Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl5Q5DTT4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.17■■■■□ 3.7
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.11■■■■□ 3.69
Rtl5Q5DTT4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC38.06■■■■□ 3.68
Rtl5Q5DTT4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC38.02■■■■□ 3.68
Rtl5Q5DTT4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.99■■■■□ 3.67
Rtl5Q5DTT4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC37.97■■■■□ 3.67
Rtl5Q5DTT4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.96■■■■□ 3.67
Rtl5Q5DTT4 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.95■■■■□ 3.67
Rtl5Q5DTT4 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC37.9■■■■□ 3.66
Rtl5Q5DTT4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC37.9■■■■□ 3.66
Rtl5Q5DTT4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.87■■■■□ 3.65
Rtl5Q5DTT4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
Rtl5Q5DTT4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
Rtl5Q5DTT4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC37.82■■■■□ 3.64
Rtl5Q5DTT4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
Rtl5Q5DTT4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.77■■■■□ 3.64
Rtl5Q5DTT4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.72■■■■□ 3.63
Rtl5Q5DTT4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.66■■■■□ 3.62
Rtl5Q5DTT4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC37.65■■■■□ 3.62
Rtl5Q5DTT4 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC37.6■■■■□ 3.61
Rtl5Q5DTT4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Rtl5Q5DTT4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Rtl5Q5DTT4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.49■■■■□ 3.59
Rtl5Q5DTT4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Rtl5Q5DTT4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Rtl5Q5DTT4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Rtl5Q5DTT4 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rtl5Q5DTT4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Rtl5Q5DTT4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC37.42■■■■□ 3.58
Rtl5Q5DTT4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rtl5Q5DTT4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rtl5Q5DTT4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC37.39■■■■□ 3.58
Rtl5Q5DTT4 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Rtl5Q5DTT4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Rtl5Q5DTT4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Rtl5Q5DTT4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
Rtl5Q5DTT4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Rtl5Q5DTT4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC37.26■■■■□ 3.56
Rtl5Q5DTT4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC37.24■■■■□ 3.55
Rtl5Q5DTT4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Rtl5Q5DTT4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
Rtl5Q5DTT4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.17■■■■□ 3.54
Rtl5Q5DTT4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rtl5Q5DTT4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Rtl5Q5DTT4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC37.12■■■■□ 3.53
Rtl5Q5DTT4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
Rtl5Q5DTT4 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.03■■■■□ 3.52
Rtl5Q5DTT4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
Rtl5Q5DTT4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC37.01■■■■□ 3.52
Rtl5Q5DTT4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
Rtl5Q5DTT4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC36.99■■■■□ 3.51
Rtl5Q5DTT4 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.96■■■■□ 3.51
Rtl5Q5DTT4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
Rtl5Q5DTT4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rtl5Q5DTT4 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rtl5Q5DTT4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
Rtl5Q5DTT4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.89■■■■□ 3.5
Rtl5Q5DTT4 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC36.87■■■■□ 3.49
Rtl5Q5DTT4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
Rtl5Q5DTT4 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
Rtl5Q5DTT4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC36.83■■■■□ 3.49
Rtl5Q5DTT4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
Rtl5Q5DTT4 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC36.77■■■■□ 3.48
Rtl5Q5DTT4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC36.73■■■■□ 3.47
Rtl5Q5DTT4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
Rtl5Q5DTT4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC36.68■■■■□ 3.46
Rtl5Q5DTT4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
Rtl5Q5DTT4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
Rtl5Q5DTT4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
Rtl5Q5DTT4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
Rtl5Q5DTT4 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rtl5Q5DTT4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
Rtl5Q5DTT4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rtl5Q5DTT4 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
Rtl5Q5DTT4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rtl5Q5DTT4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
Rtl5Q5DTT4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
Rtl5Q5DTT4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rtl5Q5DTT4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
Rtl5Q5DTT4 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Rtl5Q5DTT4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rtl5Q5DTT4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
Rtl5Q5DTT4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Rtl5Q5DTT4 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Rtl5Q5DTT4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Rtl5Q5DTT4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rtl5Q5DTT4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Rtl5Q5DTT4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Rtl5Q5DTT4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Rtl5Q5DTT4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Rtl5Q5DTT4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rtl5Q5DTT4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Rtl5Q5DTT4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rtl5Q5DTT4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
Rtl5Q5DTT4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.25■■■■□ 3.39
Rtl5Q5DTT4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Rtl5Q5DTT4 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
Rtl5Q5DTT4 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Rtl5Q5DTT4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Rtl5Q5DTT4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms