Protein–RNA interactions for Protein: Q6QR59

Tcaf3, TRPM8 channel-associated factor 3, mousemouse

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Length 914 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcaf3Q6QR59 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tcaf3Q6QR59 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Tcaf3Q6QR59 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tcaf3Q6QR59 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.05■■■□□ 2.56
Tcaf3Q6QR59 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31.04■■■□□ 2.56
Tcaf3Q6QR59 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Tcaf3Q6QR59 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Tcaf3Q6QR59 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
Tcaf3Q6QR59 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
Tcaf3Q6QR59 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Tcaf3Q6QR59 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
Tcaf3Q6QR59 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
Tcaf3Q6QR59 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
Tcaf3Q6QR59 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Tcaf3Q6QR59 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Tcaf3Q6QR59 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Tcaf3Q6QR59 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tcaf3Q6QR59 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Tcaf3Q6QR59 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Tcaf3Q6QR59 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Tcaf3Q6QR59 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Tcaf3Q6QR59 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Tcaf3Q6QR59 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Tcaf3Q6QR59 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Tcaf3Q6QR59 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tcaf3Q6QR59 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Tcaf3Q6QR59 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tcaf3Q6QR59 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Tcaf3Q6QR59 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Tcaf3Q6QR59 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tcaf3Q6QR59 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Tcaf3Q6QR59 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30.37■■■□□ 2.45
Tcaf3Q6QR59 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.35■■■□□ 2.45
Tcaf3Q6QR59 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30.34■■■□□ 2.45
Tcaf3Q6QR59 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tcaf3Q6QR59 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
Tcaf3Q6QR59 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Tcaf3Q6QR59 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Tcaf3Q6QR59 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tcaf3Q6QR59 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tcaf3Q6QR59 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Tcaf3Q6QR59 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tcaf3Q6QR59 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tcaf3Q6QR59 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Tcaf3Q6QR59 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
Tcaf3Q6QR59 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
Tcaf3Q6QR59 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Tcaf3Q6QR59 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.18■■■□□ 2.42
Tcaf3Q6QR59 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Tcaf3Q6QR59 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30.14■■■□□ 2.42
Tcaf3Q6QR59 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
Tcaf3Q6QR59 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
Tcaf3Q6QR59 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
Tcaf3Q6QR59 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Tcaf3Q6QR59 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Tcaf3Q6QR59 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Tcaf3Q6QR59 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30.01■■■□□ 2.4
Tcaf3Q6QR59 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.01■■■□□ 2.39
Tcaf3Q6QR59 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Tcaf3Q6QR59 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Tcaf3Q6QR59 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
Tcaf3Q6QR59 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Tcaf3Q6QR59 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tcaf3Q6QR59 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tcaf3Q6QR59 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Tcaf3Q6QR59 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Tcaf3Q6QR59 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tcaf3Q6QR59 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tcaf3Q6QR59 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
Tcaf3Q6QR59 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
Tcaf3Q6QR59 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
Tcaf3Q6QR59 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
Tcaf3Q6QR59 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Tcaf3Q6QR59 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Tcaf3Q6QR59 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Tcaf3Q6QR59 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
Tcaf3Q6QR59 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Tcaf3Q6QR59 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tcaf3Q6QR59 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Tcaf3Q6QR59 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Tcaf3Q6QR59 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Tcaf3Q6QR59 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Tcaf3Q6QR59 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
Tcaf3Q6QR59 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tcaf3Q6QR59 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Tcaf3Q6QR59 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Tcaf3Q6QR59 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Tcaf3Q6QR59 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tcaf3Q6QR59 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tcaf3Q6QR59 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tcaf3Q6QR59 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Tcaf3Q6QR59 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Tcaf3Q6QR59 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tcaf3Q6QR59 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
Tcaf3Q6QR59 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Tcaf3Q6QR59 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Tcaf3Q6QR59 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Tcaf3Q6QR59 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Tcaf3Q6QR59 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Tcaf3Q6QR59 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
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