Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9K8

Caskin1, Caskin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caskin1Q6P9K8 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42,77■■■■■ 4,44
Caskin1Q6P9K8 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
Caskin1Q6P9K8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,75■■■■■ 4,43
Caskin1Q6P9K8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC42,72■■■■■ 4,43
Caskin1Q6P9K8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC42,67■■■■■ 4,42
Caskin1Q6P9K8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,67■■■■■ 4,42
Caskin1Q6P9K8 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42,63■■■■■ 4,42
Caskin1Q6P9K8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,62■■■■■ 4,41
Caskin1Q6P9K8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,55■■■■■ 4,4
Caskin1Q6P9K8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC42,54■■■■■ 4,4
Caskin1Q6P9K8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42,53■■■■■ 4,4
Caskin1Q6P9K8 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,5■■■■■ 4,39
Caskin1Q6P9K8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,5■■■■■ 4,39
Caskin1Q6P9K8 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC42,47■■■■■ 4,39
Caskin1Q6P9K8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,46■■■■■ 4,39
Caskin1Q6P9K8 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,38■■■■■ 4,38
Caskin1Q6P9K8 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42,37■■■■■ 4,37
Caskin1Q6P9K8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC42,32■■■■■ 4,37
Caskin1Q6P9K8 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,26■■■■■ 4,36
Caskin1Q6P9K8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,19■■■■■ 4,34
Caskin1Q6P9K8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,1■■■■■ 4,33
Caskin1Q6P9K8 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,1■■■■■ 4,33
Caskin1Q6P9K8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,09■■■■■ 4,33
Caskin1Q6P9K8 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42,01■■■■■ 4,32
Caskin1Q6P9K8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC42,01■■■■■ 4,31
Caskin1Q6P9K8 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC41,98■■■■■ 4,31
Caskin1Q6P9K8 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,95■■■■■ 4,31
Caskin1Q6P9K8 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC41,84■■■■■ 4,29
Caskin1Q6P9K8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC41,81■■■■■ 4,28
Caskin1Q6P9K8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC41,78■■■■■ 4,28
Caskin1Q6P9K8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
Caskin1Q6P9K8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC41,77■■■■■ 4,28
Caskin1Q6P9K8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,7■■■■■ 4,27
Caskin1Q6P9K8 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,69■■■■■ 4,27
Caskin1Q6P9K8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC41,69■■■■■ 4,26
Caskin1Q6P9K8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41,65■■■■■ 4,26
Caskin1Q6P9K8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,65■■■■■ 4,26
Caskin1Q6P9K8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,64■■■■■ 4,26
Caskin1Q6P9K8 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC41,62■■■■■ 4,25
Caskin1Q6P9K8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC41,62■■■■■ 4,25
Caskin1Q6P9K8 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC41,59■■■■■ 4,25
Caskin1Q6P9K8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC41,59■■■■■ 4,25
Caskin1Q6P9K8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41,57■■■■■ 4,24
Caskin1Q6P9K8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC41,55■■■■■ 4,24
Caskin1Q6P9K8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,51■■■■■ 4,24
Caskin1Q6P9K8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC41,5■■■■■ 4,23
Caskin1Q6P9K8 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,48■■■■■ 4,23
Caskin1Q6P9K8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC41,47■■■■■ 4,23
Caskin1Q6P9K8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41,44■■■■■ 4,22
Caskin1Q6P9K8 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,38■■■■■ 4,22
Caskin1Q6P9K8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,36■■■■■ 4,21
Caskin1Q6P9K8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC41,35■■■■■ 4,21
Caskin1Q6P9K8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,32■■■■■ 4,21
Caskin1Q6P9K8 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,31■■■■■ 4,2
Caskin1Q6P9K8 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,26■■■■■ 4,2
Caskin1Q6P9K8 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,18■■■■■ 4,18
Caskin1Q6P9K8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,17■■■■■ 4,18
Caskin1Q6P9K8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC41,16■■■■■ 4,18
Caskin1Q6P9K8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,16■■■■■ 4,18
Caskin1Q6P9K8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
Caskin1Q6P9K8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Caskin1Q6P9K8 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC41,08■■■■■ 4,17
Caskin1Q6P9K8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,08■■■■■ 4,17
Caskin1Q6P9K8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,05■■■■■ 4,16
Caskin1Q6P9K8 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC41,04■■■■■ 4,16
Caskin1Q6P9K8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4,15
Caskin1Q6P9K8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC40,97■■■■■ 4,15
Caskin1Q6P9K8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Caskin1Q6P9K8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC40,92■■■■■ 4,14
Caskin1Q6P9K8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC40,83■■■■■ 4,13
Caskin1Q6P9K8 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
Caskin1Q6P9K8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,8■■■■■ 4,12
Caskin1Q6P9K8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40,79■■■■■ 4,12
Caskin1Q6P9K8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Caskin1Q6P9K8 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40,78■■■■■ 4,12
Caskin1Q6P9K8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC40,77■■■■■ 4,12
Caskin1Q6P9K8 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC40,75■■■■■ 4,11
Caskin1Q6P9K8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC40,72■■■■■ 4,11
Caskin1Q6P9K8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC40,71■■■■■ 4,11
Caskin1Q6P9K8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,68■■■■■ 4,1
Caskin1Q6P9K8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC40,67■■■■■ 4,1
Caskin1Q6P9K8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Caskin1Q6P9K8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Caskin1Q6P9K8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40,61■■■■■ 4,09
Caskin1Q6P9K8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40,6■■■■■ 4,09
Caskin1Q6P9K8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Caskin1Q6P9K8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
Caskin1Q6P9K8 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40,54■■■■■ 4,08
Caskin1Q6P9K8 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Caskin1Q6P9K8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,53■■■■■ 4,08
Caskin1Q6P9K8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Caskin1Q6P9K8 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Caskin1Q6P9K8 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,49■■■■■ 4,07
Caskin1Q6P9K8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,47■■■■■ 4,07
Caskin1Q6P9K8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC40,45■■■■■ 4,07
Caskin1Q6P9K8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC40,44■■■■■ 4,06
Caskin1Q6P9K8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40,44■■■■■ 4,06
Caskin1Q6P9K8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,44■■■■■ 4,06
Caskin1Q6P9K8 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC40,43■■■■■ 4,06
Caskin1Q6P9K8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC40,4■■■■■ 4,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,5 ms