Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc83Q9D4V3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc83Q9D4V3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Ccdc83Q9D4V3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc83Q9D4V3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc83Q9D4V3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc83Q9D4V3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc83Q9D4V3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc83Q9D4V3 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc83Q9D4V3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc83Q9D4V3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Ccdc83Q9D4V3 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Ccdc83Q9D4V3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc83Q9D4V3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc83Q9D4V3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Ccdc83Q9D4V3 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc83Q9D4V3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc83Q9D4V3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Ccdc83Q9D4V3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Ccdc83Q9D4V3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Ccdc83Q9D4V3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Ccdc83Q9D4V3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Ccdc83Q9D4V3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Ccdc83Q9D4V3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc83Q9D4V3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.53■■■□□ 2
Ccdc83Q9D4V3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc83Q9D4V3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Ccdc83Q9D4V3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Ccdc83Q9D4V3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc83Q9D4V3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Ccdc83Q9D4V3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Ccdc83Q9D4V3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc83Q9D4V3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc83Q9D4V3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc83Q9D4V3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc83Q9D4V3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc83Q9D4V3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc83Q9D4V3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc83Q9D4V3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Ccdc83Q9D4V3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Ccdc83Q9D4V3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ccdc83Q9D4V3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ccdc83Q9D4V3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ccdc83Q9D4V3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc83Q9D4V3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc83Q9D4V3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ccdc83Q9D4V3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ccdc83Q9D4V3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ccdc83Q9D4V3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ccdc83Q9D4V3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc83Q9D4V3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ccdc83Q9D4V3 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc83Q9D4V3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ccdc83Q9D4V3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc83Q9D4V3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ccdc83Q9D4V3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ccdc83Q9D4V3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ccdc83Q9D4V3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ccdc83Q9D4V3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Ccdc83Q9D4V3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc83Q9D4V3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ccdc83Q9D4V3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc83Q9D4V3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ccdc83Q9D4V3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc83Q9D4V3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc83Q9D4V3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc83Q9D4V3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc83Q9D4V3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc83Q9D4V3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc83Q9D4V3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ccdc83Q9D4V3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ccdc83Q9D4V3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc83Q9D4V3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ccdc83Q9D4V3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc83Q9D4V3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ccdc83Q9D4V3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc83Q9D4V3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc83Q9D4V3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Ccdc83Q9D4V3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc83Q9D4V3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc83Q9D4V3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc83Q9D4V3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ccdc83Q9D4V3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ccdc83Q9D4V3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ccdc83Q9D4V3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms