Protein–RNA interactions for Protein: Q8R105

Vps37c, Vacuolar protein sorting-associated protein 37C, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps37cQ8R105 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Vps37cQ8R105 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Vps37cQ8R105 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Vps37cQ8R105 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Vps37cQ8R105 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Vps37cQ8R105 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Vps37cQ8R105 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Vps37cQ8R105 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Vps37cQ8R105 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Vps37cQ8R105 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Vps37cQ8R105 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Vps37cQ8R105 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Vps37cQ8R105 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Vps37cQ8R105 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps37cQ8R105 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Vps37cQ8R105 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Vps37cQ8R105 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps37cQ8R105 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Vps37cQ8R105 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Vps37cQ8R105 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Vps37cQ8R105 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Vps37cQ8R105 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Vps37cQ8R105 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Vps37cQ8R105 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps37cQ8R105 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps37cQ8R105 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Vps37cQ8R105 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Vps37cQ8R105 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Vps37cQ8R105 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Vps37cQ8R105 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Vps37cQ8R105 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Vps37cQ8R105 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Vps37cQ8R105 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Vps37cQ8R105 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Vps37cQ8R105 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Vps37cQ8R105 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Vps37cQ8R105 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps37cQ8R105 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps37cQ8R105 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Vps37cQ8R105 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps37cQ8R105 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps37cQ8R105 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Vps37cQ8R105 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Vps37cQ8R105 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Vps37cQ8R105 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Vps37cQ8R105 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps37cQ8R105 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Vps37cQ8R105 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Vps37cQ8R105 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Vps37cQ8R105 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Vps37cQ8R105 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
Vps37cQ8R105 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Vps37cQ8R105 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps37cQ8R105 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Vps37cQ8R105 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Vps37cQ8R105 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps37cQ8R105 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps37cQ8R105 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vps37cQ8R105 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.64■■□□□ 1.85
Vps37cQ8R105 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vps37cQ8R105 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps37cQ8R105 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps37cQ8R105 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps37cQ8R105 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Vps37cQ8R105 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vps37cQ8R105 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps37cQ8R105 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Vps37cQ8R105 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Vps37cQ8R105 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps37cQ8R105 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps37cQ8R105 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
Vps37cQ8R105 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps37cQ8R105 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Vps37cQ8R105 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vps37cQ8R105 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps37cQ8R105 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vps37cQ8R105 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Vps37cQ8R105 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vps37cQ8R105 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vps37cQ8R105 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps37cQ8R105 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps37cQ8R105 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vps37cQ8R105 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vps37cQ8R105 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps37cQ8R105 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps37cQ8R105 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vps37cQ8R105 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vps37cQ8R105 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vps37cQ8R105 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Vps37cQ8R105 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Vps37cQ8R105 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps37cQ8R105 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps37cQ8R105 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vps37cQ8R105 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps37cQ8R105 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps37cQ8R105 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Vps37cQ8R105 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps37cQ8R105 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vps37cQ8R105 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Vps37cQ8R105 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms