Protein–RNA interactions for Protein: Q8C7G5

Apoa5, Apolipoprotein A-V, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa5Q8C7G5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Apoa5Q8C7G5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apoa5Q8C7G5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Apoa5Q8C7G5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apoa5Q8C7G5 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Apoa5Q8C7G5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Apoa5Q8C7G5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Apoa5Q8C7G5 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apoa5Q8C7G5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Apoa5Q8C7G5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Apoa5Q8C7G5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Apoa5Q8C7G5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Apoa5Q8C7G5 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apoa5Q8C7G5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Apoa5Q8C7G5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Apoa5Q8C7G5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apoa5Q8C7G5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Apoa5Q8C7G5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Apoa5Q8C7G5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Apoa5Q8C7G5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apoa5Q8C7G5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apoa5Q8C7G5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Apoa5Q8C7G5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Apoa5Q8C7G5 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apoa5Q8C7G5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Apoa5Q8C7G5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apoa5Q8C7G5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Apoa5Q8C7G5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Apoa5Q8C7G5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Apoa5Q8C7G5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Apoa5Q8C7G5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Apoa5Q8C7G5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Apoa5Q8C7G5 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apoa5Q8C7G5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Apoa5Q8C7G5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Apoa5Q8C7G5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Apoa5Q8C7G5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Apoa5Q8C7G5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Apoa5Q8C7G5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apoa5Q8C7G5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Apoa5Q8C7G5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apoa5Q8C7G5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Apoa5Q8C7G5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Apoa5Q8C7G5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Apoa5Q8C7G5 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Apoa5Q8C7G5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Apoa5Q8C7G5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apoa5Q8C7G5 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apoa5Q8C7G5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Apoa5Q8C7G5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apoa5Q8C7G5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Apoa5Q8C7G5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Apoa5Q8C7G5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apoa5Q8C7G5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apoa5Q8C7G5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Apoa5Q8C7G5 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Apoa5Q8C7G5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Apoa5Q8C7G5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Apoa5Q8C7G5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Apoa5Q8C7G5 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Apoa5Q8C7G5 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apoa5Q8C7G5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Apoa5Q8C7G5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Apoa5Q8C7G5 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Apoa5Q8C7G5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Apoa5Q8C7G5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Apoa5Q8C7G5 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Apoa5Q8C7G5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Apoa5Q8C7G5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apoa5Q8C7G5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apoa5Q8C7G5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Apoa5Q8C7G5 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Apoa5Q8C7G5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Apoa5Q8C7G5 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Apoa5Q8C7G5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Apoa5Q8C7G5 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apoa5Q8C7G5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apoa5Q8C7G5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Apoa5Q8C7G5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apoa5Q8C7G5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Apoa5Q8C7G5 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apoa5Q8C7G5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Apoa5Q8C7G5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Apoa5Q8C7G5 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Apoa5Q8C7G5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Apoa5Q8C7G5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Apoa5Q8C7G5 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Apoa5Q8C7G5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Apoa5Q8C7G5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Apoa5Q8C7G5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Apoa5Q8C7G5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apoa5Q8C7G5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Apoa5Q8C7G5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Apoa5Q8C7G5 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Apoa5Q8C7G5 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apoa5Q8C7G5 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Apoa5Q8C7G5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Apoa5Q8C7G5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Apoa5Q8C7G5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Apoa5Q8C7G5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms