Protein–RNA interactions for Protein: Q60696

Pmel, Melanocyte protein PMEL, mousemouse

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmelQ60696 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PmelQ60696 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PmelQ60696 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PmelQ60696 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PmelQ60696 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PmelQ60696 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PmelQ60696 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PmelQ60696 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PmelQ60696 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PmelQ60696 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PmelQ60696 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PmelQ60696 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PmelQ60696 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PmelQ60696 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PmelQ60696 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PmelQ60696 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PmelQ60696 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PmelQ60696 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PmelQ60696 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PmelQ60696 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
PmelQ60696 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
PmelQ60696 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
PmelQ60696 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PmelQ60696 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PmelQ60696 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PmelQ60696 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PmelQ60696 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PmelQ60696 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PmelQ60696 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PmelQ60696 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PmelQ60696 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PmelQ60696 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
PmelQ60696 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
PmelQ60696 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
PmelQ60696 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
PmelQ60696 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
PmelQ60696 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PmelQ60696 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PmelQ60696 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
PmelQ60696 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
PmelQ60696 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
PmelQ60696 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
PmelQ60696 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
PmelQ60696 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
PmelQ60696 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PmelQ60696 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PmelQ60696 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PmelQ60696 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PmelQ60696 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PmelQ60696 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
PmelQ60696 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PmelQ60696 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PmelQ60696 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
PmelQ60696 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PmelQ60696 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
PmelQ60696 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
PmelQ60696 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PmelQ60696 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
PmelQ60696 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PmelQ60696 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PmelQ60696 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PmelQ60696 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PmelQ60696 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PmelQ60696 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PmelQ60696 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PmelQ60696 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PmelQ60696 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PmelQ60696 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PmelQ60696 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PmelQ60696 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PmelQ60696 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PmelQ60696 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PmelQ60696 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PmelQ60696 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PmelQ60696 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PmelQ60696 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PmelQ60696 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PmelQ60696 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PmelQ60696 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PmelQ60696 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PmelQ60696 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PmelQ60696 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PmelQ60696 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PmelQ60696 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PmelQ60696 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PmelQ60696 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PmelQ60696 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PmelQ60696 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PmelQ60696 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PmelQ60696 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PmelQ60696 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PmelQ60696 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PmelQ60696 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PmelQ60696 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PmelQ60696 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PmelQ60696 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PmelQ60696 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PmelQ60696 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PmelQ60696 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PmelQ60696 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 126.4 ms