Protein–RNA interactions for Protein: Q64511

Top2b, DNA topoisomerase 2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2bQ64511 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC48.21■■■■■ 5.31
Top2bQ64511 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC48.21■■■■■ 5.31
Top2bQ64511 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC48.12■■■■■ 5.29
Top2bQ64511 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC48.1■■■■■ 5.29
Top2bQ64511 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC48.09■■■■■ 5.29
Top2bQ64511 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.09■■■■■ 5.29
Top2bQ64511 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.08■■■■■ 5.29
Top2bQ64511 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.06■■■■■ 5.28
Top2bQ64511 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.02■■■■■ 5.28
Top2bQ64511 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48■■■■■ 5.27
Top2bQ64511 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC47.9■■■■■ 5.26
Top2bQ64511 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.85■■■■■ 5.25
Top2bQ64511 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC47.83■■■■■ 5.25
Top2bQ64511 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.79■■■■■ 5.24
Top2bQ64511 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC47.74■■■■■ 5.23
Top2bQ64511 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.58■■■■■ 5.21
Top2bQ64511 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC47.56■■■■■ 5.2
Top2bQ64511 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC47.56■■■■■ 5.2
Top2bQ64511 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC47.53■■■■■ 5.2
Top2bQ64511 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.52■■■■■ 5.2
Top2bQ64511 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.5■■■■■ 5.19
Top2bQ64511 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC47.5■■■■■ 5.19
Top2bQ64511 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC47.49■■■■■ 5.19
Top2bQ64511 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.48■■■■■ 5.19
Top2bQ64511 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.46■■■■■ 5.19
Top2bQ64511 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.44■■■■■ 5.18
Top2bQ64511 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.43■■■■■ 5.18
Top2bQ64511 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.4■■■■■ 5.18
Top2bQ64511 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC47.38■■■■■ 5.17
Top2bQ64511 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC47.36■■■■■ 5.17
Top2bQ64511 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC47.34■■■■■ 5.17
Top2bQ64511 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.2■■■■■ 5.15
Top2bQ64511 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC47.2■■■■■ 5.15
Top2bQ64511 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC47.13■■■■■ 5.14
Top2bQ64511 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC47.11■■■■■ 5.13
Top2bQ64511 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47.03■■■■■ 5.12
Top2bQ64511 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC47■■■■■ 5.11
Top2bQ64511 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC46.94■■■■■ 5.1
Top2bQ64511 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC46.9■■■■■ 5.1
Top2bQ64511 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
Top2bQ64511 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC46.87■■■■■ 5.09
Top2bQ64511 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC46.83■■■■■ 5.09
Top2bQ64511 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
Top2bQ64511 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
Top2bQ64511 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC46.8■■■■■ 5.08
Top2bQ64511 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC46.8■■■■■ 5.08
Top2bQ64511 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
Top2bQ64511 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
Top2bQ64511 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.08
Top2bQ64511 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.75■■■■■ 5.07
Top2bQ64511 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
Top2bQ64511 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
Top2bQ64511 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.67■■■■■ 5.06
Top2bQ64511 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
Top2bQ64511 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
Top2bQ64511 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC46.56■■■■■ 5.04
Top2bQ64511 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Top2bQ64511 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC46.45■■■■■ 5.03
Top2bQ64511 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
Top2bQ64511 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.42■■■■■ 5.02
Top2bQ64511 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.42■■■■■ 5.02
Top2bQ64511 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC46.37■■■■■ 5.01
Top2bQ64511 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.32■■■■■ 5.01
Top2bQ64511 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC46.29■■■■■ 5
Top2bQ64511 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC46.27■■■■■ 5
Top2bQ64511 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC46.27■■■■■ 5
Top2bQ64511 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.24■■■■■ 4.99
Top2bQ64511 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Top2bQ64511 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC46.23■■■■■ 4.99
Top2bQ64511 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Top2bQ64511 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Top2bQ64511 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC46.21■■■■■ 4.99
Top2bQ64511 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.19■■■■■ 4.99
Top2bQ64511 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC46.18■■■■■ 4.98
Top2bQ64511 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC46.14■■■■■ 4.98
Top2bQ64511 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC46.13■■■■■ 4.97
Top2bQ64511 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC46.05■■■■■ 4.96
Top2bQ64511 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC45.96■■■■■ 4.95
Top2bQ64511 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.94■■■■■ 4.94
Top2bQ64511 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC45.93■■■■■ 4.94
Top2bQ64511 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC45.89■■■■■ 4.94
Top2bQ64511 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC45.84■■■■■ 4.93
Top2bQ64511 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC45.83■■■■■ 4.93
Top2bQ64511 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC45.78■■■■■ 4.92
Top2bQ64511 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC45.78■■■■■ 4.92
Top2bQ64511 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC45.76■■■■■ 4.92
Top2bQ64511 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC45.75■■■■■ 4.91
Top2bQ64511 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC45.73■■■■■ 4.91
Top2bQ64511 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.73■■■■■ 4.91
Top2bQ64511 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.72■■■■■ 4.91
Top2bQ64511 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC45.71■■■■■ 4.91
Top2bQ64511 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC45.67■■■■■ 4.9
Top2bQ64511 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC45.65■■■■■ 4.9
Top2bQ64511 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC45.64■■■■■ 4.9
Top2bQ64511 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC45.64■■■■■ 4.9
Top2bQ64511 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC45.62■■■■■ 4.89
Top2bQ64511 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC45.58■■■■■ 4.89
Top2bQ64511 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC45.57■■■■■ 4.89
Top2bQ64511 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC45.54■■■■■ 4.88
Top2bQ64511 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC45.53■■■■■ 4.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.8 ms