Protein–RNA interactions for Protein: Q61526

Erbb3, Receptor tyrosine-protein kinase erbB-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Erbb3Q61526 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Erbb3Q61526 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Erbb3Q61526 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Erbb3Q61526 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,34■■■■□ 3,57
Erbb3Q61526 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,56
Erbb3Q61526 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,3■■■■□ 3,56
Erbb3Q61526 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC37,21■■■■□ 3,55
Erbb3Q61526 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,2■■■■□ 3,55
Erbb3Q61526 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,19■■■■□ 3,54
Erbb3Q61526 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37,19■■■■□ 3,54
Erbb3Q61526 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,18■■■■□ 3,54
Erbb3Q61526 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,09■■■■□ 3,53
Erbb3Q61526 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC37,06■■■■□ 3,52
Erbb3Q61526 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,05■■■■□ 3,52
Erbb3Q61526 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,03■■■■□ 3,52
Erbb3Q61526 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3,51
Erbb3Q61526 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,97■■■■□ 3,51
Erbb3Q61526 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,96■■■■□ 3,51
Erbb3Q61526 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC36,96■■■■□ 3,51
Erbb3Q61526 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC36,95■■■■□ 3,51
Erbb3Q61526 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,94■■■■□ 3,5
Erbb3Q61526 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC36,92■■■■□ 3,5
Erbb3Q61526 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,92■■■■□ 3,5
Erbb3Q61526 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36,92■■■■□ 3,5
Erbb3Q61526 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,86■■■■□ 3,49
Erbb3Q61526 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC36,85■■■■□ 3,49
Erbb3Q61526 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC36,85■■■■□ 3,49
Erbb3Q61526 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC36,84■■■■□ 3,49
Erbb3Q61526 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,84■■■■□ 3,49
Erbb3Q61526 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36,82■■■■□ 3,49
Erbb3Q61526 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,82■■■■□ 3,48
Erbb3Q61526 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC36,81■■■■□ 3,48
Erbb3Q61526 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,78■■■■□ 3,48
Erbb3Q61526 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC36,77■■■■□ 3,48
Erbb3Q61526 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,68■■■■□ 3,46
Erbb3Q61526 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Erbb3Q61526 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,67■■■■□ 3,46
Erbb3Q61526 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC36,65■■■■□ 3,46
Erbb3Q61526 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36,64■■■■□ 3,46
Erbb3Q61526 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,63■■■■□ 3,45
Erbb3Q61526 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,58■■■■□ 3,45
Erbb3Q61526 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC36,56■■■■□ 3,44
Erbb3Q61526 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC36,51■■■■□ 3,43
Erbb3Q61526 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC36,49■■■■□ 3,43
Erbb3Q61526 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC36,46■■■■□ 3,43
Erbb3Q61526 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,42■■■■□ 3,42
Erbb3Q61526 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Erbb3Q61526 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC36,39■■■■□ 3,42
Erbb3Q61526 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,38■■■■□ 3,41
Erbb3Q61526 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,36■■■■□ 3,41
Erbb3Q61526 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC36,34■■■■□ 3,41
Erbb3Q61526 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,33■■■■□ 3,41
Erbb3Q61526 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,28■■■■□ 3,4
Erbb3Q61526 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,27■■■■□ 3,4
Erbb3Q61526 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,26■■■■□ 3,4
Erbb3Q61526 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC36,19■■■■□ 3,38
Erbb3Q61526 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36,18■■■■□ 3,38
Erbb3Q61526 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,17■■■■□ 3,38
Erbb3Q61526 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC36,16■■■■□ 3,38
Erbb3Q61526 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,16■■■■□ 3,38
Erbb3Q61526 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,14■■■■□ 3,38
Erbb3Q61526 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,13■■■■□ 3,37
Erbb3Q61526 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36,13■■■■□ 3,37
Erbb3Q61526 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,12■■■■□ 3,37
Erbb3Q61526 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC36,12■■■■□ 3,37
Erbb3Q61526 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Erbb3Q61526 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC36,11■■■■□ 3,37
Erbb3Q61526 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Erbb3Q61526 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36,1■■■■□ 3,37
Erbb3Q61526 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,09■■■■□ 3,37
Erbb3Q61526 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC36,05■■■■□ 3,36
Erbb3Q61526 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36,04■■■■□ 3,36
Erbb3Q61526 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3,35
Erbb3Q61526 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC35,99■■■■□ 3,35
Erbb3Q61526 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Erbb3Q61526 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC35,93■■■■□ 3,34
Erbb3Q61526 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Erbb3Q61526 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC35,92■■■■□ 3,34
Erbb3Q61526 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Erbb3Q61526 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC35,79■■■■□ 3,32
Erbb3Q61526 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,76■■■■□ 3,31
Erbb3Q61526 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,31
Erbb3Q61526 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC35,75■■■■□ 3,31
Erbb3Q61526 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC35,73■■■■□ 3,31
Erbb3Q61526 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Erbb3Q61526 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Erbb3Q61526 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC35,7■■■■□ 3,31
Erbb3Q61526 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Erbb3Q61526 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC35,69■■■■□ 3,3
Erbb3Q61526 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Erbb3Q61526 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Erbb3Q61526 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC35,63■■■■□ 3,29
Erbb3Q61526 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC35,62■■■■□ 3,29
Erbb3Q61526 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,62■■■■□ 3,29
Erbb3Q61526 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Erbb3Q61526 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Erbb3Q61526 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35,52■■■■□ 3,28
Erbb3Q61526 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Erbb3Q61526 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Erbb3Q61526 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,7 ms