Protein–RNA interactions for Protein: Q62431

Arid3a, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, mousemouse

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arid3aQ62431 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
Arid3aQ62431 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC35.22■■■■□ 3.23
Arid3aQ62431 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.13■■■■□ 3.22
Arid3aQ62431 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.11■■■■□ 3.21
Arid3aQ62431 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Arid3aQ62431 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Arid3aQ62431 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Arid3aQ62431 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Arid3aQ62431 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.2
Arid3aQ62431 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Arid3aQ62431 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Arid3aQ62431 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Arid3aQ62431 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Arid3aQ62431 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC34.89■■■■□ 3.18
Arid3aQ62431 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Arid3aQ62431 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.89■■■■□ 3.18
Arid3aQ62431 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC34.86■■■■□ 3.17
Arid3aQ62431 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Arid3aQ62431 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Arid3aQ62431 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Arid3aQ62431 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Arid3aQ62431 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Arid3aQ62431 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Arid3aQ62431 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Arid3aQ62431 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Arid3aQ62431 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Arid3aQ62431 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.11
Arid3aQ62431 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Arid3aQ62431 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Arid3aQ62431 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Arid3aQ62431 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Arid3aQ62431 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Arid3aQ62431 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
Arid3aQ62431 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Arid3aQ62431 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Arid3aQ62431 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Arid3aQ62431 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Arid3aQ62431 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC34.35■■■■□ 3.09
Arid3aQ62431 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Arid3aQ62431 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Arid3aQ62431 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Arid3aQ62431 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Arid3aQ62431 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Arid3aQ62431 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Arid3aQ62431 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
Arid3aQ62431 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC34.22■■■■□ 3.07
Arid3aQ62431 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Arid3aQ62431 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Arid3aQ62431 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Arid3aQ62431 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
Arid3aQ62431 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Arid3aQ62431 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
Arid3aQ62431 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Arid3aQ62431 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Arid3aQ62431 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
Arid3aQ62431 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Arid3aQ62431 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Arid3aQ62431 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Arid3aQ62431 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Arid3aQ62431 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Arid3aQ62431 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Arid3aQ62431 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Arid3aQ62431 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Arid3aQ62431 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Arid3aQ62431 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
Arid3aQ62431 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Arid3aQ62431 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
Arid3aQ62431 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC33.77■■■■□ 3
Arid3aQ62431 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Arid3aQ62431 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
Arid3aQ62431 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC33.75■■■□□ 2.99
Arid3aQ62431 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
Arid3aQ62431 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Arid3aQ62431 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Arid3aQ62431 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Arid3aQ62431 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
Arid3aQ62431 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
Arid3aQ62431 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.53■■■□□ 2.96
Arid3aQ62431 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
Arid3aQ62431 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Arid3aQ62431 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Arid3aQ62431 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
Arid3aQ62431 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Arid3aQ62431 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Arid3aQ62431 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
Arid3aQ62431 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Arid3aQ62431 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Arid3aQ62431 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Arid3aQ62431 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC33.43■■■□□ 2.94
Arid3aQ62431 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Arid3aQ62431 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Arid3aQ62431 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Arid3aQ62431 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Arid3aQ62431 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Arid3aQ62431 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Arid3aQ62431 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
Arid3aQ62431 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Arid3aQ62431 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC33.33■■■□□ 2.93
Arid3aQ62431 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.93
Arid3aQ62431 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms