Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z10

Astn2, Astrotactin-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Astn2Q80Z10 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,12■■■■□ 3,69
Astn2Q80Z10 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC38,12■■■■□ 3,69
Astn2Q80Z10 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC38,12■■■■□ 3,69
Astn2Q80Z10 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38,12■■■■□ 3,69
Astn2Q80Z10 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Astn2Q80Z10 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,03■■■■□ 3,68
Astn2Q80Z10 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,01■■■■□ 3,68
Astn2Q80Z10 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Astn2Q80Z10 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,82■■■■□ 3,65
Astn2Q80Z10 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37,82■■■■□ 3,64
Astn2Q80Z10 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Astn2Q80Z10 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Astn2Q80Z10 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,71■■■■□ 3,63
Astn2Q80Z10 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC37,65■■■■□ 3,62
Astn2Q80Z10 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,65■■■■□ 3,62
Astn2Q80Z10 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,64■■■■□ 3,62
Astn2Q80Z10 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,62■■■■□ 3,61
Astn2Q80Z10 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC37,58■■■■□ 3,61
Astn2Q80Z10 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Astn2Q80Z10 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Astn2Q80Z10 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,43■■■■□ 3,58
Astn2Q80Z10 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,41■■■■□ 3,58
Astn2Q80Z10 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC37,39■■■■□ 3,58
Astn2Q80Z10 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37,3■■■■□ 3,56
Astn2Q80Z10 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,27■■■■□ 3,56
Astn2Q80Z10 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC37,26■■■■□ 3,55
Astn2Q80Z10 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37,24■■■■□ 3,55
Astn2Q80Z10 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Astn2Q80Z10 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,21■■■■□ 3,55
Astn2Q80Z10 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,54
Astn2Q80Z10 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Astn2Q80Z10 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37,13■■■■□ 3,53
Astn2Q80Z10 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,06■■■■□ 3,52
Astn2Q80Z10 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,05■■■■□ 3,52
Astn2Q80Z10 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,04■■■■□ 3,52
Astn2Q80Z10 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,03■■■■□ 3,52
Astn2Q80Z10 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37,03■■■■□ 3,52
Astn2Q80Z10 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37,01■■■■□ 3,51
Astn2Q80Z10 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37■■■■□ 3,51
Astn2Q80Z10 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36,99■■■■□ 3,51
Astn2Q80Z10 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,96■■■■□ 3,51
Astn2Q80Z10 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36,95■■■■□ 3,51
Astn2Q80Z10 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36,94■■■■□ 3,5
Astn2Q80Z10 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Astn2Q80Z10 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,9■■■■□ 3,5
Astn2Q80Z10 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Astn2Q80Z10 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC36,83■■■■□ 3,49
Astn2Q80Z10 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,49
Astn2Q80Z10 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Astn2Q80Z10 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Astn2Q80Z10 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,79■■■■□ 3,48
Astn2Q80Z10 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Astn2Q80Z10 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36,77■■■■□ 3,48
Astn2Q80Z10 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36,77■■■■□ 3,48
Astn2Q80Z10 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,74■■■■□ 3,47
Astn2Q80Z10 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36,73■■■■□ 3,47
Astn2Q80Z10 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,73■■■■□ 3,47
Astn2Q80Z10 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Astn2Q80Z10 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC36,66■■■■□ 3,46
Astn2Q80Z10 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC36,66■■■■□ 3,46
Astn2Q80Z10 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Astn2Q80Z10 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,61■■■■□ 3,45
Astn2Q80Z10 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Astn2Q80Z10 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,6■■■■□ 3,45
Astn2Q80Z10 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,59■■■■□ 3,45
Astn2Q80Z10 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36,57■■■■□ 3,45
Astn2Q80Z10 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,57■■■■□ 3,45
Astn2Q80Z10 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC36,49■■■■□ 3,43
Astn2Q80Z10 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,48■■■■□ 3,43
Astn2Q80Z10 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Astn2Q80Z10 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Astn2Q80Z10 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,34■■■■□ 3,41
Astn2Q80Z10 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC36,29■■■■□ 3,4
Astn2Q80Z10 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,29■■■■□ 3,4
Astn2Q80Z10 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Astn2Q80Z10 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36,27■■■■□ 3,4
Astn2Q80Z10 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,39
Astn2Q80Z10 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC36,24■■■■□ 3,39
Astn2Q80Z10 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC36,23■■■■□ 3,39
Astn2Q80Z10 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC36,22■■■■□ 3,39
Astn2Q80Z10 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36,22■■■■□ 3,39
Astn2Q80Z10 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,2■■■■□ 3,39
Astn2Q80Z10 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Astn2Q80Z10 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Astn2Q80Z10 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Astn2Q80Z10 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Astn2Q80Z10 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Astn2Q80Z10 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Astn2Q80Z10 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,08■■■■□ 3,37
Astn2Q80Z10 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC36,07■■■■□ 3,37
Astn2Q80Z10 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC36,07■■■■□ 3,36
Astn2Q80Z10 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36,06■■■■□ 3,36
Astn2Q80Z10 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC36,06■■■■□ 3,36
Astn2Q80Z10 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,06■■■■□ 3,36
Astn2Q80Z10 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC36,05■■■■□ 3,36
Astn2Q80Z10 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC36,05■■■■□ 3,36
Astn2Q80Z10 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC36,02■■■■□ 3,36
Astn2Q80Z10 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36,01■■■■□ 3,35
Astn2Q80Z10 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Astn2Q80Z10 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,96■■■■□ 3,35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8,2 ms