Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDK3

Elf5, ETS-related transcription factor Elf-5, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Elf5Q8VDK3 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Elf5Q8VDK3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Elf5Q8VDK3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Elf5Q8VDK3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Elf5Q8VDK3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Elf5Q8VDK3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Elf5Q8VDK3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Elf5Q8VDK3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Elf5Q8VDK3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Elf5Q8VDK3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Elf5Q8VDK3 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Elf5Q8VDK3 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Elf5Q8VDK3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Elf5Q8VDK3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Elf5Q8VDK3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Elf5Q8VDK3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Elf5Q8VDK3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Elf5Q8VDK3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Elf5Q8VDK3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Elf5Q8VDK3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Elf5Q8VDK3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Elf5Q8VDK3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Elf5Q8VDK3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Elf5Q8VDK3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Elf5Q8VDK3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Elf5Q8VDK3 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Elf5Q8VDK3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Elf5Q8VDK3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Elf5Q8VDK3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Elf5Q8VDK3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Elf5Q8VDK3 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Elf5Q8VDK3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Elf5Q8VDK3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Elf5Q8VDK3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Elf5Q8VDK3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Elf5Q8VDK3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Elf5Q8VDK3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Elf5Q8VDK3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Elf5Q8VDK3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Elf5Q8VDK3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Elf5Q8VDK3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Elf5Q8VDK3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Elf5Q8VDK3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Elf5Q8VDK3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Elf5Q8VDK3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Elf5Q8VDK3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Elf5Q8VDK3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Elf5Q8VDK3 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Elf5Q8VDK3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Elf5Q8VDK3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Elf5Q8VDK3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Elf5Q8VDK3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Elf5Q8VDK3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Elf5Q8VDK3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Elf5Q8VDK3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Elf5Q8VDK3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Elf5Q8VDK3 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Elf5Q8VDK3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Elf5Q8VDK3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Elf5Q8VDK3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Elf5Q8VDK3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Elf5Q8VDK3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Elf5Q8VDK3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Elf5Q8VDK3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Elf5Q8VDK3 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Elf5Q8VDK3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Elf5Q8VDK3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Elf5Q8VDK3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Elf5Q8VDK3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Elf5Q8VDK3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Elf5Q8VDK3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Elf5Q8VDK3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Elf5Q8VDK3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Elf5Q8VDK3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Elf5Q8VDK3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Elf5Q8VDK3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Elf5Q8VDK3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Elf5Q8VDK3 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Elf5Q8VDK3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Elf5Q8VDK3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Elf5Q8VDK3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Elf5Q8VDK3 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Elf5Q8VDK3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Elf5Q8VDK3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Elf5Q8VDK3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Elf5Q8VDK3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Elf5Q8VDK3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Elf5Q8VDK3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Elf5Q8VDK3 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Elf5Q8VDK3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Elf5Q8VDK3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Elf5Q8VDK3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Elf5Q8VDK3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Elf5Q8VDK3 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Elf5Q8VDK3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Elf5Q8VDK3 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Elf5Q8VDK3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Elf5Q8VDK3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Elf5Q8VDK3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Elf5Q8VDK3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms