Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1D5

Sez6l, Seizure 6-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 963 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sez6lQ6P1D5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sez6lQ6P1D5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
Sez6lQ6P1D5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
Sez6lQ6P1D5 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
Sez6lQ6P1D5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sez6lQ6P1D5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Sez6lQ6P1D5 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
Sez6lQ6P1D5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Sez6lQ6P1D5 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Sez6lQ6P1D5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
Sez6lQ6P1D5 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
Sez6lQ6P1D5 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC33.09■■■□□ 2.89
Sez6lQ6P1D5 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Sez6lQ6P1D5 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Sez6lQ6P1D5 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC32.98■■■□□ 2.87
Sez6lQ6P1D5 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC32.95■■■□□ 2.87
Sez6lQ6P1D5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC32.94■■■□□ 2.86
Sez6lQ6P1D5 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Sez6lQ6P1D5 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Sez6lQ6P1D5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Sez6lQ6P1D5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC32.79■■■□□ 2.84
Sez6lQ6P1D5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Sez6lQ6P1D5 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sez6lQ6P1D5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Sez6lQ6P1D5 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Sez6lQ6P1D5 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Sez6lQ6P1D5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Sez6lQ6P1D5 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Sez6lQ6P1D5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Sez6lQ6P1D5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Sez6lQ6P1D5 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
Sez6lQ6P1D5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC32.63■■■□□ 2.81
Sez6lQ6P1D5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
Sez6lQ6P1D5 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
Sez6lQ6P1D5 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
Sez6lQ6P1D5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sez6lQ6P1D5 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sez6lQ6P1D5 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
Sez6lQ6P1D5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
Sez6lQ6P1D5 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
Sez6lQ6P1D5 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Sez6lQ6P1D5 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
Sez6lQ6P1D5 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
Sez6lQ6P1D5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
Sez6lQ6P1D5 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sez6lQ6P1D5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
Sez6lQ6P1D5 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
Sez6lQ6P1D5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.4■■■□□ 2.78
Sez6lQ6P1D5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
Sez6lQ6P1D5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Sez6lQ6P1D5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.77
Sez6lQ6P1D5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Sez6lQ6P1D5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Sez6lQ6P1D5 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Sez6lQ6P1D5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Sez6lQ6P1D5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Sez6lQ6P1D5 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sez6lQ6P1D5 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
Sez6lQ6P1D5 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sez6lQ6P1D5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Sez6lQ6P1D5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
Sez6lQ6P1D5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Sez6lQ6P1D5 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Sez6lQ6P1D5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
Sez6lQ6P1D5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Sez6lQ6P1D5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
Sez6lQ6P1D5 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sez6lQ6P1D5 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
Sez6lQ6P1D5 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sez6lQ6P1D5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Sez6lQ6P1D5 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
Sez6lQ6P1D5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
Sez6lQ6P1D5 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Sez6lQ6P1D5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
Sez6lQ6P1D5 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Sez6lQ6P1D5 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Sez6lQ6P1D5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.69
Sez6lQ6P1D5 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
Sez6lQ6P1D5 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Sez6lQ6P1D5 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
Sez6lQ6P1D5 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC31.81■■■□□ 2.68
Sez6lQ6P1D5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
Sez6lQ6P1D5 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Sez6lQ6P1D5 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.78■■■□□ 2.68
Sez6lQ6P1D5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Sez6lQ6P1D5 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Sez6lQ6P1D5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Sez6lQ6P1D5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
Sez6lQ6P1D5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sez6lQ6P1D5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
Sez6lQ6P1D5 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC31.67■■■□□ 2.66
Sez6lQ6P1D5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Sez6lQ6P1D5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC31.64■■■□□ 2.66
Sez6lQ6P1D5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.64■■■□□ 2.66
Sez6lQ6P1D5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC31.63■■■□□ 2.65
Sez6lQ6P1D5 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC31.62■■■□□ 2.65
Sez6lQ6P1D5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
Sez6lQ6P1D5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sez6lQ6P1D5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Sez6lQ6P1D5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms