Protein–RNA interactions for Protein: Q80XC6

Nrde2, Protein NRDE2 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrde2Q80XC6 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Nrde2Q80XC6 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Nrde2Q80XC6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nrde2Q80XC6 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nrde2Q80XC6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Nrde2Q80XC6 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nrde2Q80XC6 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nrde2Q80XC6 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nrde2Q80XC6 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nrde2Q80XC6 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nrde2Q80XC6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nrde2Q80XC6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nrde2Q80XC6 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nrde2Q80XC6 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Nrde2Q80XC6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nrde2Q80XC6 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nrde2Q80XC6 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nrde2Q80XC6 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nrde2Q80XC6 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nrde2Q80XC6 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC27.76■■■□□ 2.04
Nrde2Q80XC6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nrde2Q80XC6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Nrde2Q80XC6 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Nrde2Q80XC6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Nrde2Q80XC6 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Nrde2Q80XC6 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Nrde2Q80XC6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Nrde2Q80XC6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Nrde2Q80XC6 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Nrde2Q80XC6 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Nrde2Q80XC6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
Nrde2Q80XC6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nrde2Q80XC6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Nrde2Q80XC6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Nrde2Q80XC6 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nrde2Q80XC6 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nrde2Q80XC6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nrde2Q80XC6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nrde2Q80XC6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nrde2Q80XC6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nrde2Q80XC6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Nrde2Q80XC6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrde2Q80XC6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nrde2Q80XC6 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nrde2Q80XC6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nrde2Q80XC6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nrde2Q80XC6 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nrde2Q80XC6 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nrde2Q80XC6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Nrde2Q80XC6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nrde2Q80XC6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Nrde2Q80XC6 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nrde2Q80XC6 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nrde2Q80XC6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrde2Q80XC6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
Nrde2Q80XC6 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrde2Q80XC6 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Nrde2Q80XC6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Nrde2Q80XC6 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Nrde2Q80XC6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Nrde2Q80XC6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Nrde2Q80XC6 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nrde2Q80XC6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Nrde2Q80XC6 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Nrde2Q80XC6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nrde2Q80XC6 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Nrde2Q80XC6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Nrde2Q80XC6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Nrde2Q80XC6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nrde2Q80XC6 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Nrde2Q80XC6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Nrde2Q80XC6 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Nrde2Q80XC6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Nrde2Q80XC6 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Nrde2Q80XC6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Nrde2Q80XC6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Nrde2Q80XC6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Nrde2Q80XC6 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Nrde2Q80XC6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Nrde2Q80XC6 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Nrde2Q80XC6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Nrde2Q80XC6 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nrde2Q80XC6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Nrde2Q80XC6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Nrde2Q80XC6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nrde2Q80XC6 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Nrde2Q80XC6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nrde2Q80XC6 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Nrde2Q80XC6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Nrde2Q80XC6 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Nrde2Q80XC6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Nrde2Q80XC6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Nrde2Q80XC6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Nrde2Q80XC6 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Nrde2Q80XC6 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nrde2Q80XC6 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Nrde2Q80XC6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Nrde2Q80XC6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Nrde2Q80XC6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Nrde2Q80XC6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104 ms