Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C2

Tspan13, Tetraspanin-13, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan13Q9D8C2 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,5■□□□□ 0,71
Tspan13Q9D8C2 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,49■□□□□ 0,71
Tspan13Q9D8C2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Tspan13Q9D8C2 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,48■□□□□ 0,71
Tspan13Q9D8C2 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC19,46■□□□□ 0,71
Tspan13Q9D8C2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC19,45■□□□□ 0,7
Tspan13Q9D8C2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC19,45■□□□□ 0,7
Tspan13Q9D8C2 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19,43■□□□□ 0,7
Tspan13Q9D8C2 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,41■□□□□ 0,7
Tspan13Q9D8C2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC19,4■□□□□ 0,7
Tspan13Q9D8C2 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC19,36■□□□□ 0,69
Tspan13Q9D8C2 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19,35■□□□□ 0,69
Tspan13Q9D8C2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19,33■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC19,32■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,32■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,31■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19,31■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,3■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19,3■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19,28■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19,28■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19,27■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19,27■□□□□ 0,68
Tspan13Q9D8C2 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,26■□□□□ 0,67
Tspan13Q9D8C2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19,25■□□□□ 0,67
Tspan13Q9D8C2 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC19,24■□□□□ 0,67
Tspan13Q9D8C2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19,24■□□□□ 0,67
Tspan13Q9D8C2 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19,24■□□□□ 0,67
Tspan13Q9D8C2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Tspan13Q9D8C2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,22■□□□□ 0,67
Tspan13Q9D8C2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Tspan13Q9D8C2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,21■□□□□ 0,67
Tspan13Q9D8C2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Tspan13Q9D8C2 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19,2■□□□□ 0,66
Tspan13Q9D8C2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,19■□□□□ 0,66
Tspan13Q9D8C2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,18■□□□□ 0,66
Tspan13Q9D8C2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19,15■□□□□ 0,66
Tspan13Q9D8C2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,66
Tspan13Q9D8C2 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Tspan13Q9D8C2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19,14■□□□□ 0,65
Tspan13Q9D8C2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19,13■□□□□ 0,65
Tspan13Q9D8C2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19,08■□□□□ 0,64
Tspan13Q9D8C2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,07■□□□□ 0,64
Tspan13Q9D8C2 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,06■□□□□ 0,64
Tspan13Q9D8C2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19,06■□□□□ 0,64
Tspan13Q9D8C2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19,04■□□□□ 0,64
Tspan13Q9D8C2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,63
Tspan13Q9D8C2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,02■□□□□ 0,63
Tspan13Q9D8C2 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19,01■□□□□ 0,63
Tspan13Q9D8C2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC19,01■□□□□ 0,63
Tspan13Q9D8C2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,99■□□□□ 0,63
Tspan13Q9D8C2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18,99■□□□□ 0,63
Tspan13Q9D8C2 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18,97■□□□□ 0,63
Tspan13Q9D8C2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18,96■□□□□ 0,63
Tspan13Q9D8C2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,96■□□□□ 0,63
Tspan13Q9D8C2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,91■□□□□ 0,62
Tspan13Q9D8C2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18,91■□□□□ 0,62
Tspan13Q9D8C2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18,9■□□□□ 0,62
Tspan13Q9D8C2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Tspan13Q9D8C2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Tspan13Q9D8C2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC18,9■□□□□ 0,62
Tspan13Q9D8C2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18,9■□□□□ 0,62
Tspan13Q9D8C2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Tspan13Q9D8C2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Tspan13Q9D8C2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18,89■□□□□ 0,61
Tspan13Q9D8C2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Tspan13Q9D8C2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Tspan13Q9D8C2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,89■□□□□ 0,61
Tspan13Q9D8C2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Tspan13Q9D8C2 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,87■□□□□ 0,61
Tspan13Q9D8C2 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,85■□□□□ 0,61
Tspan13Q9D8C2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18,84■□□□□ 0,61
Tspan13Q9D8C2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Tspan13Q9D8C2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,84■□□□□ 0,61
Tspan13Q9D8C2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,82■□□□□ 0,6
Tspan13Q9D8C2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18,82■□□□□ 0,6
Tspan13Q9D8C2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC18,81■□□□□ 0,6
Tspan13Q9D8C2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,8■□□□□ 0,6
Tspan13Q9D8C2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18,79■□□□□ 0,6
Tspan13Q9D8C2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,79■□□□□ 0,6
Tspan13Q9D8C2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18,78■□□□□ 0,6
Tspan13Q9D8C2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,77■□□□□ 0,6
Tspan13Q9D8C2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Tspan13Q9D8C2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,76■□□□□ 0,59
Tspan13Q9D8C2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Tspan13Q9D8C2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18,75■□□□□ 0,59
Tspan13Q9D8C2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,75■□□□□ 0,59
Tspan13Q9D8C2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Tspan13Q9D8C2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,74■□□□□ 0,59
Tspan13Q9D8C2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18,72■□□□□ 0,59
Tspan13Q9D8C2 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Tspan13Q9D8C2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18,7■□□□□ 0,58
Tspan13Q9D8C2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,7■□□□□ 0,58
Tspan13Q9D8C2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18,69■□□□□ 0,58
Tspan13Q9D8C2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18,67■□□□□ 0,58
Tspan13Q9D8C2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18,66■□□□□ 0,58
Tspan13Q9D8C2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC18,65■□□□□ 0,58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,7 ms