Protein–RNA interactions for Protein: Q6V4S5

Sdk2, Protein sidekick-2, mousemouse

Predictions only

Length 2,176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdk2Q6V4S5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sdk2Q6V4S5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sdk2Q6V4S5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sdk2Q6V4S5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sdk2Q6V4S5 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sdk2Q6V4S5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sdk2Q6V4S5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Sdk2Q6V4S5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sdk2Q6V4S5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sdk2Q6V4S5 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sdk2Q6V4S5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Sdk2Q6V4S5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Sdk2Q6V4S5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Sdk2Q6V4S5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Sdk2Q6V4S5 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Sdk2Q6V4S5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Sdk2Q6V4S5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Sdk2Q6V4S5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Sdk2Q6V4S5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Sdk2Q6V4S5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Sdk2Q6V4S5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Sdk2Q6V4S5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Sdk2Q6V4S5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Sdk2Q6V4S5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Sdk2Q6V4S5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Sdk2Q6V4S5 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sdk2Q6V4S5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sdk2Q6V4S5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Sdk2Q6V4S5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sdk2Q6V4S5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Sdk2Q6V4S5 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Sdk2Q6V4S5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Sdk2Q6V4S5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Sdk2Q6V4S5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sdk2Q6V4S5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sdk2Q6V4S5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Sdk2Q6V4S5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sdk2Q6V4S5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sdk2Q6V4S5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sdk2Q6V4S5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sdk2Q6V4S5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sdk2Q6V4S5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sdk2Q6V4S5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sdk2Q6V4S5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sdk2Q6V4S5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Sdk2Q6V4S5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Sdk2Q6V4S5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sdk2Q6V4S5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sdk2Q6V4S5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sdk2Q6V4S5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sdk2Q6V4S5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Sdk2Q6V4S5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sdk2Q6V4S5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sdk2Q6V4S5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sdk2Q6V4S5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sdk2Q6V4S5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sdk2Q6V4S5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sdk2Q6V4S5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sdk2Q6V4S5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sdk2Q6V4S5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Sdk2Q6V4S5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sdk2Q6V4S5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Sdk2Q6V4S5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Sdk2Q6V4S5 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sdk2Q6V4S5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sdk2Q6V4S5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Sdk2Q6V4S5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Sdk2Q6V4S5 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Sdk2Q6V4S5 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sdk2Q6V4S5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Sdk2Q6V4S5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sdk2Q6V4S5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Sdk2Q6V4S5 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sdk2Q6V4S5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Sdk2Q6V4S5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Sdk2Q6V4S5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Sdk2Q6V4S5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Sdk2Q6V4S5 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Sdk2Q6V4S5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Sdk2Q6V4S5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Sdk2Q6V4S5 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Sdk2Q6V4S5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Sdk2Q6V4S5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Sdk2Q6V4S5 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Sdk2Q6V4S5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Sdk2Q6V4S5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Sdk2Q6V4S5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.58■■□□□ 1.68
Sdk2Q6V4S5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdk2Q6V4S5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdk2Q6V4S5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdk2Q6V4S5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdk2Q6V4S5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Sdk2Q6V4S5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Sdk2Q6V4S5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Sdk2Q6V4S5 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sdk2Q6V4S5 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Sdk2Q6V4S5 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sdk2Q6V4S5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Sdk2Q6V4S5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Sdk2Q6V4S5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms