Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZT8

Rab3b, Ras-related protein Rab-3B, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3bQ9CZT8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24,16■■□□□ 1,46
Rab3bQ9CZT8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,11■■□□□ 1,45
Rab3bQ9CZT8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24,1■■□□□ 1,45
Rab3bQ9CZT8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,09■■□□□ 1,45
Rab3bQ9CZT8 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,08■■□□□ 1,44
Rab3bQ9CZT8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24,01■■□□□ 1,43
Rab3bQ9CZT8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1,43
Rab3bQ9CZT8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,98■■□□□ 1,43
Rab3bQ9CZT8 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,94■■□□□ 1,42
Rab3bQ9CZT8 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,93■■□□□ 1,42
Rab3bQ9CZT8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,89■■□□□ 1,42
Rab3bQ9CZT8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Rab3bQ9CZT8 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,88■■□□□ 1,41
Rab3bQ9CZT8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,88■■□□□ 1,41
Rab3bQ9CZT8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,87■■□□□ 1,41
Rab3bQ9CZT8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,85■■□□□ 1,41
Rab3bQ9CZT8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,82■■□□□ 1,4
Rab3bQ9CZT8 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,78■■□□□ 1,4
Rab3bQ9CZT8 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Rab3bQ9CZT8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,75■■□□□ 1,39
Rab3bQ9CZT8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23,74■■□□□ 1,39
Rab3bQ9CZT8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23,73■■□□□ 1,39
Rab3bQ9CZT8 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,71■■□□□ 1,39
Rab3bQ9CZT8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23,68■■□□□ 1,38
Rab3bQ9CZT8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,66■■□□□ 1,38
Rab3bQ9CZT8 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23,63■■□□□ 1,37
Rab3bQ9CZT8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23,61■■□□□ 1,37
Rab3bQ9CZT8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23,6■■□□□ 1,37
Rab3bQ9CZT8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Rab3bQ9CZT8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Rab3bQ9CZT8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,45■■□□□ 1,34
Rab3bQ9CZT8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,44■■□□□ 1,34
Rab3bQ9CZT8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Rab3bQ9CZT8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Rab3bQ9CZT8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Rab3bQ9CZT8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Rab3bQ9CZT8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23,42■■□□□ 1,34
Rab3bQ9CZT8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Rab3bQ9CZT8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Rab3bQ9CZT8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Rab3bQ9CZT8 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23,39■■□□□ 1,34
Rab3bQ9CZT8 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Rab3bQ9CZT8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Rab3bQ9CZT8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23,35■■□□□ 1,33
Rab3bQ9CZT8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23,34■■□□□ 1,33
Rab3bQ9CZT8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,32
Rab3bQ9CZT8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Rab3bQ9CZT8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Rab3bQ9CZT8 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Rab3bQ9CZT8 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Rab3bQ9CZT8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Rab3bQ9CZT8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Rab3bQ9CZT8 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Rab3bQ9CZT8 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Rab3bQ9CZT8 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,23■■□□□ 1,31
Rab3bQ9CZT8 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Rab3bQ9CZT8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Rab3bQ9CZT8 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Rab3bQ9CZT8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,17■■□□□ 1,3
Rab3bQ9CZT8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23,16■■□□□ 1,3
Rab3bQ9CZT8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Rab3bQ9CZT8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Rab3bQ9CZT8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Rab3bQ9CZT8 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23,14■■□□□ 1,29
Rab3bQ9CZT8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Rab3bQ9CZT8 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Rab3bQ9CZT8 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Rab3bQ9CZT8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Rab3bQ9CZT8 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Rab3bQ9CZT8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,09■■□□□ 1,29
Rab3bQ9CZT8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Rab3bQ9CZT8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Rab3bQ9CZT8 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Rab3bQ9CZT8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23,05■■□□□ 1,28
Rab3bQ9CZT8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23,05■■□□□ 1,28
Rab3bQ9CZT8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Rab3bQ9CZT8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Rab3bQ9CZT8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Rab3bQ9CZT8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Rab3bQ9CZT8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,02■■□□□ 1,28
Rab3bQ9CZT8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Rab3bQ9CZT8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Rab3bQ9CZT8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Rab3bQ9CZT8 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1,27
Rab3bQ9CZT8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22,98■■□□□ 1,27
Rab3bQ9CZT8 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,98■■□□□ 1,27
Rab3bQ9CZT8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22,97■■□□□ 1,27
Rab3bQ9CZT8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,96■■□□□ 1,27
Rab3bQ9CZT8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Rab3bQ9CZT8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,95■■□□□ 1,26
Rab3bQ9CZT8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,95■■□□□ 1,26
Rab3bQ9CZT8 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,9■■□□□ 1,26
Rab3bQ9CZT8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22,9■■□□□ 1,26
Rab3bQ9CZT8 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,25
Rab3bQ9CZT8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22,88■■□□□ 1,25
Rab3bQ9CZT8 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,87■■□□□ 1,25
Rab3bQ9CZT8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,86■■□□□ 1,25
Rab3bQ9CZT8 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,84■■□□□ 1,25
Rab3bQ9CZT8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,25
Rab3bQ9CZT8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,82■■□□□ 1,24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,4 ms