Protein–RNA interactions for Protein: Q9CS84

Nrxn1, Neurexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn1Q9CS84 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38.73■■■■□ 3.79
Nrxn1Q9CS84 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.71■■■■□ 3.79
Nrxn1Q9CS84 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC38.65■■■■□ 3.78
Nrxn1Q9CS84 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.61■■■■□ 3.77
Nrxn1Q9CS84 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.58■■■■□ 3.77
Nrxn1Q9CS84 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.55■■■■□ 3.76
Nrxn1Q9CS84 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.55■■■■□ 3.76
Nrxn1Q9CS84 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38.48■■■■□ 3.75
Nrxn1Q9CS84 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.47■■■■□ 3.75
Nrxn1Q9CS84 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38.45■■■■□ 3.75
Nrxn1Q9CS84 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
Nrxn1Q9CS84 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
Nrxn1Q9CS84 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
Nrxn1Q9CS84 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
Nrxn1Q9CS84 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.74
Nrxn1Q9CS84 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
Nrxn1Q9CS84 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
Nrxn1Q9CS84 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.27■■■■□ 3.72
Nrxn1Q9CS84 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38.25■■■■□ 3.71
Nrxn1Q9CS84 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
Nrxn1Q9CS84 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Nrxn1Q9CS84 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.12■■■■□ 3.69
Nrxn1Q9CS84 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
Nrxn1Q9CS84 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.1■■■■□ 3.69
Nrxn1Q9CS84 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Nrxn1Q9CS84 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.98■■■■□ 3.67
Nrxn1Q9CS84 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Nrxn1Q9CS84 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
Nrxn1Q9CS84 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
Nrxn1Q9CS84 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.81■■■■□ 3.64
Nrxn1Q9CS84 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Nrxn1Q9CS84 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
Nrxn1Q9CS84 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.64
Nrxn1Q9CS84 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37.75■■■■□ 3.63
Nrxn1Q9CS84 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.73■■■■□ 3.63
Nrxn1Q9CS84 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Nrxn1Q9CS84 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Nrxn1Q9CS84 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Nrxn1Q9CS84 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Nrxn1Q9CS84 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.68■■■■□ 3.62
Nrxn1Q9CS84 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Nrxn1Q9CS84 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
Nrxn1Q9CS84 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.61■■■■□ 3.61
Nrxn1Q9CS84 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.6■■■■□ 3.61
Nrxn1Q9CS84 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.59■■■■□ 3.61
Nrxn1Q9CS84 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.56■■■■□ 3.6
Nrxn1Q9CS84 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.55■■■■□ 3.6
Nrxn1Q9CS84 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Nrxn1Q9CS84 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Nrxn1Q9CS84 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Nrxn1Q9CS84 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Nrxn1Q9CS84 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Nrxn1Q9CS84 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Nrxn1Q9CS84 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Nrxn1Q9CS84 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37.35■■■■□ 3.57
Nrxn1Q9CS84 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.32■■■■□ 3.57
Nrxn1Q9CS84 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Nrxn1Q9CS84 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Nrxn1Q9CS84 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
Nrxn1Q9CS84 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Nrxn1Q9CS84 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Nrxn1Q9CS84 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Nrxn1Q9CS84 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Nrxn1Q9CS84 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Nrxn1Q9CS84 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Nrxn1Q9CS84 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
Nrxn1Q9CS84 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Nrxn1Q9CS84 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Nrxn1Q9CS84 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Nrxn1Q9CS84 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37.13■■■■□ 3.53
Nrxn1Q9CS84 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37.09■■■■□ 3.53
Nrxn1Q9CS84 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
Nrxn1Q9CS84 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Nrxn1Q9CS84 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
Nrxn1Q9CS84 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Nrxn1Q9CS84 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.52
Nrxn1Q9CS84 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
Nrxn1Q9CS84 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
Nrxn1Q9CS84 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
Nrxn1Q9CS84 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Nrxn1Q9CS84 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
Nrxn1Q9CS84 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.88■■■■□ 3.49
Nrxn1Q9CS84 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.83■■■■□ 3.49
Nrxn1Q9CS84 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC36.75■■■■□ 3.47
Nrxn1Q9CS84 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Nrxn1Q9CS84 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
Nrxn1Q9CS84 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
Nrxn1Q9CS84 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
Nrxn1Q9CS84 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
Nrxn1Q9CS84 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
Nrxn1Q9CS84 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
Nrxn1Q9CS84 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Nrxn1Q9CS84 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
Nrxn1Q9CS84 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Nrxn1Q9CS84 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Nrxn1Q9CS84 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
Nrxn1Q9CS84 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Nrxn1Q9CS84 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.58■■■■□ 3.45
Nrxn1Q9CS84 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Nrxn1Q9CS84 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms