Protein–RNA interactions for Protein: Q8C8U0

Ppfibp1, Liprin-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfibp1Q8C8U0 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Ppfibp1Q8C8U0 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,03■■■□□ 2,56
Ppfibp1Q8C8U0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Ppfibp1Q8C8U0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2,55
Ppfibp1Q8C8U0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30,99■■■□□ 2,55
Ppfibp1Q8C8U0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,97■■■□□ 2,55
Ppfibp1Q8C8U0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,93■■■□□ 2,54
Ppfibp1Q8C8U0 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30,93■■■□□ 2,54
Ppfibp1Q8C8U0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,91■■■□□ 2,54
Ppfibp1Q8C8U0 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,88■■■□□ 2,53
Ppfibp1Q8C8U0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,82■■■□□ 2,52
Ppfibp1Q8C8U0 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30,76■■■□□ 2,51
Ppfibp1Q8C8U0 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30,68■■■□□ 2,5
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Ppfibp1Q8C8U0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC30,65■■■□□ 2,5
Ppfibp1Q8C8U0 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30,63■■■□□ 2,49
Ppfibp1Q8C8U0 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,63■■■□□ 2,49
Ppfibp1Q8C8U0 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30,59■■■□□ 2,49
Ppfibp1Q8C8U0 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,58■■■□□ 2,49
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30,58■■■□□ 2,49
Ppfibp1Q8C8U0 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,57■■■□□ 2,49
Ppfibp1Q8C8U0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,57■■■□□ 2,48
Ppfibp1Q8C8U0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30,56■■■□□ 2,48
Ppfibp1Q8C8U0 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,54■■■□□ 2,48
Ppfibp1Q8C8U0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,52■■■□□ 2,48
Ppfibp1Q8C8U0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,5■■■□□ 2,47
Ppfibp1Q8C8U0 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Ppfibp1Q8C8U0 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Ppfibp1Q8C8U0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,44■■■□□ 2,46
Ppfibp1Q8C8U0 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,43■■■□□ 2,46
Ppfibp1Q8C8U0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Ppfibp1Q8C8U0 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC30,4■■■□□ 2,46
Ppfibp1Q8C8U0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,39■■■□□ 2,46
Ppfibp1Q8C8U0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,38■■■□□ 2,45
Ppfibp1Q8C8U0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,37■■■□□ 2,45
Ppfibp1Q8C8U0 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Ppfibp1Q8C8U0 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Ppfibp1Q8C8U0 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,3■■■□□ 2,44
Ppfibp1Q8C8U0 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,29■■■□□ 2,44
Ppfibp1Q8C8U0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Ppfibp1Q8C8U0 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,25■■■□□ 2,43
Ppfibp1Q8C8U0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,23■■■□□ 2,43
Ppfibp1Q8C8U0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,21■■■□□ 2,43
Ppfibp1Q8C8U0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,16■■■□□ 2,42
Ppfibp1Q8C8U0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,15■■■□□ 2,42
Ppfibp1Q8C8U0 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Ppfibp1Q8C8U0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Ppfibp1Q8C8U0 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Ppfibp1Q8C8U0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ppfibp1Q8C8U0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Ppfibp1Q8C8U0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ppfibp1Q8C8U0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Ppfibp1Q8C8U0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Ppfibp1Q8C8U0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ppfibp1Q8C8U0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Ppfibp1Q8C8U0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Ppfibp1Q8C8U0 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC30,01■■■□□ 2,39
Ppfibp1Q8C8U0 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Ppfibp1Q8C8U0 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,96■■■□□ 2,39
Ppfibp1Q8C8U0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,94■■■□□ 2,38
Ppfibp1Q8C8U0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Ppfibp1Q8C8U0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29,9■■■□□ 2,38
Ppfibp1Q8C8U0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC29,88■■■□□ 2,37
Ppfibp1Q8C8U0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Ppfibp1Q8C8U0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Ppfibp1Q8C8U0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,82■■■□□ 2,36
Ppfibp1Q8C8U0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Ppfibp1Q8C8U0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,81■■■□□ 2,36
Ppfibp1Q8C8U0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Ppfibp1Q8C8U0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ppfibp1Q8C8U0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Ppfibp1Q8C8U0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,71■■■□□ 2,35
Ppfibp1Q8C8U0 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,69■■■□□ 2,34
Ppfibp1Q8C8U0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC29,67■■■□□ 2,34
Ppfibp1Q8C8U0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Ppfibp1Q8C8U0 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Ppfibp1Q8C8U0 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC29,64■■■□□ 2,34
Ppfibp1Q8C8U0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,33
Ppfibp1Q8C8U0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Ppfibp1Q8C8U0 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ppfibp1Q8C8U0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Ppfibp1Q8C8U0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ppfibp1Q8C8U0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Ppfibp1Q8C8U0 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Ppfibp1Q8C8U0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC29,59■■■□□ 2,33
Ppfibp1Q8C8U0 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Ppfibp1Q8C8U0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Ppfibp1Q8C8U0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Ppfibp1Q8C8U0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Ppfibp1Q8C8U0 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Ppfibp1Q8C8U0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Ppfibp1Q8C8U0 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,45■■■□□ 2,31
Ppfibp1Q8C8U0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,44■■■□□ 2,3
Ppfibp1Q8C8U0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC29,41■■■□□ 2,3
Ppfibp1Q8C8U0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC29,36■■■□□ 2,29
Ppfibp1Q8C8U0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,35■■■□□ 2,29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32,5 ms