Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF8

Rapgefl1, Rap guanine nucleotide exchange factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgefl1Q68EF8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rapgefl1Q68EF8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Rapgefl1Q68EF8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rapgefl1Q68EF8 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Rapgefl1Q68EF8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Rapgefl1Q68EF8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
Rapgefl1Q68EF8 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Rapgefl1Q68EF8 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Rapgefl1Q68EF8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Rapgefl1Q68EF8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rapgefl1Q68EF8 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Rapgefl1Q68EF8 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rapgefl1Q68EF8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Rapgefl1Q68EF8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Rapgefl1Q68EF8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Rapgefl1Q68EF8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rapgefl1Q68EF8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Rapgefl1Q68EF8 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
Rapgefl1Q68EF8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rapgefl1Q68EF8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Rapgefl1Q68EF8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Rapgefl1Q68EF8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Rapgefl1Q68EF8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rapgefl1Q68EF8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Rapgefl1Q68EF8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rapgefl1Q68EF8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Rapgefl1Q68EF8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Rapgefl1Q68EF8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Rapgefl1Q68EF8 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rapgefl1Q68EF8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Rapgefl1Q68EF8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rapgefl1Q68EF8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rapgefl1Q68EF8 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Rapgefl1Q68EF8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rapgefl1Q68EF8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Rapgefl1Q68EF8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Rapgefl1Q68EF8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
Rapgefl1Q68EF8 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rapgefl1Q68EF8 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Rapgefl1Q68EF8 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Rapgefl1Q68EF8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Rapgefl1Q68EF8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rapgefl1Q68EF8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rapgefl1Q68EF8 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rapgefl1Q68EF8 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Rapgefl1Q68EF8 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Rapgefl1Q68EF8 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgefl1Q68EF8 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgefl1Q68EF8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Rapgefl1Q68EF8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Rapgefl1Q68EF8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.76■■■□□ 2.99
Rapgefl1Q68EF8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Rapgefl1Q68EF8 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Rapgefl1Q68EF8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgefl1Q68EF8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Rapgefl1Q68EF8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Rapgefl1Q68EF8 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
Rapgefl1Q68EF8 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rapgefl1Q68EF8 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
Rapgefl1Q68EF8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Rapgefl1Q68EF8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rapgefl1Q68EF8 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Rapgefl1Q68EF8 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rapgefl1Q68EF8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rapgefl1Q68EF8 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Rapgefl1Q68EF8 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rapgefl1Q68EF8 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Rapgefl1Q68EF8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rapgefl1Q68EF8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
Rapgefl1Q68EF8 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Rapgefl1Q68EF8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rapgefl1Q68EF8 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Rapgefl1Q68EF8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.37■■■□□ 2.93
Rapgefl1Q68EF8 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Rapgefl1Q68EF8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Rapgefl1Q68EF8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rapgefl1Q68EF8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
Rapgefl1Q68EF8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rapgefl1Q68EF8 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Rapgefl1Q68EF8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
Rapgefl1Q68EF8 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
Rapgefl1Q68EF8 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.26■■■□□ 2.91
Rapgefl1Q68EF8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Rapgefl1Q68EF8 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
Rapgefl1Q68EF8 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Rapgefl1Q68EF8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rapgefl1Q68EF8 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rapgefl1Q68EF8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.18■■■□□ 2.9
Rapgefl1Q68EF8 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Rapgefl1Q68EF8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
Rapgefl1Q68EF8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Rapgefl1Q68EF8 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Rapgefl1Q68EF8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
Rapgefl1Q68EF8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
Rapgefl1Q68EF8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Rapgefl1Q68EF8 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
Rapgefl1Q68EF8 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.91■■■□□ 2.86
Rapgefl1Q68EF8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
Rapgefl1Q68EF8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC32.89■■■□□ 2.86
Rapgefl1Q68EF8 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC32.87■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms