ 1,61
Snx5Q9D8U8 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Snx5Q9D8U8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25,06■■□□□ 1,6
Snx5Q9D8U8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,03■■□□□ 1,6
Snx5Q9D8U8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24,99■■□□□ 1,59
Snx5Q9D8U8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24,97■■□□□ 1,59
Snx5Q9D8U8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,93■■□□□ 1,58
Snx5Q9D8U8 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,92■■□□□ 1,58
Snx5Q9D8U8 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Snx5Q9D8U8 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24,92■■□□□ 1,58
Snx5Q9D8U8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Snx5Q9D8U8 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Snx5Q9D8U8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Snx5Q9D8U8 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,87■■□□□ 1,57
Snx5Q9D8U8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24,86■■□□□ 1,57
Snx5Q9D8U8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Snx5Q9D8U8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Snx5Q9D8U8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,85■■□□□ 1,57
Snx5Q9D8U8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,83■■□□□ 1,57
Snx5Q9D8U8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Snx5Q9D8U8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Snx5Q9D8U8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Snx5Q9D8U8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24,75■■□□□ 1,55
Snx5Q9D8U8 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24,74■■□□□ 1,55
Snx5Q9D8U8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24,74■■□□□ 1,55
Snx5Q9D8U8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,71■■□□□ 1,55
Snx5Q9D8U8 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,7■■□□□ 1,54
Snx5Q9D8U8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Snx5Q9D8U8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Snx5Q9D8U8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Snx5Q9D8U8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,61■■□□□ 1,53
Snx5Q9D8U8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Snx5Q9D8U8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Snx5Q9D8U8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,56■■□□□ 1,52
Snx5Q9D8U8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Snx5Q9D8U8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Snx5Q9D8U8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,55■■□□□ 1,52
Snx5Q9D8U8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,53■■□□□ 1,52
Snx5Q9D8U8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Snx5Q9D8U8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24,48■■□□□ 1,51
Snx5Q9D8U8 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24,48■■□□□ 1,51
Snx5Q9D8U8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Snx5Q9D8U8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,46■■□□□ 1,51
Snx5Q9D8U8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC24,46■■□□□ 1,51
Snx5Q9D8U8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Snx5Q9D8U8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Snx5Q9D8U8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Snx5Q9D8U8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,5
Snx5Q9D8U8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,44■■□□□ 1,5
Snx5Q9D8U8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,43■■□□□ 1,5
Snx5Q9D8U8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,43■■□□□ 1,5
Snx5Q9D8U8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,41■■□□□ 1,5
Snx5Q9D8U8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Snx5Q9D8U8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,39■■□□□ 1,5
Snx5Q9D8U8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,38■■□□□ 1,49
Snx5Q9D8U8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Snx5Q9D8U8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,36■■□□□ 1,49
Snx5Q9D8U8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,35■■□□□ 1,49
Snx5Q9D8U8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Snx5Q9D8U8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Snx5Q9D8U8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,35■■□□□ 1,49
Snx5Q9D8U8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,34■■□□□ 1,49
Snx5Q9D8U8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,33■■□□□ 1,48
Snx5Q9D8U8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,31■■□□□ 1,48
Snx5Q9D8U8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,3■■□□□ 1,48
Snx5Q9D8U8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,29■■□□□ 1,48
Snx5Q9D8U8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,29■■□□□ 1,48
Snx5Q9D8U8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,28■■□□□ 1,48
Snx5Q9D8U8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,27■■□□□ 1,48
Snx5Q9D8U8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,26■■□□□ 1,47
Snx5Q9D8U8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,21■■□□□ 1,47
Snx5Q9D8U8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,2■■□□□ 1,47
Snx5Q9D8U8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,17■■□□□ 1,46
Snx5Q9D8U8 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Snx5Q9D8U8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,15■■□□□ 1,46
Snx5Q9D8U8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,14■■□□□ 1,45
Snx5Q9D8U8 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,14■■□□□ 1,45
Snx5Q9D8U8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Snx5Q9D8U8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,12■■□□□ 1,45
Snx5Q9D8U8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Snx5Q9D8U8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Snx5Q9D8U8 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Snx5Q9D8U8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Snx5Q9D8U8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Snx5Q9D8U8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Snx5Q9D8U8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Snx5Q9D8U8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Snx5Q9D8U8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,45
Snx5Q9D8U8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
Snx5Q9D8U8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,07■■□□□ 1,44
Snx5Q9D8U8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24,04■■□□□ 1,44
Snx5Q9D8U8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24,03■■□□□ 1,44
Snx5Q9D8U8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24,03■■□□□ 1,44
Snx5Q9D8U8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Snx5Q9D8U8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,02■■□□□ 1,44
Snx5Q9D8U8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,99■■□□□ 1,43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms