Protein–RNA interactions for Protein: Q60665

Skil, Ski-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 675 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SkilQ60665 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
SkilQ60665 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
SkilQ60665 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
SkilQ60665 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
SkilQ60665 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
SkilQ60665 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.17■■■■□ 3.06
SkilQ60665 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SkilQ60665 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
SkilQ60665 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
SkilQ60665 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
SkilQ60665 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
SkilQ60665 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
SkilQ60665 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.97■■■■□ 3.03
SkilQ60665 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
SkilQ60665 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
SkilQ60665 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
SkilQ60665 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
SkilQ60665 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
SkilQ60665 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
SkilQ60665 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SkilQ60665 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
SkilQ60665 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
SkilQ60665 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
SkilQ60665 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
SkilQ60665 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SkilQ60665 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.76■■■■□ 3
SkilQ60665 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.76■■■□□ 2.99
SkilQ60665 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
SkilQ60665 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.73■■■□□ 2.99
SkilQ60665 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
SkilQ60665 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.72■■■□□ 2.99
SkilQ60665 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.71■■■□□ 2.99
SkilQ60665 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.69■■■□□ 2.98
SkilQ60665 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
SkilQ60665 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
SkilQ60665 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SkilQ60665 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
SkilQ60665 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
SkilQ60665 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
SkilQ60665 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
SkilQ60665 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.51■■■□□ 2.95
SkilQ60665 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
SkilQ60665 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
SkilQ60665 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
SkilQ60665 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
SkilQ60665 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
SkilQ60665 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.45■■■□□ 2.95
SkilQ60665 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
SkilQ60665 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
SkilQ60665 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SkilQ60665 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
SkilQ60665 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.35■■■□□ 2.93
SkilQ60665 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
SkilQ60665 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
SkilQ60665 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
SkilQ60665 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.25■■■□□ 2.91
SkilQ60665 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
SkilQ60665 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
SkilQ60665 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
SkilQ60665 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.17■■■□□ 2.9
SkilQ60665 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SkilQ60665 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
SkilQ60665 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
SkilQ60665 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
SkilQ60665 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.06■■■□□ 2.88
SkilQ60665 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
SkilQ60665 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
SkilQ60665 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
SkilQ60665 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
SkilQ60665 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SkilQ60665 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC32.98■■■□□ 2.87
SkilQ60665 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
SkilQ60665 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
SkilQ60665 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
SkilQ60665 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.92■■■□□ 2.86
SkilQ60665 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
SkilQ60665 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC32.84■■■□□ 2.85
SkilQ60665 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
SkilQ60665 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
SkilQ60665 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC32.76■■■□□ 2.84
SkilQ60665 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
SkilQ60665 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
SkilQ60665 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SkilQ60665 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SkilQ60665 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SkilQ60665 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.7■■■□□ 2.83
SkilQ60665 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SkilQ60665 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SkilQ60665 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SkilQ60665 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SkilQ60665 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SkilQ60665 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SkilQ60665 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SkilQ60665 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SkilQ60665 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SkilQ60665 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SkilQ60665 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SkilQ60665 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SkilQ60665 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SkilQ60665 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms