Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Ccdc83Q9D4V3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ccdc83Q9D4V3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,03■■■□□ 2,08
Ccdc83Q9D4V3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ccdc83Q9D4V3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Ccdc83Q9D4V3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ccdc83Q9D4V3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ccdc83Q9D4V3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,96■■■□□ 2,07
Ccdc83Q9D4V3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,95■■■□□ 2,06
Ccdc83Q9D4V3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Ccdc83Q9D4V3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,84■■■□□ 2,05
Ccdc83Q9D4V3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,81■■■□□ 2,04
Ccdc83Q9D4V3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27,79■■■□□ 2,04
Ccdc83Q9D4V3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Ccdc83Q9D4V3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,74■■■□□ 2,03
Ccdc83Q9D4V3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,69■■■□□ 2,02
Ccdc83Q9D4V3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ccdc83Q9D4V3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27,68■■■□□ 2,02
Ccdc83Q9D4V3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,64■■■□□ 2,02
Ccdc83Q9D4V3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,63■■■□□ 2,01
Ccdc83Q9D4V3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,6■■■□□ 2,01
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27,59■■■□□ 2,01
Ccdc83Q9D4V3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,58■■■□□ 2,01
Ccdc83Q9D4V3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,55■■■□□ 2
Ccdc83Q9D4V3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27,53■■■□□ 2
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ccdc83Q9D4V3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,52■■■□□ 2
Ccdc83Q9D4V3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27,5■■□□□ 1,99
Ccdc83Q9D4V3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,48■■□□□ 1,99
Ccdc83Q9D4V3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,47■■□□□ 1,99
Ccdc83Q9D4V3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,45■■□□□ 1,99
Ccdc83Q9D4V3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ccdc83Q9D4V3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ccdc83Q9D4V3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,42■■□□□ 1,98
Ccdc83Q9D4V3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc83Q9D4V3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,41■■□□□ 1,98
Ccdc83Q9D4V3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ccdc83Q9D4V3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,38■■□□□ 1,97
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27,36■■□□□ 1,97
Ccdc83Q9D4V3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27,35■■□□□ 1,97
Ccdc83Q9D4V3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27,34■■□□□ 1,97
Ccdc83Q9D4V3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,32■■□□□ 1,96
Ccdc83Q9D4V3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,31■■□□□ 1,96
Ccdc83Q9D4V3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,29■■□□□ 1,96
Ccdc83Q9D4V3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ccdc83Q9D4V3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ccdc83Q9D4V3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,28■■□□□ 1,96
Ccdc83Q9D4V3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,26■■□□□ 1,96
Ccdc83Q9D4V3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,24■■□□□ 1,95
Ccdc83Q9D4V3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27,23■■□□□ 1,95
Ccdc83Q9D4V3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27,21■■□□□ 1,95
Ccdc83Q9D4V3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Ccdc83Q9D4V3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
Ccdc83Q9D4V3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Ccdc83Q9D4V3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Ccdc83Q9D4V3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Ccdc83Q9D4V3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Ccdc83Q9D4V3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Ccdc83Q9D4V3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Ccdc83Q9D4V3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Ccdc83Q9D4V3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Ccdc83Q9D4V3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,08■■□□□ 1,93
Ccdc83Q9D4V3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Ccdc83Q9D4V3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27,04■■□□□ 1,92
Ccdc83Q9D4V3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ccdc83Q9D4V3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Ccdc83Q9D4V3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Ccdc83Q9D4V3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Ccdc83Q9D4V3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,96■■□□□ 1,91
Ccdc83Q9D4V3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,91
Ccdc83Q9D4V3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Ccdc83Q9D4V3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ccdc83Q9D4V3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26,92■■□□□ 1,9
Ccdc83Q9D4V3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ccdc83Q9D4V3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,91■■□□□ 1,9
Ccdc83Q9D4V3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,89■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26,88■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26,86■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,86■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Ccdc83Q9D4V3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc83Q9D4V3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,8■■□□□ 1,88
Ccdc83Q9D4V3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,79■■□□□ 1,88
Ccdc83Q9D4V3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26,78■■□□□ 1,88
Ccdc83Q9D4V3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,88
Ccdc83Q9D4V3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Ccdc83Q9D4V3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Ccdc83Q9D4V3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms