Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW12

Cnga4, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga4Q3UW12 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnga4Q3UW12 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Cnga4Q3UW12 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Cnga4Q3UW12 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Cnga4Q3UW12 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnga4Q3UW12 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Cnga4Q3UW12 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnga4Q3UW12 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Cnga4Q3UW12 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Cnga4Q3UW12 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Cnga4Q3UW12 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC27.55■■■□□ 2
Cnga4Q3UW12 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Cnga4Q3UW12 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Cnga4Q3UW12 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnga4Q3UW12 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnga4Q3UW12 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Cnga4Q3UW12 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Cnga4Q3UW12 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnga4Q3UW12 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Cnga4Q3UW12 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
Cnga4Q3UW12 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnga4Q3UW12 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
Cnga4Q3UW12 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Cnga4Q3UW12 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Cnga4Q3UW12 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Cnga4Q3UW12 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Cnga4Q3UW12 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Cnga4Q3UW12 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Cnga4Q3UW12 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnga4Q3UW12 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnga4Q3UW12 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Cnga4Q3UW12 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga4Q3UW12 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Cnga4Q3UW12 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Cnga4Q3UW12 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnga4Q3UW12 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Cnga4Q3UW12 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Cnga4Q3UW12 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Cnga4Q3UW12 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnga4Q3UW12 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Cnga4Q3UW12 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnga4Q3UW12 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
Cnga4Q3UW12 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnga4Q3UW12 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Cnga4Q3UW12 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Cnga4Q3UW12 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Cnga4Q3UW12 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnga4Q3UW12 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Cnga4Q3UW12 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Cnga4Q3UW12 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga4Q3UW12 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Cnga4Q3UW12 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Cnga4Q3UW12 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnga4Q3UW12 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Cnga4Q3UW12 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Cnga4Q3UW12 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cnga4Q3UW12 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Cnga4Q3UW12 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cnga4Q3UW12 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Cnga4Q3UW12 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnga4Q3UW12 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnga4Q3UW12 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cnga4Q3UW12 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cnga4Q3UW12 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Cnga4Q3UW12 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Cnga4Q3UW12 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Cnga4Q3UW12 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cnga4Q3UW12 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cnga4Q3UW12 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnga4Q3UW12 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Cnga4Q3UW12 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cnga4Q3UW12 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga4Q3UW12 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cnga4Q3UW12 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnga4Q3UW12 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnga4Q3UW12 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cnga4Q3UW12 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnga4Q3UW12 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cnga4Q3UW12 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga4Q3UW12 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cnga4Q3UW12 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga4Q3UW12 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cnga4Q3UW12 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnga4Q3UW12 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnga4Q3UW12 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cnga4Q3UW12 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cnga4Q3UW12 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cnga4Q3UW12 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga4Q3UW12 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga4Q3UW12 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cnga4Q3UW12 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnga4Q3UW12 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cnga4Q3UW12 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnga4Q3UW12 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cnga4Q3UW12 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cnga4Q3UW12 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cnga4Q3UW12 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnga4Q3UW12 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cnga4Q3UW12 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cnga4Q3UW12 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms