Protein–RNA interactions for Protein: Q3UY96

Cfap74, Cilia- and flagella-associated protein 74, mousemouse

Predictions only

Length 1,578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap74Q3UY96 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42,66■■■■■ 4,42
Cfap74Q3UY96 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42,65■■■■■ 4,42
Cfap74Q3UY96 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,62■■■■■ 4,41
Cfap74Q3UY96 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC42,61■■■■■ 4,41
Cfap74Q3UY96 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,6■■■■■ 4,41
Cfap74Q3UY96 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC42,54■■■■■ 4,4
Cfap74Q3UY96 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,4
Cfap74Q3UY96 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,4
Cfap74Q3UY96 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,51■■■■■ 4,4
Cfap74Q3UY96 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC42,48■■■■■ 4,39
Cfap74Q3UY96 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,43■■■■■ 4,38
Cfap74Q3UY96 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,43■■■■■ 4,38
Cfap74Q3UY96 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42,38■■■■■ 4,37
Cfap74Q3UY96 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,36■■■■■ 4,37
Cfap74Q3UY96 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42,35■■■■■ 4,37
Cfap74Q3UY96 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,27■■■■■ 4,36
Cfap74Q3UY96 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42,19■■■■■ 4,34
Cfap74Q3UY96 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,18■■■■■ 4,34
Cfap74Q3UY96 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,11■■■■■ 4,33
Cfap74Q3UY96 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42,01■■■■■ 4,32
Cfap74Q3UY96 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC42■■■■■ 4,31
Cfap74Q3UY96 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41,92■■■■■ 4,3
Cfap74Q3UY96 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,89■■■■■ 4,3
Cfap74Q3UY96 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC41,88■■■■■ 4,3
Cfap74Q3UY96 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC41,86■■■■■ 4,29
Cfap74Q3UY96 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC41,84■■■■■ 4,29
Cfap74Q3UY96 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,84■■■■■ 4,29
Cfap74Q3UY96 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,82■■■■■ 4,29
Cfap74Q3UY96 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC41,8■■■■■ 4,28
Cfap74Q3UY96 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC41,78■■■■■ 4,28
Cfap74Q3UY96 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,77■■■■■ 4,28
Cfap74Q3UY96 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC41,77■■■■■ 4,28
Cfap74Q3UY96 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC41,77■■■■■ 4,28
Cfap74Q3UY96 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,77■■■■■ 4,28
Cfap74Q3UY96 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,74■■■■■ 4,27
Cfap74Q3UY96 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,74■■■■■ 4,27
Cfap74Q3UY96 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,71■■■■■ 4,27
Cfap74Q3UY96 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41,68■■■■■ 4,26
Cfap74Q3UY96 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC41,63■■■■■ 4,26
Cfap74Q3UY96 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC41,61■■■■■ 4,25
Cfap74Q3UY96 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC41,61■■■■■ 4,25
Cfap74Q3UY96 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC41,59■■■■■ 4,25
Cfap74Q3UY96 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC41,58■■■■■ 4,25
Cfap74Q3UY96 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC41,57■■■■■ 4,25
Cfap74Q3UY96 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC41,52■■■■■ 4,24
Cfap74Q3UY96 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC41,45■■■■■ 4,23
Cfap74Q3UY96 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC41,45■■■■■ 4,23
Cfap74Q3UY96 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,43■■■■■ 4,22
Cfap74Q3UY96 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC41,38■■■■■ 4,22
Cfap74Q3UY96 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,33■■■■■ 4,21
Cfap74Q3UY96 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC41,27■■■■■ 4,2
Cfap74Q3UY96 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,2■■■■■ 4,19
Cfap74Q3UY96 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,19■■■■■ 4,18
Cfap74Q3UY96 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,16■■■■■ 4,18
Cfap74Q3UY96 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41,15■■■■■ 4,18
Cfap74Q3UY96 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC41,14■■■■■ 4,18
Cfap74Q3UY96 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC41,12■■■■■ 4,17
Cfap74Q3UY96 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC41,11■■■■■ 4,17
Cfap74Q3UY96 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC41,1■■■■■ 4,17
Cfap74Q3UY96 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41,1■■■■■ 4,17
Cfap74Q3UY96 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC41,09■■■■■ 4,17
Cfap74Q3UY96 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC41,06■■■■■ 4,16
Cfap74Q3UY96 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC41,05■■■■■ 4,16
Cfap74Q3UY96 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC41,02■■■■■ 4,16
Cfap74Q3UY96 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,99■■■■■ 4,15
Cfap74Q3UY96 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,96■■■■■ 4,15
Cfap74Q3UY96 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC40,95■■■■■ 4,15
Cfap74Q3UY96 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,92■■■■■ 4,14
Cfap74Q3UY96 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,91■■■■■ 4,14
Cfap74Q3UY96 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC40,89■■■■■ 4,14
Cfap74Q3UY96 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,88■■■■■ 4,13
Cfap74Q3UY96 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC40,84■■■■■ 4,13
Cfap74Q3UY96 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,82■■■■■ 4,12
Cfap74Q3UY96 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,81■■■■■ 4,12
Cfap74Q3UY96 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40,79■■■■■ 4,12
Cfap74Q3UY96 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40,76■■■■■ 4,12
Cfap74Q3UY96 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40,75■■■■■ 4,11
Cfap74Q3UY96 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40,71■■■■■ 4,11
Cfap74Q3UY96 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC40,68■■■■■ 4,1
Cfap74Q3UY96 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,67■■■■■ 4,1
Cfap74Q3UY96 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC40,66■■■■■ 4,1
Cfap74Q3UY96 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC40,66■■■■■ 4,1
Cfap74Q3UY96 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC40,66■■■■■ 4,1
Cfap74Q3UY96 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC40,61■■■■■ 4,09
Cfap74Q3UY96 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC40,6■■■■■ 4,09
Cfap74Q3UY96 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,59■■■■■ 4,09
Cfap74Q3UY96 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC40,55■■■■■ 4,08
Cfap74Q3UY96 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Cfap74Q3UY96 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,52■■■■■ 4,08
Cfap74Q3UY96 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40,51■■■■■ 4,08
Cfap74Q3UY96 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC40,5■■■■■ 4,07
Cfap74Q3UY96 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40,5■■■■■ 4,07
Cfap74Q3UY96 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC40,43■■■■■ 4,06
Cfap74Q3UY96 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC40,41■■■■■ 4,06
Cfap74Q3UY96 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC40,41■■■■■ 4,06
Cfap74Q3UY96 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Cfap74Q3UY96 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC40,39■■■■■ 4,06
Cfap74Q3UY96 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40,39■■■■■ 4,06
Cfap74Q3UY96 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40,35■■■■■ 4,05
Cfap74Q3UY96 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40,27■■■■■ 4,04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,2 ms