Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Syndig1lQ3USQ7 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Syndig1lQ3USQ7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Syndig1lQ3USQ7 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Syndig1lQ3USQ7 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Syndig1lQ3USQ7 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syndig1lQ3USQ7 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Syndig1lQ3USQ7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Syndig1lQ3USQ7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Syndig1lQ3USQ7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Syndig1lQ3USQ7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Syndig1lQ3USQ7 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Syndig1lQ3USQ7 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syndig1lQ3USQ7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Syndig1lQ3USQ7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Syndig1lQ3USQ7 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Syndig1lQ3USQ7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Syndig1lQ3USQ7 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Syndig1lQ3USQ7 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Syndig1lQ3USQ7 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Syndig1lQ3USQ7 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syndig1lQ3USQ7 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Syndig1lQ3USQ7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Syndig1lQ3USQ7 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Syndig1lQ3USQ7 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syndig1lQ3USQ7 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Syndig1lQ3USQ7 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Syndig1lQ3USQ7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Syndig1lQ3USQ7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Syndig1lQ3USQ7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Syndig1lQ3USQ7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Syndig1lQ3USQ7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Syndig1lQ3USQ7 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syndig1lQ3USQ7 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syndig1lQ3USQ7 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Syndig1lQ3USQ7 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syndig1lQ3USQ7 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syndig1lQ3USQ7 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syndig1lQ3USQ7 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syndig1lQ3USQ7 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syndig1lQ3USQ7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syndig1lQ3USQ7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syndig1lQ3USQ7 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syndig1lQ3USQ7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syndig1lQ3USQ7 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syndig1lQ3USQ7 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Syndig1lQ3USQ7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Syndig1lQ3USQ7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syndig1lQ3USQ7 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syndig1lQ3USQ7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syndig1lQ3USQ7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Syndig1lQ3USQ7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syndig1lQ3USQ7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syndig1lQ3USQ7 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Syndig1lQ3USQ7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syndig1lQ3USQ7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Syndig1lQ3USQ7 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syndig1lQ3USQ7 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syndig1lQ3USQ7 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Syndig1lQ3USQ7 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syndig1lQ3USQ7 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syndig1lQ3USQ7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Syndig1lQ3USQ7 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syndig1lQ3USQ7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syndig1lQ3USQ7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Syndig1lQ3USQ7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syndig1lQ3USQ7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syndig1lQ3USQ7 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Syndig1lQ3USQ7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Syndig1lQ3USQ7 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Syndig1lQ3USQ7 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Syndig1lQ3USQ7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Syndig1lQ3USQ7 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Syndig1lQ3USQ7 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syndig1lQ3USQ7 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syndig1lQ3USQ7 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Syndig1lQ3USQ7 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Syndig1lQ3USQ7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Syndig1lQ3USQ7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Syndig1lQ3USQ7 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syndig1lQ3USQ7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Syndig1lQ3USQ7 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syndig1lQ3USQ7 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Syndig1lQ3USQ7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syndig1lQ3USQ7 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syndig1lQ3USQ7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syndig1lQ3USQ7 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syndig1lQ3USQ7 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syndig1lQ3USQ7 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syndig1lQ3USQ7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syndig1lQ3USQ7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syndig1lQ3USQ7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syndig1lQ3USQ7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syndig1lQ3USQ7 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syndig1lQ3USQ7 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syndig1lQ3USQ7 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syndig1lQ3USQ7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syndig1lQ3USQ7 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syndig1lQ3USQ7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms