Protein–RNA interactions for Protein: Q920N7

Syt12, Synaptotagmin-12, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt12Q920N7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29,25■■■□□ 2,27
Syt12Q920N7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,19■■■□□ 2,26
Syt12Q920N7 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Syt12Q920N7 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,18■■■□□ 2,26
Syt12Q920N7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29,16■■■□□ 2,26
Syt12Q920N7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29,15■■■□□ 2,26
Syt12Q920N7 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,14■■■□□ 2,25
Syt12Q920N7 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,08■■■□□ 2,25
Syt12Q920N7 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,06■■■□□ 2,24
Syt12Q920N7 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Syt12Q920N7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC29,03■■■□□ 2,24
Syt12Q920N7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,03■■■□□ 2,24
Syt12Q920N7 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,99■■■□□ 2,23
Syt12Q920N7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,97■■■□□ 2,23
Syt12Q920N7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,93■■■□□ 2,22
Syt12Q920N7 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,91■■■□□ 2,22
Syt12Q920N7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,9■■■□□ 2,22
Syt12Q920N7 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,87■■■□□ 2,21
Syt12Q920N7 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28,81■■■□□ 2,2
Syt12Q920N7 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28,8■■■□□ 2,2
Syt12Q920N7 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28,78■■■□□ 2,2
Syt12Q920N7 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28,74■■■□□ 2,19
Syt12Q920N7 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,72■■■□□ 2,19
Syt12Q920N7 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,71■■■□□ 2,19
Syt12Q920N7 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28,71■■■□□ 2,19
Syt12Q920N7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,68■■■□□ 2,18
Syt12Q920N7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28,66■■■□□ 2,18
Syt12Q920N7 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28,65■■■□□ 2,18
Syt12Q920N7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28,65■■■□□ 2,18
Syt12Q920N7 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,63■■■□□ 2,17
Syt12Q920N7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,61■■■□□ 2,17
Syt12Q920N7 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Syt12Q920N7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28,61■■■□□ 2,17
Syt12Q920N7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Syt12Q920N7 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28,59■■■□□ 2,17
Syt12Q920N7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,57■■■□□ 2,16
Syt12Q920N7 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28,54■■■□□ 2,16
Syt12Q920N7 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,52■■■□□ 2,16
Syt12Q920N7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28,52■■■□□ 2,16
Syt12Q920N7 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28,52■■■□□ 2,16
Syt12Q920N7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,49■■■□□ 2,15
Syt12Q920N7 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,45■■■□□ 2,14
Syt12Q920N7 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28,44■■■□□ 2,14
Syt12Q920N7 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Syt12Q920N7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28,41■■■□□ 2,14
Syt12Q920N7 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28,39■■■□□ 2,14
Syt12Q920N7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28,38■■■□□ 2,13
Syt12Q920N7 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,37■■■□□ 2,13
Syt12Q920N7 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28,35■■■□□ 2,13
Syt12Q920N7 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28,33■■■□□ 2,13
Syt12Q920N7 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28,32■■■□□ 2,12
Syt12Q920N7 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,31■■■□□ 2,12
Syt12Q920N7 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Syt12Q920N7 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28,3■■■□□ 2,12
Syt12Q920N7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28,29■■■□□ 2,12
Syt12Q920N7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28,28■■■□□ 2,12
Syt12Q920N7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28,26■■■□□ 2,11
Syt12Q920N7 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28,21■■■□□ 2,11
Syt12Q920N7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28,19■■■□□ 2,1
Syt12Q920N7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28,19■■■□□ 2,1
Syt12Q920N7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28,17■■■□□ 2,1
Syt12Q920N7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,16■■■□□ 2,1
Syt12Q920N7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC28,13■■■□□ 2,09
Syt12Q920N7 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28,12■■■□□ 2,09
Syt12Q920N7 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,1■■■□□ 2,09
Syt12Q920N7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28,08■■■□□ 2,09
Syt12Q920N7 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Syt12Q920N7 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,04■■■□□ 2,08
Syt12Q920N7 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28,02■■■□□ 2,08
Syt12Q920N7 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27,98■■■□□ 2,07
Syt12Q920N7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Syt12Q920N7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27,98■■■□□ 2,07
Syt12Q920N7 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,97■■■□□ 2,07
Syt12Q920N7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27,94■■■□□ 2,06
Syt12Q920N7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,94■■■□□ 2,06
Syt12Q920N7 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,92■■■□□ 2,06
Syt12Q920N7 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,91■■■□□ 2,06
Syt12Q920N7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,89■■■□□ 2,06
Syt12Q920N7 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,89■■■□□ 2,06
Syt12Q920N7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27,86■■■□□ 2,05
Syt12Q920N7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,85■■■□□ 2,05
Syt12Q920N7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27,85■■■□□ 2,05
Syt12Q920N7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Syt12Q920N7 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27,83■■■□□ 2,05
Syt12Q920N7 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Syt12Q920N7 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27,83■■■□□ 2,05
Syt12Q920N7 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27,81■■■□□ 2,04
Syt12Q920N7 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27,8■■■□□ 2,04
Syt12Q920N7 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27,79■■■□□ 2,04
Syt12Q920N7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Syt12Q920N7 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,78■■■□□ 2,04
Syt12Q920N7 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27,77■■■□□ 2,04
Syt12Q920N7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,75■■■□□ 2,03
Syt12Q920N7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27,73■■■□□ 2,03
Syt12Q920N7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27,72■■■□□ 2,03
Syt12Q920N7 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,72■■■□□ 2,03
Syt12Q920N7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27,72■■■□□ 2,03
Syt12Q920N7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Syt12Q920N7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27,71■■■□□ 2,03
Syt12Q920N7 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,7■■■□□ 2,02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms