Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1I4

Trav6-2, T cell receptor alpha variable 6-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav6-2Q5R1I4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Trav6-2Q5R1I4 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Trav6-2Q5R1I4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Trav6-2Q5R1I4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Trav6-2Q5R1I4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Trav6-2Q5R1I4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Trav6-2Q5R1I4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trav6-2Q5R1I4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Trav6-2Q5R1I4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Trav6-2Q5R1I4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Trav6-2Q5R1I4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Trav6-2Q5R1I4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Trav6-2Q5R1I4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Trav6-2Q5R1I4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Trav6-2Q5R1I4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Trav6-2Q5R1I4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Trav6-2Q5R1I4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trav6-2Q5R1I4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Trav6-2Q5R1I4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Trav6-2Q5R1I4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Trav6-2Q5R1I4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Trav6-2Q5R1I4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Trav6-2Q5R1I4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Trav6-2Q5R1I4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trav6-2Q5R1I4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Trav6-2Q5R1I4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Trav6-2Q5R1I4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Trav6-2Q5R1I4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Trav6-2Q5R1I4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Trav6-2Q5R1I4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Trav6-2Q5R1I4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Trav6-2Q5R1I4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Trav6-2Q5R1I4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Trav6-2Q5R1I4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trav6-2Q5R1I4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trav6-2Q5R1I4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trav6-2Q5R1I4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Trav6-2Q5R1I4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trav6-2Q5R1I4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trav6-2Q5R1I4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trav6-2Q5R1I4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trav6-2Q5R1I4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Trav6-2Q5R1I4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trav6-2Q5R1I4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trav6-2Q5R1I4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Trav6-2Q5R1I4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Trav6-2Q5R1I4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Trav6-2Q5R1I4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trav6-2Q5R1I4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Trav6-2Q5R1I4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Trav6-2Q5R1I4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Trav6-2Q5R1I4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Trav6-2Q5R1I4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Trav6-2Q5R1I4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Trav6-2Q5R1I4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trav6-2Q5R1I4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trav6-2Q5R1I4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trav6-2Q5R1I4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Trav6-2Q5R1I4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Trav6-2Q5R1I4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trav6-2Q5R1I4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Trav6-2Q5R1I4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trav6-2Q5R1I4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trav6-2Q5R1I4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Trav6-2Q5R1I4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Trav6-2Q5R1I4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Trav6-2Q5R1I4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Trav6-2Q5R1I4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trav6-2Q5R1I4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trav6-2Q5R1I4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Trav6-2Q5R1I4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Trav6-2Q5R1I4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Trav6-2Q5R1I4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Trav6-2Q5R1I4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Trav6-2Q5R1I4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trav6-2Q5R1I4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trav6-2Q5R1I4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Trav6-2Q5R1I4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Trav6-2Q5R1I4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Trav6-2Q5R1I4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Trav6-2Q5R1I4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Trav6-2Q5R1I4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trav6-2Q5R1I4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trav6-2Q5R1I4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trav6-2Q5R1I4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trav6-2Q5R1I4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Trav6-2Q5R1I4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Trav6-2Q5R1I4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
Trav6-2Q5R1I4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trav6-2Q5R1I4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Trav6-2Q5R1I4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Trav6-2Q5R1I4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Trav6-2Q5R1I4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trav6-2Q5R1I4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Trav6-2Q5R1I4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Trav6-2Q5R1I4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Trav6-2Q5R1I4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trav6-2Q5R1I4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Trav6-2Q5R1I4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Trav6-2Q5R1I4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.9 ms