Protein–RNA interactions for Protein: Q62249

Sox19, Protein SOX-19 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox19Q62249 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Sox19Q62249 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,28■■□□□ 1,32
Sox19Q62249 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23,24■■□□□ 1,31
Sox19Q62249 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Sox19Q62249 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Sox19Q62249 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,17■■□□□ 1,3
Sox19Q62249 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Sox19Q62249 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,13■■□□□ 1,29
Sox19Q62249 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Sox19Q62249 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
Sox19Q62249 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23,07■■□□□ 1,28
Sox19Q62249 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,03■■□□□ 1,28
Sox19Q62249 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Sox19Q62249 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,01■■□□□ 1,27
Sox19Q62249 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,99■■□□□ 1,27
Sox19Q62249 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,98■■□□□ 1,27
Sox19Q62249 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,94■■□□□ 1,26
Sox19Q62249 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC22,93■■□□□ 1,26
Sox19Q62249 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC22,93■■□□□ 1,26
Sox19Q62249 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22,93■■□□□ 1,26
Sox19Q62249 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22,92■■□□□ 1,26
Sox19Q62249 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22,92■■□□□ 1,26
Sox19Q62249 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,89■■□□□ 1,26
Sox19Q62249 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,83■■□□□ 1,24
Sox19Q62249 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22,81■■□□□ 1,24
Sox19Q62249 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Sox19Q62249 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,78■■□□□ 1,24
Sox19Q62249 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22,75■■□□□ 1,23
Sox19Q62249 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC22,72■■□□□ 1,23
Sox19Q62249 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,72■■□□□ 1,23
Sox19Q62249 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Sox19Q62249 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,71■■□□□ 1,23
Sox19Q62249 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC22,66■■□□□ 1,22
Sox19Q62249 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,66■■□□□ 1,22
Sox19Q62249 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,65■■□□□ 1,22
Sox19Q62249 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,64■■□□□ 1,21
Sox19Q62249 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC22,64■■□□□ 1,21
Sox19Q62249 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22,61■■□□□ 1,21
Sox19Q62249 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Sox19Q62249 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22,59■■□□□ 1,21
Sox19Q62249 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Sox19Q62249 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,57■■□□□ 1,2
Sox19Q62249 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22,56■■□□□ 1,2
Sox19Q62249 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,56■■□□□ 1,2
Sox19Q62249 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22,56■■□□□ 1,2
Sox19Q62249 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22,56■■□□□ 1,2
Sox19Q62249 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,54■■□□□ 1,2
Sox19Q62249 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,52■■□□□ 1,2
Sox19Q62249 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22,48■■□□□ 1,19
Sox19Q62249 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Sox19Q62249 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,47■■□□□ 1,19
Sox19Q62249 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,45■■□□□ 1,18
Sox19Q62249 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC22,43■■□□□ 1,18
Sox19Q62249 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,43■■□□□ 1,18
Sox19Q62249 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,41■■□□□ 1,18
Sox19Q62249 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22,41■■□□□ 1,18
Sox19Q62249 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,4■■□□□ 1,18
Sox19Q62249 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22,38■■□□□ 1,17
Sox19Q62249 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Sox19Q62249 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,38■■□□□ 1,17
Sox19Q62249 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Sox19Q62249 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,37■■□□□ 1,17
Sox19Q62249 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Sox19Q62249 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Sox19Q62249 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,36■■□□□ 1,17
Sox19Q62249 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Sox19Q62249 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC22,35■■□□□ 1,17
Sox19Q62249 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22,34■■□□□ 1,17
Sox19Q62249 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22,33■■□□□ 1,17
Sox19Q62249 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Sox19Q62249 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22,32■■□□□ 1,16
Sox19Q62249 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22,32■■□□□ 1,16
Sox19Q62249 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Sox19Q62249 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22,3■■□□□ 1,16
Sox19Q62249 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,3■■□□□ 1,16
Sox19Q62249 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,29■■□□□ 1,16
Sox19Q62249 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC22,27■■□□□ 1,16
Sox19Q62249 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22,27■■□□□ 1,15
Sox19Q62249 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22,26■■□□□ 1,15
Sox19Q62249 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Sox19Q62249 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,24■■□□□ 1,15
Sox19Q62249 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,22■■□□□ 1,15
Sox19Q62249 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22,21■■□□□ 1,15
Sox19Q62249 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Sox19Q62249 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22,19■■□□□ 1,14
Sox19Q62249 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22,18■■□□□ 1,14
Sox19Q62249 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,16■■□□□ 1,14
Sox19Q62249 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,15■■□□□ 1,14
Sox19Q62249 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22,13■■□□□ 1,13
Sox19Q62249 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,11■■□□□ 1,13
Sox19Q62249 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Sox19Q62249 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22,1■■□□□ 1,13
Sox19Q62249 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,09■■□□□ 1,13
Sox19Q62249 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC22,09■■□□□ 1,13
Sox19Q62249 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22,08■■□□□ 1,12
Sox19Q62249 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22,07■■□□□ 1,12
Sox19Q62249 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22,05■■□□□ 1,12
Sox19Q62249 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,04■■□□□ 1,12
Sox19Q62249 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22,03■■□□□ 1,12
Sox19Q62249 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22,03■■□□□ 1,12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,1 ms