Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z10

Astn2, Astrotactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn2Q80Z10 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Astn2Q80Z10 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Astn2Q80Z10 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38.12■■■■□ 3.69
Astn2Q80Z10 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38.12■■■■□ 3.69
Astn2Q80Z10 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Astn2Q80Z10 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.03■■■■□ 3.68
Astn2Q80Z10 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.01■■■■□ 3.68
Astn2Q80Z10 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Astn2Q80Z10 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.65
Astn2Q80Z10 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Astn2Q80Z10 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
Astn2Q80Z10 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Astn2Q80Z10 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.71■■■■□ 3.63
Astn2Q80Z10 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Astn2Q80Z10 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.65■■■■□ 3.62
Astn2Q80Z10 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
Astn2Q80Z10 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
Astn2Q80Z10 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37.58■■■■□ 3.61
Astn2Q80Z10 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Astn2Q80Z10 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Astn2Q80Z10 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Astn2Q80Z10 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
Astn2Q80Z10 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Astn2Q80Z10 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
Astn2Q80Z10 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Astn2Q80Z10 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.55
Astn2Q80Z10 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Astn2Q80Z10 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Astn2Q80Z10 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Astn2Q80Z10 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.54
Astn2Q80Z10 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Astn2Q80Z10 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Astn2Q80Z10 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Astn2Q80Z10 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.05■■■■□ 3.52
Astn2Q80Z10 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
Astn2Q80Z10 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Astn2Q80Z10 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37.03■■■■□ 3.52
Astn2Q80Z10 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
Astn2Q80Z10 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3.51
Astn2Q80Z10 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.99■■■■□ 3.51
Astn2Q80Z10 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Astn2Q80Z10 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Astn2Q80Z10 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36.94■■■■□ 3.5
Astn2Q80Z10 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
Astn2Q80Z10 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
Astn2Q80Z10 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Astn2Q80Z10 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36.83■■■■□ 3.49
Astn2Q80Z10 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.82■■■■□ 3.49
Astn2Q80Z10 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Astn2Q80Z10 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Astn2Q80Z10 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Astn2Q80Z10 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Astn2Q80Z10 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Astn2Q80Z10 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
Astn2Q80Z10 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.74■■■■□ 3.47
Astn2Q80Z10 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36.73■■■■□ 3.47
Astn2Q80Z10 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Astn2Q80Z10 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
Astn2Q80Z10 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
Astn2Q80Z10 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
Astn2Q80Z10 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
Astn2Q80Z10 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
Astn2Q80Z10 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Astn2Q80Z10 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
Astn2Q80Z10 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
Astn2Q80Z10 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Astn2Q80Z10 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.57■■■■□ 3.45
Astn2Q80Z10 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Astn2Q80Z10 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
Astn2Q80Z10 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Astn2Q80Z10 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Astn2Q80Z10 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Astn2Q80Z10 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36.29■■■■□ 3.4
Astn2Q80Z10 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.29■■■■□ 3.4
Astn2Q80Z10 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Astn2Q80Z10 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36.27■■■■□ 3.4
Astn2Q80Z10 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Astn2Q80Z10 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36.24■■■■□ 3.39
Astn2Q80Z10 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Astn2Q80Z10 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Astn2Q80Z10 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Astn2Q80Z10 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Astn2Q80Z10 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Astn2Q80Z10 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Astn2Q80Z10 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Astn2Q80Z10 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Astn2Q80Z10 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Astn2Q80Z10 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
Astn2Q80Z10 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Astn2Q80Z10 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36.07■■■■□ 3.37
Astn2Q80Z10 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
Astn2Q80Z10 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.06■■■■□ 3.36
Astn2Q80Z10 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Astn2Q80Z10 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Astn2Q80Z10 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36.05■■■■□ 3.36
Astn2Q80Z10 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Astn2Q80Z10 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36.02■■■■□ 3.36
Astn2Q80Z10 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.35
Astn2Q80Z10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Astn2Q80Z10 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms