Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI78

Rmnd1, Required for meiotic nuclear division protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmnd1Q8CI78 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Rmnd1Q8CI78 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Rmnd1Q8CI78 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,95■■□□□ 1,9
Rmnd1Q8CI78 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,94■■□□□ 1,9
Rmnd1Q8CI78 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26,93■■□□□ 1,9
Rmnd1Q8CI78 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Rmnd1Q8CI78 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Rmnd1Q8CI78 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,86■■□□□ 1,89
Rmnd1Q8CI78 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26,85■■□□□ 1,89
Rmnd1Q8CI78 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Rmnd1Q8CI78 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,81■■□□□ 1,88
Rmnd1Q8CI78 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,79■■□□□ 1,88
Rmnd1Q8CI78 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,76■■□□□ 1,87
Rmnd1Q8CI78 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,74■■□□□ 1,87
Rmnd1Q8CI78 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Rmnd1Q8CI78 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Rmnd1Q8CI78 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,72■■□□□ 1,87
Rmnd1Q8CI78 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26,7■■□□□ 1,87
Rmnd1Q8CI78 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,69■■□□□ 1,86
Rmnd1Q8CI78 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rmnd1Q8CI78 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rmnd1Q8CI78 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rmnd1Q8CI78 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC26,64■■□□□ 1,86
Rmnd1Q8CI78 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,62■■□□□ 1,85
Rmnd1Q8CI78 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,61■■□□□ 1,85
Rmnd1Q8CI78 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,59■■□□□ 1,85
Rmnd1Q8CI78 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,48■■□□□ 1,83
Rmnd1Q8CI78 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,45■■□□□ 1,82
Rmnd1Q8CI78 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Rmnd1Q8CI78 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,39■■□□□ 1,82
Rmnd1Q8CI78 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,38■■□□□ 1,81
Rmnd1Q8CI78 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Rmnd1Q8CI78 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Rmnd1Q8CI78 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,33■■□□□ 1,81
Rmnd1Q8CI78 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Rmnd1Q8CI78 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Rmnd1Q8CI78 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26,31■■□□□ 1,8
Rmnd1Q8CI78 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,3■■□□□ 1,8
Rmnd1Q8CI78 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,29■■□□□ 1,8
Rmnd1Q8CI78 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,28■■□□□ 1,8
Rmnd1Q8CI78 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,27■■□□□ 1,8
Rmnd1Q8CI78 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,26■■□□□ 1,79
Rmnd1Q8CI78 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,26■■□□□ 1,79
Rmnd1Q8CI78 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,25■■□□□ 1,79
Rmnd1Q8CI78 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,24■■□□□ 1,79
Rmnd1Q8CI78 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,22■■□□□ 1,79
Rmnd1Q8CI78 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Rmnd1Q8CI78 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,2■■□□□ 1,78
Rmnd1Q8CI78 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Rmnd1Q8CI78 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Rmnd1Q8CI78 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,77
Rmnd1Q8CI78 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26,12■■□□□ 1,77
Rmnd1Q8CI78 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Rmnd1Q8CI78 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Rmnd1Q8CI78 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,1■■□□□ 1,77
Rmnd1Q8CI78 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26,08■■□□□ 1,77
Rmnd1Q8CI78 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rmnd1Q8CI78 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Rmnd1Q8CI78 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26,04■■□□□ 1,76
Rmnd1Q8CI78 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Rmnd1Q8CI78 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,04■■□□□ 1,76
Rmnd1Q8CI78 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Rmnd1Q8CI78 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Rmnd1Q8CI78 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,01■■□□□ 1,75
Rmnd1Q8CI78 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Rmnd1Q8CI78 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Rmnd1Q8CI78 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Rmnd1Q8CI78 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Rmnd1Q8CI78 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25,94■■□□□ 1,74
Rmnd1Q8CI78 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25,94■■□□□ 1,74
Rmnd1Q8CI78 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,93■■□□□ 1,74
Rmnd1Q8CI78 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Rmnd1Q8CI78 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,89■■□□□ 1,74
Rmnd1Q8CI78 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rmnd1Q8CI78 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Rmnd1Q8CI78 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rmnd1Q8CI78 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rmnd1Q8CI78 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,84■■□□□ 1,73
Rmnd1Q8CI78 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,83■■□□□ 1,73
Rmnd1Q8CI78 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rmnd1Q8CI78 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,82■■□□□ 1,72
Rmnd1Q8CI78 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,81■■□□□ 1,72
Rmnd1Q8CI78 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25,79■■□□□ 1,72
Rmnd1Q8CI78 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Rmnd1Q8CI78 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Rmnd1Q8CI78 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Rmnd1Q8CI78 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,77■■□□□ 1,72
Rmnd1Q8CI78 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,75■■□□□ 1,71
Rmnd1Q8CI78 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,7■■□□□ 1,7
Rmnd1Q8CI78 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,68■■□□□ 1,7
Rmnd1Q8CI78 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25,67■■□□□ 1,7
Rmnd1Q8CI78 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,67■■□□□ 1,7
Rmnd1Q8CI78 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Rmnd1Q8CI78 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25,65■■□□□ 1,7
Rmnd1Q8CI78 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rmnd1Q8CI78 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,63■■□□□ 1,69
Rmnd1Q8CI78 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Rmnd1Q8CI78 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rmnd1Q8CI78 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Rmnd1Q8CI78 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31,8 ms