Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE13

Ccdc17, Coiled-coil domain-containing protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc17Q8CE13 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Ccdc17Q8CE13 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Ccdc17Q8CE13 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Ccdc17Q8CE13 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Ccdc17Q8CE13 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Ccdc17Q8CE13 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Ccdc17Q8CE13 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Ccdc17Q8CE13 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Ccdc17Q8CE13 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Ccdc17Q8CE13 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Ccdc17Q8CE13 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Ccdc17Q8CE13 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Ccdc17Q8CE13 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Ccdc17Q8CE13 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Ccdc17Q8CE13 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc17Q8CE13 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Ccdc17Q8CE13 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Ccdc17Q8CE13 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Ccdc17Q8CE13 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Ccdc17Q8CE13 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Ccdc17Q8CE13 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
Ccdc17Q8CE13 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Ccdc17Q8CE13 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Ccdc17Q8CE13 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc17Q8CE13 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Ccdc17Q8CE13 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc17Q8CE13 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Ccdc17Q8CE13 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Ccdc17Q8CE13 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc17Q8CE13 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
Ccdc17Q8CE13 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
Ccdc17Q8CE13 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Ccdc17Q8CE13 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc17Q8CE13 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Ccdc17Q8CE13 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Ccdc17Q8CE13 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Ccdc17Q8CE13 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Ccdc17Q8CE13 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc17Q8CE13 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Ccdc17Q8CE13 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Ccdc17Q8CE13 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc17Q8CE13 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc17Q8CE13 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Ccdc17Q8CE13 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Ccdc17Q8CE13 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc17Q8CE13 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Ccdc17Q8CE13 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Ccdc17Q8CE13 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Ccdc17Q8CE13 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Ccdc17Q8CE13 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Ccdc17Q8CE13 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Ccdc17Q8CE13 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Ccdc17Q8CE13 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Ccdc17Q8CE13 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc17Q8CE13 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Ccdc17Q8CE13 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Ccdc17Q8CE13 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc17Q8CE13 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc17Q8CE13 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Ccdc17Q8CE13 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Ccdc17Q8CE13 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc17Q8CE13 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Ccdc17Q8CE13 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc17Q8CE13 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Ccdc17Q8CE13 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Ccdc17Q8CE13 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc17Q8CE13 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Ccdc17Q8CE13 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.04
Ccdc17Q8CE13 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Ccdc17Q8CE13 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Ccdc17Q8CE13 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Ccdc17Q8CE13 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Ccdc17Q8CE13 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Ccdc17Q8CE13 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc17Q8CE13 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Ccdc17Q8CE13 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc17Q8CE13 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc17Q8CE13 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Ccdc17Q8CE13 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Ccdc17Q8CE13 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Ccdc17Q8CE13 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Ccdc17Q8CE13 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc17Q8CE13 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Ccdc17Q8CE13 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Ccdc17Q8CE13 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Ccdc17Q8CE13 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Ccdc17Q8CE13 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Ccdc17Q8CE13 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc17Q8CE13 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc17Q8CE13 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Ccdc17Q8CE13 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc17Q8CE13 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Ccdc17Q8CE13 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc17Q8CE13 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc17Q8CE13 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Ccdc17Q8CE13 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc17Q8CE13 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc17Q8CE13 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Ccdc17Q8CE13 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Ccdc17Q8CE13 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms