Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2X6

Sval1, Colon SVA-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sval1Q9D2X6 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sval1Q9D2X6 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Sval1Q9D2X6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Sval1Q9D2X6 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Sval1Q9D2X6 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Sval1Q9D2X6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Sval1Q9D2X6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Sval1Q9D2X6 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Sval1Q9D2X6 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Sval1Q9D2X6 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sval1Q9D2X6 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Sval1Q9D2X6 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Sval1Q9D2X6 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Sval1Q9D2X6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sval1Q9D2X6 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Sval1Q9D2X6 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sval1Q9D2X6 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Sval1Q9D2X6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Sval1Q9D2X6 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sval1Q9D2X6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sval1Q9D2X6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Sval1Q9D2X6 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Sval1Q9D2X6 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sval1Q9D2X6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Sval1Q9D2X6 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Sval1Q9D2X6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Sval1Q9D2X6 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Sval1Q9D2X6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sval1Q9D2X6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Sval1Q9D2X6 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sval1Q9D2X6 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Sval1Q9D2X6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sval1Q9D2X6 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Sval1Q9D2X6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Sval1Q9D2X6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Sval1Q9D2X6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sval1Q9D2X6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sval1Q9D2X6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Sval1Q9D2X6 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Sval1Q9D2X6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Sval1Q9D2X6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Sval1Q9D2X6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Sval1Q9D2X6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Sval1Q9D2X6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sval1Q9D2X6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sval1Q9D2X6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Sval1Q9D2X6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sval1Q9D2X6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Sval1Q9D2X6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Sval1Q9D2X6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Sval1Q9D2X6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Sval1Q9D2X6 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Sval1Q9D2X6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Sval1Q9D2X6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Sval1Q9D2X6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Sval1Q9D2X6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Sval1Q9D2X6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Sval1Q9D2X6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Sval1Q9D2X6 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Sval1Q9D2X6 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Sval1Q9D2X6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sval1Q9D2X6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Sval1Q9D2X6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Sval1Q9D2X6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Sval1Q9D2X6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Sval1Q9D2X6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sval1Q9D2X6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Sval1Q9D2X6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Sval1Q9D2X6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sval1Q9D2X6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Sval1Q9D2X6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sval1Q9D2X6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sval1Q9D2X6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sval1Q9D2X6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Sval1Q9D2X6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sval1Q9D2X6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Sval1Q9D2X6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sval1Q9D2X6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Sval1Q9D2X6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Sval1Q9D2X6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Sval1Q9D2X6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Sval1Q9D2X6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Sval1Q9D2X6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sval1Q9D2X6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sval1Q9D2X6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sval1Q9D2X6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Sval1Q9D2X6 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sval1Q9D2X6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sval1Q9D2X6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sval1Q9D2X6 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sval1Q9D2X6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sval1Q9D2X6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sval1Q9D2X6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Sval1Q9D2X6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sval1Q9D2X6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sval1Q9D2X6 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Sval1Q9D2X6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sval1Q9D2X6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sval1Q9D2X6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sval1Q9D2X6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms