Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ap3s2Q8BSZ2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ap3s2Q8BSZ2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ap3s2Q8BSZ2 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ap3s2Q8BSZ2 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Ap3s2Q8BSZ2 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ap3s2Q8BSZ2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ap3s2Q8BSZ2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ap3s2Q8BSZ2 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3s2Q8BSZ2 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ap3s2Q8BSZ2 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ap3s2Q8BSZ2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ap3s2Q8BSZ2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ap3s2Q8BSZ2 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ap3s2Q8BSZ2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ap3s2Q8BSZ2 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ap3s2Q8BSZ2 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3s2Q8BSZ2 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ap3s2Q8BSZ2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3s2Q8BSZ2 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ap3s2Q8BSZ2 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ap3s2Q8BSZ2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3s2Q8BSZ2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3s2Q8BSZ2 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ap3s2Q8BSZ2 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ap3s2Q8BSZ2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ap3s2Q8BSZ2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ap3s2Q8BSZ2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3s2Q8BSZ2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ap3s2Q8BSZ2 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ap3s2Q8BSZ2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3s2Q8BSZ2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ap3s2Q8BSZ2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Ap3s2Q8BSZ2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Ap3s2Q8BSZ2 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Ap3s2Q8BSZ2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3s2Q8BSZ2 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Ap3s2Q8BSZ2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Ap3s2Q8BSZ2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Ap3s2Q8BSZ2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3s2Q8BSZ2 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Ap3s2Q8BSZ2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3s2Q8BSZ2 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Ap3s2Q8BSZ2 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Ap3s2Q8BSZ2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3s2Q8BSZ2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ap3s2Q8BSZ2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3s2Q8BSZ2 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ap3s2Q8BSZ2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3s2Q8BSZ2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ap3s2Q8BSZ2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ap3s2Q8BSZ2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ap3s2Q8BSZ2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ap3s2Q8BSZ2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ap3s2Q8BSZ2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ap3s2Q8BSZ2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ap3s2Q8BSZ2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ap3s2Q8BSZ2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ap3s2Q8BSZ2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3s2Q8BSZ2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ap3s2Q8BSZ2 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ap3s2Q8BSZ2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3s2Q8BSZ2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ap3s2Q8BSZ2 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ap3s2Q8BSZ2 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ap3s2Q8BSZ2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3s2Q8BSZ2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3s2Q8BSZ2 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ap3s2Q8BSZ2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ap3s2Q8BSZ2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Ap3s2Q8BSZ2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ap3s2Q8BSZ2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ap3s2Q8BSZ2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3s2Q8BSZ2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ap3s2Q8BSZ2 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ap3s2Q8BSZ2 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ap3s2Q8BSZ2 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3s2Q8BSZ2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Ap3s2Q8BSZ2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ap3s2Q8BSZ2 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3s2Q8BSZ2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ap3s2Q8BSZ2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ap3s2Q8BSZ2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3s2Q8BSZ2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Ap3s2Q8BSZ2 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3s2Q8BSZ2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3s2Q8BSZ2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3s2Q8BSZ2 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3s2Q8BSZ2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ap3s2Q8BSZ2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ap3s2Q8BSZ2 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ap3s2Q8BSZ2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ap3s2Q8BSZ2 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ap3s2Q8BSZ2 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3s2Q8BSZ2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ap3s2Q8BSZ2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ap3s2Q8BSZ2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms