Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
Zbed4Q80WQ9 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC31.1■■■□□ 2.57
Zbed4Q80WQ9 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.09■■■□□ 2.57
Zbed4Q80WQ9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Zbed4Q80WQ9 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.06■■■□□ 2.56
Zbed4Q80WQ9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC31.06■■■□□ 2.56
Zbed4Q80WQ9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Zbed4Q80WQ9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Zbed4Q80WQ9 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Zbed4Q80WQ9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.01■■■□□ 2.56
Zbed4Q80WQ9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
Zbed4Q80WQ9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Zbed4Q80WQ9 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
Zbed4Q80WQ9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Zbed4Q80WQ9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
Zbed4Q80WQ9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
Zbed4Q80WQ9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Zbed4Q80WQ9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Zbed4Q80WQ9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Zbed4Q80WQ9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Zbed4Q80WQ9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Zbed4Q80WQ9 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Zbed4Q80WQ9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Zbed4Q80WQ9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Zbed4Q80WQ9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Zbed4Q80WQ9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.56■■■□□ 2.48
Zbed4Q80WQ9 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Zbed4Q80WQ9 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Zbed4Q80WQ9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Zbed4Q80WQ9 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Zbed4Q80WQ9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Zbed4Q80WQ9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Zbed4Q80WQ9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Zbed4Q80WQ9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Zbed4Q80WQ9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Zbed4Q80WQ9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Zbed4Q80WQ9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Zbed4Q80WQ9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Zbed4Q80WQ9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.32■■■□□ 2.44
Zbed4Q80WQ9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Zbed4Q80WQ9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Zbed4Q80WQ9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Zbed4Q80WQ9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Zbed4Q80WQ9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Zbed4Q80WQ9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Zbed4Q80WQ9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Zbed4Q80WQ9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
Zbed4Q80WQ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Zbed4Q80WQ9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Zbed4Q80WQ9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Zbed4Q80WQ9 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Zbed4Q80WQ9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Zbed4Q80WQ9 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Zbed4Q80WQ9 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.41
Zbed4Q80WQ9 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Zbed4Q80WQ9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Zbed4Q80WQ9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.08■■■□□ 2.41
Zbed4Q80WQ9 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
Zbed4Q80WQ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Zbed4Q80WQ9 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Zbed4Q80WQ9 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Zbed4Q80WQ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
Zbed4Q80WQ9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Zbed4Q80WQ9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Zbed4Q80WQ9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Zbed4Q80WQ9 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Zbed4Q80WQ9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
Zbed4Q80WQ9 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Zbed4Q80WQ9 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
Zbed4Q80WQ9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
Zbed4Q80WQ9 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Zbed4Q80WQ9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
Zbed4Q80WQ9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Zbed4Q80WQ9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Zbed4Q80WQ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
Zbed4Q80WQ9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Zbed4Q80WQ9 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Zbed4Q80WQ9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Zbed4Q80WQ9 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Zbed4Q80WQ9 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Zbed4Q80WQ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.34
Zbed4Q80WQ9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
Zbed4Q80WQ9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
Zbed4Q80WQ9 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Zbed4Q80WQ9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Zbed4Q80WQ9 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Zbed4Q80WQ9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Zbed4Q80WQ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zbed4Q80WQ9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Zbed4Q80WQ9 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zbed4Q80WQ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zbed4Q80WQ9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Zbed4Q80WQ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Zbed4Q80WQ9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
Zbed4Q80WQ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Zbed4Q80WQ9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Zbed4Q80WQ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Zbed4Q80WQ9 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Zbed4Q80WQ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Zbed4Q80WQ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.46■■■□□ 2.31
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