Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2U2

Nepro, Nucleolus and neural progenitor protein, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NeproQ8R2U2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
NeproQ8R2U2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
NeproQ8R2U2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
NeproQ8R2U2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
NeproQ8R2U2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NeproQ8R2U2 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
NeproQ8R2U2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NeproQ8R2U2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
NeproQ8R2U2 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
NeproQ8R2U2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
NeproQ8R2U2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
NeproQ8R2U2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
NeproQ8R2U2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.66■■■□□ 2.18
NeproQ8R2U2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
NeproQ8R2U2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
NeproQ8R2U2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
NeproQ8R2U2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
NeproQ8R2U2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
NeproQ8R2U2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
NeproQ8R2U2 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
NeproQ8R2U2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
NeproQ8R2U2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
NeproQ8R2U2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
NeproQ8R2U2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
NeproQ8R2U2 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
NeproQ8R2U2 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
NeproQ8R2U2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
NeproQ8R2U2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
NeproQ8R2U2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
NeproQ8R2U2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
NeproQ8R2U2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NeproQ8R2U2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
NeproQ8R2U2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
NeproQ8R2U2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NeproQ8R2U2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
NeproQ8R2U2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
NeproQ8R2U2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
NeproQ8R2U2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NeproQ8R2U2 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
NeproQ8R2U2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
NeproQ8R2U2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
NeproQ8R2U2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
NeproQ8R2U2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NeproQ8R2U2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NeproQ8R2U2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
NeproQ8R2U2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
NeproQ8R2U2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
NeproQ8R2U2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
NeproQ8R2U2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
NeproQ8R2U2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
NeproQ8R2U2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
NeproQ8R2U2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
NeproQ8R2U2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
NeproQ8R2U2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
NeproQ8R2U2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
NeproQ8R2U2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
NeproQ8R2U2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
NeproQ8R2U2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
NeproQ8R2U2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NeproQ8R2U2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
NeproQ8R2U2 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
NeproQ8R2U2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
NeproQ8R2U2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
NeproQ8R2U2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
NeproQ8R2U2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
NeproQ8R2U2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
NeproQ8R2U2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
NeproQ8R2U2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
NeproQ8R2U2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
NeproQ8R2U2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
NeproQ8R2U2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
NeproQ8R2U2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
NeproQ8R2U2 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
NeproQ8R2U2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NeproQ8R2U2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NeproQ8R2U2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
NeproQ8R2U2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
NeproQ8R2U2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
NeproQ8R2U2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
NeproQ8R2U2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
NeproQ8R2U2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
NeproQ8R2U2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.01
NeproQ8R2U2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
NeproQ8R2U2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NeproQ8R2U2 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NeproQ8R2U2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NeproQ8R2U2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NeproQ8R2U2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
NeproQ8R2U2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
NeproQ8R2U2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
NeproQ8R2U2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NeproQ8R2U2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
NeproQ8R2U2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
NeproQ8R2U2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
NeproQ8R2U2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
NeproQ8R2U2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
NeproQ8R2U2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
NeproQ8R2U2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NeproQ8R2U2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
NeproQ8R2U2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms