Protein–RNA interactions for Protein: Q80WM3

Cplx4, Complexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cplx4Q80WM3 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Cplx4Q80WM3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cplx4Q80WM3 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Cplx4Q80WM3 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Cplx4Q80WM3 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Cplx4Q80WM3 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Cplx4Q80WM3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Cplx4Q80WM3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Cplx4Q80WM3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Cplx4Q80WM3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cplx4Q80WM3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cplx4Q80WM3 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Cplx4Q80WM3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Cplx4Q80WM3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cplx4Q80WM3 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cplx4Q80WM3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cplx4Q80WM3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Cplx4Q80WM3 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Cplx4Q80WM3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Cplx4Q80WM3 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
Cplx4Q80WM3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cplx4Q80WM3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Cplx4Q80WM3 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cplx4Q80WM3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Cplx4Q80WM3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Cplx4Q80WM3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cplx4Q80WM3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Cplx4Q80WM3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Cplx4Q80WM3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cplx4Q80WM3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Cplx4Q80WM3 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Cplx4Q80WM3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Cplx4Q80WM3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cplx4Q80WM3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cplx4Q80WM3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cplx4Q80WM3 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cplx4Q80WM3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Cplx4Q80WM3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Cplx4Q80WM3 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Cplx4Q80WM3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cplx4Q80WM3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Cplx4Q80WM3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cplx4Q80WM3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cplx4Q80WM3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cplx4Q80WM3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Cplx4Q80WM3 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Cplx4Q80WM3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cplx4Q80WM3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cplx4Q80WM3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Cplx4Q80WM3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cplx4Q80WM3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Cplx4Q80WM3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
Cplx4Q80WM3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
Cplx4Q80WM3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Cplx4Q80WM3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cplx4Q80WM3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Cplx4Q80WM3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Cplx4Q80WM3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cplx4Q80WM3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cplx4Q80WM3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cplx4Q80WM3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cplx4Q80WM3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cplx4Q80WM3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cplx4Q80WM3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Cplx4Q80WM3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cplx4Q80WM3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cplx4Q80WM3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cplx4Q80WM3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cplx4Q80WM3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cplx4Q80WM3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cplx4Q80WM3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cplx4Q80WM3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cplx4Q80WM3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cplx4Q80WM3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cplx4Q80WM3 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cplx4Q80WM3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cplx4Q80WM3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Cplx4Q80WM3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cplx4Q80WM3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cplx4Q80WM3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cplx4Q80WM3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cplx4Q80WM3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cplx4Q80WM3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cplx4Q80WM3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cplx4Q80WM3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cplx4Q80WM3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cplx4Q80WM3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cplx4Q80WM3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cplx4Q80WM3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cplx4Q80WM3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cplx4Q80WM3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cplx4Q80WM3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cplx4Q80WM3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cplx4Q80WM3 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cplx4Q80WM3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cplx4Q80WM3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cplx4Q80WM3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cplx4Q80WM3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cplx4Q80WM3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cplx4Q80WM3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms