Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPQ3

Shprh, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, mousemouse

Predictions only

Length 1,674 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ShprhQ7TPQ3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.52■■■■■ 4.24
ShprhQ7TPQ3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
ShprhQ7TPQ3 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC41.39■■■■■ 4.22
ShprhQ7TPQ3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ShprhQ7TPQ3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.35■■■■■ 4.21
ShprhQ7TPQ3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.33■■■■■ 4.21
ShprhQ7TPQ3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.33■■■■■ 4.21
ShprhQ7TPQ3 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC41.31■■■■■ 4.2
ShprhQ7TPQ3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC41.28■■■■■ 4.2
ShprhQ7TPQ3 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
ShprhQ7TPQ3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC41.22■■■■■ 4.19
ShprhQ7TPQ3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
ShprhQ7TPQ3 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
ShprhQ7TPQ3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC41.14■■■■■ 4.18
ShprhQ7TPQ3 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.14■■■■■ 4.18
ShprhQ7TPQ3 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC41.13■■■■■ 4.17
ShprhQ7TPQ3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC41.12■■■■■ 4.17
ShprhQ7TPQ3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.04■■■■■ 4.16
ShprhQ7TPQ3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.16
ShprhQ7TPQ3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
ShprhQ7TPQ3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.9■■■■■ 4.14
ShprhQ7TPQ3 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
ShprhQ7TPQ3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.74■■■■■ 4.11
ShprhQ7TPQ3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.69■■■■■ 4.11
ShprhQ7TPQ3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC40.67■■■■■ 4.1
ShprhQ7TPQ3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC40.67■■■■■ 4.1
ShprhQ7TPQ3 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ShprhQ7TPQ3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC40.59■■■■■ 4.09
ShprhQ7TPQ3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ShprhQ7TPQ3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC40.58■■■■■ 4.09
ShprhQ7TPQ3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ShprhQ7TPQ3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
ShprhQ7TPQ3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC40.45■■■■■ 4.07
ShprhQ7TPQ3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC40.44■■■■■ 4.06
ShprhQ7TPQ3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
ShprhQ7TPQ3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ShprhQ7TPQ3 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
ShprhQ7TPQ3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
ShprhQ7TPQ3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
ShprhQ7TPQ3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC40.38■■■■■ 4.05
ShprhQ7TPQ3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
ShprhQ7TPQ3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC40.36■■■■■ 4.05
ShprhQ7TPQ3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
ShprhQ7TPQ3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
ShprhQ7TPQ3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
ShprhQ7TPQ3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC40.29■■■■■ 4.04
ShprhQ7TPQ3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
ShprhQ7TPQ3 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
ShprhQ7TPQ3 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.14■■■■■ 4.02
ShprhQ7TPQ3 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
ShprhQ7TPQ3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.12■■■■■ 4.01
ShprhQ7TPQ3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.09■■■■■ 4.01
ShprhQ7TPQ3 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
ShprhQ7TPQ3 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
ShprhQ7TPQ3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
ShprhQ7TPQ3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
ShprhQ7TPQ3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.95■■■■□ 3.99
ShprhQ7TPQ3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC39.92■■■■□ 3.98
ShprhQ7TPQ3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC39.91■■■■□ 3.98
ShprhQ7TPQ3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ShprhQ7TPQ3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
ShprhQ7TPQ3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC39.9■■■■□ 3.98
ShprhQ7TPQ3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.87■■■■□ 3.97
ShprhQ7TPQ3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
ShprhQ7TPQ3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
ShprhQ7TPQ3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
ShprhQ7TPQ3 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
ShprhQ7TPQ3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39.7■■■■□ 3.95
ShprhQ7TPQ3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC39.67■■■■□ 3.94
ShprhQ7TPQ3 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC39.66■■■■□ 3.94
ShprhQ7TPQ3 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
ShprhQ7TPQ3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC39.57■■■■□ 3.92
ShprhQ7TPQ3 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ShprhQ7TPQ3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.54■■■■□ 3.92
ShprhQ7TPQ3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
ShprhQ7TPQ3 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ShprhQ7TPQ3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
ShprhQ7TPQ3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC39.48■■■■□ 3.91
ShprhQ7TPQ3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
ShprhQ7TPQ3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC39.45■■■■□ 3.91
ShprhQ7TPQ3 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.45■■■■□ 3.91
ShprhQ7TPQ3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC39.43■■■■□ 3.9
ShprhQ7TPQ3 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC39.41■■■■□ 3.9
ShprhQ7TPQ3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC39.4■■■■□ 3.9
ShprhQ7TPQ3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC39.38■■■■□ 3.9
ShprhQ7TPQ3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
ShprhQ7TPQ3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.9
ShprhQ7TPQ3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC39.38■■■■□ 3.89
ShprhQ7TPQ3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
ShprhQ7TPQ3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC39.34■■■■□ 3.89
ShprhQ7TPQ3 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
ShprhQ7TPQ3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC39.3■■■■□ 3.88
ShprhQ7TPQ3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ShprhQ7TPQ3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
ShprhQ7TPQ3 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ShprhQ7TPQ3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ShprhQ7TPQ3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
ShprhQ7TPQ3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.24■■■■□ 3.87
ShprhQ7TPQ3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
ShprhQ7TPQ3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms