Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDD4

Arap1, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arap1Q4LDD4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,3■■■■■ 4,68
Arap1Q4LDD4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,29■■■■■ 4,68
Arap1Q4LDD4 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,26■■■■■ 4,68
Arap1Q4LDD4 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC44,19■■■■■ 4,66
Arap1Q4LDD4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC44,15■■■■■ 4,66
Arap1Q4LDD4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC44,15■■■■■ 4,66
Arap1Q4LDD4 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC44,14■■■■■ 4,66
Arap1Q4LDD4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC44,05■■■■■ 4,64
Arap1Q4LDD4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,98■■■■■ 4,63
Arap1Q4LDD4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43,97■■■■■ 4,63
Arap1Q4LDD4 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,93■■■■■ 4,62
Arap1Q4LDD4 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC43,86■■■■■ 4,61
Arap1Q4LDD4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC43,85■■■■■ 4,61
Arap1Q4LDD4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC43,81■■■■■ 4,6
Arap1Q4LDD4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,81■■■■■ 4,6
Arap1Q4LDD4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43,76■■■■■ 4,6
Arap1Q4LDD4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,71■■■■■ 4,59
Arap1Q4LDD4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,69■■■■■ 4,59
Arap1Q4LDD4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43,65■■■■■ 4,58
Arap1Q4LDD4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,65■■■■■ 4,58
Arap1Q4LDD4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC43,64■■■■■ 4,58
Arap1Q4LDD4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC43,63■■■■■ 4,57
Arap1Q4LDD4 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,55■■■■■ 4,56
Arap1Q4LDD4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,53■■■■■ 4,56
Arap1Q4LDD4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,52■■■■■ 4,56
Arap1Q4LDD4 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC43,51■■■■■ 4,55
Arap1Q4LDD4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,47■■■■■ 4,55
Arap1Q4LDD4 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,44■■■■■ 4,54
Arap1Q4LDD4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,43■■■■■ 4,54
Arap1Q4LDD4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,36■■■■■ 4,53
Arap1Q4LDD4 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,32■■■■■ 4,52
Arap1Q4LDD4 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC43,29■■■■■ 4,52
Arap1Q4LDD4 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,26■■■■■ 4,52
Arap1Q4LDD4 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43,23■■■■■ 4,51
Arap1Q4LDD4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43,16■■■■■ 4,5
Arap1Q4LDD4 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC43,08■■■■■ 4,49
Arap1Q4LDD4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43,07■■■■■ 4,48
Arap1Q4LDD4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43,06■■■■■ 4,48
Arap1Q4LDD4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC43,06■■■■■ 4,48
Arap1Q4LDD4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC43,02■■■■■ 4,48
Arap1Q4LDD4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC42,99■■■■■ 4,47
Arap1Q4LDD4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC42,96■■■■■ 4,47
Arap1Q4LDD4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,94■■■■■ 4,46
Arap1Q4LDD4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC42,94■■■■■ 4,46
Arap1Q4LDD4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,9■■■■■ 4,46
Arap1Q4LDD4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,87■■■■■ 4,45
Arap1Q4LDD4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42,86■■■■■ 4,45
Arap1Q4LDD4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,85■■■■■ 4,45
Arap1Q4LDD4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,81■■■■■ 4,44
Arap1Q4LDD4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC42,8■■■■■ 4,44
Arap1Q4LDD4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC42,8■■■■■ 4,44
Arap1Q4LDD4 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,79■■■■■ 4,44
Arap1Q4LDD4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC42,79■■■■■ 4,44
Arap1Q4LDD4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,78■■■■■ 4,44
Arap1Q4LDD4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42,76■■■■■ 4,44
Arap1Q4LDD4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC42,75■■■■■ 4,43
Arap1Q4LDD4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC42,72■■■■■ 4,43
Arap1Q4LDD4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC42,72■■■■■ 4,43
Arap1Q4LDD4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC42,71■■■■■ 4,43
Arap1Q4LDD4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC42,69■■■■■ 4,42
Arap1Q4LDD4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC42,67■■■■■ 4,42
Arap1Q4LDD4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC42,66■■■■■ 4,42
Arap1Q4LDD4 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC42,63■■■■■ 4,42
Arap1Q4LDD4 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,55■■■■■ 4,4
Arap1Q4LDD4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,54■■■■■ 4,4
Arap1Q4LDD4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,46■■■■■ 4,39
Arap1Q4LDD4 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,43■■■■■ 4,38
Arap1Q4LDD4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC42,42■■■■■ 4,38
Arap1Q4LDD4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,38■■■■■ 4,38
Arap1Q4LDD4 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC42,32■■■■■ 4,37
Arap1Q4LDD4 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC42,3■■■■■ 4,36
Arap1Q4LDD4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC42,3■■■■■ 4,36
Arap1Q4LDD4 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC42,29■■■■■ 4,36
Arap1Q4LDD4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC42,26■■■■■ 4,36
Arap1Q4LDD4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC42,23■■■■■ 4,35
Arap1Q4LDD4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC42,23■■■■■ 4,35
Arap1Q4LDD4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC42,22■■■■■ 4,35
Arap1Q4LDD4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,22■■■■■ 4,35
Arap1Q4LDD4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC42,21■■■■■ 4,35
Arap1Q4LDD4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,21■■■■■ 4,35
Arap1Q4LDD4 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,18■■■■■ 4,34
Arap1Q4LDD4 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,17■■■■■ 4,34
Arap1Q4LDD4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42,17■■■■■ 4,34
Arap1Q4LDD4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,16■■■■■ 4,34
Arap1Q4LDD4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC42,09■■■■■ 4,33
Arap1Q4LDD4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,04■■■■■ 4,32
Arap1Q4LDD4 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC42,03■■■■■ 4,32
Arap1Q4LDD4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42■■■■■ 4,31
Arap1Q4LDD4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC42■■■■■ 4,31
Arap1Q4LDD4 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,94■■■■■ 4,3
Arap1Q4LDD4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC41,85■■■■■ 4,29
Arap1Q4LDD4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41,85■■■■■ 4,29
Arap1Q4LDD4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,8■■■■■ 4,28
Arap1Q4LDD4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,8■■■■■ 4,28
Arap1Q4LDD4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC41,79■■■■■ 4,28
Arap1Q4LDD4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC41,79■■■■■ 4,28
Arap1Q4LDD4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC41,78■■■■■ 4,28
Arap1Q4LDD4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC41,74■■■■■ 4,27
Arap1Q4LDD4 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,74■■■■■ 4,27
Arap1Q4LDD4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,73■■■■■ 4,27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12,5 ms