Protein–RNA interactions for Protein: Q923E4

Sirt1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sirt1Q923E4 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,88■■■■□ 3,82
Sirt1Q923E4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38,83■■■■□ 3,81
Sirt1Q923E4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,83■■■■□ 3,81
Sirt1Q923E4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Sirt1Q923E4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
Sirt1Q923E4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC38,72■■■■□ 3,79
Sirt1Q923E4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38,67■■■■□ 3,78
Sirt1Q923E4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,66■■■■□ 3,78
Sirt1Q923E4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC38,65■■■■□ 3,78
Sirt1Q923E4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC38,63■■■■□ 3,77
Sirt1Q923E4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38,62■■■■□ 3,77
Sirt1Q923E4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,6■■■■□ 3,77
Sirt1Q923E4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,55■■■■□ 3,76
Sirt1Q923E4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38,49■■■■□ 3,75
Sirt1Q923E4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
Sirt1Q923E4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
Sirt1Q923E4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,39■■■■□ 3,74
Sirt1Q923E4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38,34■■■■□ 3,73
Sirt1Q923E4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,28■■■■□ 3,72
Sirt1Q923E4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Sirt1Q923E4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Sirt1Q923E4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Sirt1Q923E4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC38,15■■■■□ 3,7
Sirt1Q923E4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC38,14■■■■□ 3,7
Sirt1Q923E4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC38,12■■■■□ 3,69
Sirt1Q923E4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
Sirt1Q923E4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38,07■■■■□ 3,69
Sirt1Q923E4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Sirt1Q923E4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Sirt1Q923E4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37,96■■■■□ 3,67
Sirt1Q923E4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Sirt1Q923E4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37,94■■■■□ 3,66
Sirt1Q923E4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37,93■■■■□ 3,66
Sirt1Q923E4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,87■■■■□ 3,65
Sirt1Q923E4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Sirt1Q923E4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37,81■■■■□ 3,64
Sirt1Q923E4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37,8■■■■□ 3,64
Sirt1Q923E4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Sirt1Q923E4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Sirt1Q923E4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37,76■■■■□ 3,64
Sirt1Q923E4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Sirt1Q923E4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Sirt1Q923E4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Sirt1Q923E4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Sirt1Q923E4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC37,71■■■■□ 3,63
Sirt1Q923E4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37,69■■■■□ 3,62
Sirt1Q923E4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37,69■■■■□ 3,62
Sirt1Q923E4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC37,68■■■■□ 3,62
Sirt1Q923E4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC37,67■■■■□ 3,62
Sirt1Q923E4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
Sirt1Q923E4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Sirt1Q923E4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37,55■■■■□ 3,6
Sirt1Q923E4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,54■■■■□ 3,6
Sirt1Q923E4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,51■■■■□ 3,59
Sirt1Q923E4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Sirt1Q923E4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,46■■■■□ 3,59
Sirt1Q923E4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,46■■■■□ 3,59
Sirt1Q923E4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Sirt1Q923E4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37,45■■■■□ 3,59
Sirt1Q923E4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Sirt1Q923E4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Sirt1Q923E4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC37,35■■■■□ 3,57
Sirt1Q923E4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Sirt1Q923E4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC37,29■■■■□ 3,56
Sirt1Q923E4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Sirt1Q923E4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Sirt1Q923E4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Sirt1Q923E4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,23■■■■□ 3,55
Sirt1Q923E4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC37,22■■■■□ 3,55
Sirt1Q923E4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC37,2■■■■□ 3,55
Sirt1Q923E4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,17■■■■□ 3,54
Sirt1Q923E4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC37,17■■■■□ 3,54
Sirt1Q923E4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC37,08■■■■□ 3,53
Sirt1Q923E4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,03■■■■□ 3,52
Sirt1Q923E4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC37,01■■■■□ 3,52
Sirt1Q923E4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Sirt1Q923E4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Sirt1Q923E4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36,97■■■■□ 3,51
Sirt1Q923E4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36,96■■■■□ 3,51
Sirt1Q923E4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Sirt1Q923E4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36,94■■■■□ 3,5
Sirt1Q923E4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36,92■■■■□ 3,5
Sirt1Q923E4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,91■■■■□ 3,5
Sirt1Q923E4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36,88■■■■□ 3,49
Sirt1Q923E4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36,85■■■■□ 3,49
Sirt1Q923E4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Sirt1Q923E4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,49
Sirt1Q923E4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36,81■■■■□ 3,48
Sirt1Q923E4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36,81■■■■□ 3,48
Sirt1Q923E4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,8■■■■□ 3,48
Sirt1Q923E4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36,8■■■■□ 3,48
Sirt1Q923E4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,78■■■■□ 3,48
Sirt1Q923E4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Sirt1Q923E4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,76■■■■□ 3,48
Sirt1Q923E4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Sirt1Q923E4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36,72■■■■□ 3,47
Sirt1Q923E4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36,72■■■■□ 3,47
Sirt1Q923E4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36,72■■■■□ 3,47
Sirt1Q923E4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36,69■■■■□ 3,46
Sirt1Q923E4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36,66■■■■□ 3,46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms