Protein–RNA interactions for Protein: Q62267

Sprr1b, Cornifin-B, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr1bQ62267 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Sprr1bQ62267 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Sprr1bQ62267 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sprr1bQ62267 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Sprr1bQ62267 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sprr1bQ62267 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sprr1bQ62267 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sprr1bQ62267 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sprr1bQ62267 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sprr1bQ62267 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sprr1bQ62267 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sprr1bQ62267 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sprr1bQ62267 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Sprr1bQ62267 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sprr1bQ62267 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sprr1bQ62267 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Sprr1bQ62267 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Sprr1bQ62267 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Sprr1bQ62267 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sprr1bQ62267 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Sprr1bQ62267 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Sprr1bQ62267 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sprr1bQ62267 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Sprr1bQ62267 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sprr1bQ62267 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sprr1bQ62267 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sprr1bQ62267 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sprr1bQ62267 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sprr1bQ62267 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sprr1bQ62267 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sprr1bQ62267 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Sprr1bQ62267 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Sprr1bQ62267 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sprr1bQ62267 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Sprr1bQ62267 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Sprr1bQ62267 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Sprr1bQ62267 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Sprr1bQ62267 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Sprr1bQ62267 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Sprr1bQ62267 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sprr1bQ62267 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sprr1bQ62267 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sprr1bQ62267 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sprr1bQ62267 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sprr1bQ62267 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Sprr1bQ62267 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sprr1bQ62267 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sprr1bQ62267 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sprr1bQ62267 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sprr1bQ62267 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sprr1bQ62267 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sprr1bQ62267 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sprr1bQ62267 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sprr1bQ62267 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sprr1bQ62267 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sprr1bQ62267 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Sprr1bQ62267 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr1bQ62267 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Sprr1bQ62267 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Sprr1bQ62267 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Sprr1bQ62267 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sprr1bQ62267 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Sprr1bQ62267 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr1bQ62267 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Sprr1bQ62267 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Sprr1bQ62267 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr1bQ62267 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr1bQ62267 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr1bQ62267 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Sprr1bQ62267 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Sprr1bQ62267 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Sprr1bQ62267 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sprr1bQ62267 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Sprr1bQ62267 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sprr1bQ62267 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Sprr1bQ62267 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Sprr1bQ62267 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sprr1bQ62267 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Sprr1bQ62267 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sprr1bQ62267 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sprr1bQ62267 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Sprr1bQ62267 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sprr1bQ62267 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Sprr1bQ62267 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sprr1bQ62267 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Sprr1bQ62267 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Sprr1bQ62267 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Sprr1bQ62267 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sprr1bQ62267 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sprr1bQ62267 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Sprr1bQ62267 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sprr1bQ62267 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Sprr1bQ62267 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sprr1bQ62267 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Sprr1bQ62267 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Sprr1bQ62267 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Sprr1bQ62267 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Sprr1bQ62267 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sprr1bQ62267 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Sprr1bQ62267 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms