Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.3■■■■■ 4.68
Arap1Q4LDD4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.29■■■■■ 4.68
Arap1Q4LDD4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.26■■■■■ 4.68
Arap1Q4LDD4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44.19■■■■■ 4.66
Arap1Q4LDD4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
Arap1Q4LDD4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC44.15■■■■■ 4.66
Arap1Q4LDD4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44.14■■■■■ 4.66
Arap1Q4LDD4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44.05■■■■■ 4.64
Arap1Q4LDD4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.98■■■■■ 4.63
Arap1Q4LDD4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Arap1Q4LDD4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.93■■■■■ 4.62
Arap1Q4LDD4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC43.86■■■■■ 4.61
Arap1Q4LDD4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC43.85■■■■■ 4.61
Arap1Q4LDD4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
Arap1Q4LDD4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
Arap1Q4LDD4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Arap1Q4LDD4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
Arap1Q4LDD4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.59
Arap1Q4LDD4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Arap1Q4LDD4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
Arap1Q4LDD4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
Arap1Q4LDD4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43.63■■■■■ 4.57
Arap1Q4LDD4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.55■■■■■ 4.56
Arap1Q4LDD4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Arap1Q4LDD4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Arap1Q4LDD4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43.51■■■■■ 4.55
Arap1Q4LDD4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Arap1Q4LDD4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.54
Arap1Q4LDD4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
Arap1Q4LDD4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
Arap1Q4LDD4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
Arap1Q4LDD4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
Arap1Q4LDD4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
Arap1Q4LDD4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.23■■■■■ 4.51
Arap1Q4LDD4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.16■■■■■ 4.5
Arap1Q4LDD4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC43.08■■■■■ 4.49
Arap1Q4LDD4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
Arap1Q4LDD4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Arap1Q4LDD4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC43.06■■■■■ 4.48
Arap1Q4LDD4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC43.02■■■■■ 4.48
Arap1Q4LDD4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
Arap1Q4LDD4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42.96■■■■■ 4.47
Arap1Q4LDD4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.94■■■■■ 4.46
Arap1Q4LDD4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC42.94■■■■■ 4.46
Arap1Q4LDD4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
Arap1Q4LDD4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.87■■■■■ 4.45
Arap1Q4LDD4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Arap1Q4LDD4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.85■■■■■ 4.45
Arap1Q4LDD4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
Arap1Q4LDD4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42.8■■■■■ 4.44
Arap1Q4LDD4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC42.8■■■■■ 4.44
Arap1Q4LDD4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
Arap1Q4LDD4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC42.79■■■■■ 4.44
Arap1Q4LDD4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Arap1Q4LDD4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.76■■■■■ 4.44
Arap1Q4LDD4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
Arap1Q4LDD4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Arap1Q4LDD4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC42.72■■■■■ 4.43
Arap1Q4LDD4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Arap1Q4LDD4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42.69■■■■■ 4.42
Arap1Q4LDD4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC42.67■■■■■ 4.42
Arap1Q4LDD4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC42.66■■■■■ 4.42
Arap1Q4LDD4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
Arap1Q4LDD4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.55■■■■■ 4.4
Arap1Q4LDD4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Arap1Q4LDD4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.46■■■■■ 4.39
Arap1Q4LDD4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.43■■■■■ 4.38
Arap1Q4LDD4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC42.42■■■■■ 4.38
Arap1Q4LDD4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.38■■■■■ 4.38
Arap1Q4LDD4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
Arap1Q4LDD4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC42.3■■■■■ 4.36
Arap1Q4LDD4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Arap1Q4LDD4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC42.29■■■■■ 4.36
Arap1Q4LDD4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC42.26■■■■■ 4.36
Arap1Q4LDD4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Arap1Q4LDD4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
Arap1Q4LDD4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC42.22■■■■■ 4.35
Arap1Q4LDD4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
Arap1Q4LDD4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Arap1Q4LDD4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.21■■■■■ 4.35
Arap1Q4LDD4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
Arap1Q4LDD4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Arap1Q4LDD4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Arap1Q4LDD4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.16■■■■■ 4.34
Arap1Q4LDD4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC42.09■■■■■ 4.33
Arap1Q4LDD4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.04■■■■■ 4.32
Arap1Q4LDD4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC42.03■■■■■ 4.32
Arap1Q4LDD4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4.31
Arap1Q4LDD4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC42■■■■■ 4.31
Arap1Q4LDD4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.94■■■■■ 4.3
Arap1Q4LDD4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC41.85■■■■■ 4.29
Arap1Q4LDD4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.85■■■■■ 4.29
Arap1Q4LDD4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Arap1Q4LDD4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.8■■■■■ 4.28
Arap1Q4LDD4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41.79■■■■■ 4.28
Arap1Q4LDD4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC41.79■■■■■ 4.28
Arap1Q4LDD4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC41.78■■■■■ 4.28
Arap1Q4LDD4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41.74■■■■■ 4.27
Arap1Q4LDD4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.74■■■■■ 4.27
Arap1Q4LDD4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.73■■■■■ 4.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.6 ms