Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K9

Nrxn3, Neurexin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,571 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrxn3Q6P9K9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,22■■■■■ 4,03
Nrxn3Q6P9K9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC40,2■■■■■ 4,03
Nrxn3Q6P9K9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC40,12■■■■■ 4,01
Nrxn3Q6P9K9 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC40,12■■■■■ 4,01
Nrxn3Q6P9K9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,01■■■■■ 4
Nrxn3Q6P9K9 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40■■■■□ 3,99
Nrxn3Q6P9K9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,99■■■■□ 3,99
Nrxn3Q6P9K9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,95■■■■□ 3,99
Nrxn3Q6P9K9 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,94■■■■□ 3,98
Nrxn3Q6P9K9 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC39,93■■■■□ 3,98
Nrxn3Q6P9K9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC39,89■■■■□ 3,98
Nrxn3Q6P9K9 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC39,88■■■■□ 3,97
Nrxn3Q6P9K9 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39,87■■■■□ 3,97
Nrxn3Q6P9K9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,86■■■■□ 3,97
Nrxn3Q6P9K9 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC39,84■■■■□ 3,97
Nrxn3Q6P9K9 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,75■■■■□ 3,95
Nrxn3Q6P9K9 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC39,7■■■■□ 3,95
Nrxn3Q6P9K9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC39,67■■■■□ 3,94
Nrxn3Q6P9K9 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC39,67■■■■□ 3,94
Nrxn3Q6P9K9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,66■■■■□ 3,94
Nrxn3Q6P9K9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,63■■■■□ 3,93
Nrxn3Q6P9K9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC39,61■■■■□ 3,93
Nrxn3Q6P9K9 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC39,59■■■■□ 3,93
Nrxn3Q6P9K9 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC39,58■■■■□ 3,93
Nrxn3Q6P9K9 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,58■■■■□ 3,93
Nrxn3Q6P9K9 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39,54■■■■□ 3,92
Nrxn3Q6P9K9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC39,51■■■■□ 3,92
Nrxn3Q6P9K9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC39,5■■■■□ 3,91
Nrxn3Q6P9K9 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,49■■■■□ 3,91
Nrxn3Q6P9K9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC39,42■■■■□ 3,9
Nrxn3Q6P9K9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC39,41■■■■□ 3,9
Nrxn3Q6P9K9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,38■■■■□ 3,89
Nrxn3Q6P9K9 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,33■■■■□ 3,89
Nrxn3Q6P9K9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC39,3■■■■□ 3,88
Nrxn3Q6P9K9 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,3■■■■□ 3,88
Nrxn3Q6P9K9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC39,29■■■■□ 3,88
Nrxn3Q6P9K9 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC39,28■■■■□ 3,88
Nrxn3Q6P9K9 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,24■■■■□ 3,87
Nrxn3Q6P9K9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39,23■■■■□ 3,87
Nrxn3Q6P9K9 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,2■■■■□ 3,87
Nrxn3Q6P9K9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC39,1■■■■□ 3,85
Nrxn3Q6P9K9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39,1■■■■□ 3,85
Nrxn3Q6P9K9 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC39,05■■■■□ 3,84
Nrxn3Q6P9K9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC39,02■■■■□ 3,84
Nrxn3Q6P9K9 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC39,01■■■■□ 3,84
Nrxn3Q6P9K9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC38,98■■■■□ 3,83
Nrxn3Q6P9K9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38,98■■■■□ 3,83
Nrxn3Q6P9K9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC38,93■■■■□ 3,82
Nrxn3Q6P9K9 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC38,92■■■■□ 3,82
Nrxn3Q6P9K9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC38,91■■■■□ 3,82
Nrxn3Q6P9K9 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC38,88■■■■□ 3,81
Nrxn3Q6P9K9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,87■■■■□ 3,81
Nrxn3Q6P9K9 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,86■■■■□ 3,81
Nrxn3Q6P9K9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC38,83■■■■□ 3,81
Nrxn3Q6P9K9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC38,82■■■■□ 3,81
Nrxn3Q6P9K9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,8■■■■□ 3,8
Nrxn3Q6P9K9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38,79■■■■□ 3,8
Nrxn3Q6P9K9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC38,78■■■■□ 3,8
Nrxn3Q6P9K9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,77■■■■□ 3,8
Nrxn3Q6P9K9 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,76■■■■□ 3,8
Nrxn3Q6P9K9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC38,75■■■■□ 3,79
Nrxn3Q6P9K9 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,74■■■■□ 3,79
Nrxn3Q6P9K9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,71■■■■□ 3,79
Nrxn3Q6P9K9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC38,7■■■■□ 3,79
Nrxn3Q6P9K9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,69■■■■□ 3,78
Nrxn3Q6P9K9 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,68■■■■□ 3,78
Nrxn3Q6P9K9 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,66■■■■□ 3,78
Nrxn3Q6P9K9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC38,65■■■■□ 3,78
Nrxn3Q6P9K9 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC38,64■■■■□ 3,78
Nrxn3Q6P9K9 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC38,6■■■■□ 3,77
Nrxn3Q6P9K9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38,58■■■■□ 3,77
Nrxn3Q6P9K9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC38,56■■■■□ 3,76
Nrxn3Q6P9K9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC38,52■■■■□ 3,76
Nrxn3Q6P9K9 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,52■■■■□ 3,76
Nrxn3Q6P9K9 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,5■■■■□ 3,75
Nrxn3Q6P9K9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,48■■■■□ 3,75
Nrxn3Q6P9K9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,47■■■■□ 3,75
Nrxn3Q6P9K9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC38,47■■■■□ 3,75
Nrxn3Q6P9K9 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC38,46■■■■□ 3,75
Nrxn3Q6P9K9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC38,46■■■■□ 3,75
Nrxn3Q6P9K9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC38,44■■■■□ 3,74
Nrxn3Q6P9K9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC38,43■■■■□ 3,74
Nrxn3Q6P9K9 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC38,41■■■■□ 3,74
Nrxn3Q6P9K9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,4■■■■□ 3,74
Nrxn3Q6P9K9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC38,4■■■■□ 3,74
Nrxn3Q6P9K9 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,4■■■■□ 3,74
Nrxn3Q6P9K9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC38,39■■■■□ 3,74
Nrxn3Q6P9K9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,34■■■■□ 3,73
Nrxn3Q6P9K9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC38,33■■■■□ 3,73
Nrxn3Q6P9K9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Nrxn3Q6P9K9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,31■■■■□ 3,72
Nrxn3Q6P9K9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC38,27■■■■□ 3,72
Nrxn3Q6P9K9 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,23■■■■□ 3,71
Nrxn3Q6P9K9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC38,21■■■■□ 3,71
Nrxn3Q6P9K9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC38,21■■■■□ 3,71
Nrxn3Q6P9K9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC38,2■■■■□ 3,71
Nrxn3Q6P9K9 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,19■■■■□ 3,7
Nrxn3Q6P9K9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,16■■■■□ 3,7
Nrxn3Q6P9K9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Nrxn3Q6P9K9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC38,13■■■■□ 3,69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,5 ms