Protein–RNA interactions for Protein: Q3U492

Kcp, Kielin/chordin-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,550 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KcpQ3U492 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
KcpQ3U492 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KcpQ3U492 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KcpQ3U492 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KcpQ3U492 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
KcpQ3U492 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
KcpQ3U492 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KcpQ3U492 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KcpQ3U492 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KcpQ3U492 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
KcpQ3U492 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
KcpQ3U492 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
KcpQ3U492 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
KcpQ3U492 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KcpQ3U492 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
KcpQ3U492 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
KcpQ3U492 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
KcpQ3U492 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
KcpQ3U492 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
KcpQ3U492 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
KcpQ3U492 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
KcpQ3U492 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
KcpQ3U492 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
KcpQ3U492 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
KcpQ3U492 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
KcpQ3U492 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
KcpQ3U492 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
KcpQ3U492 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
KcpQ3U492 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KcpQ3U492 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
KcpQ3U492 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
KcpQ3U492 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
KcpQ3U492 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
KcpQ3U492 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
KcpQ3U492 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
KcpQ3U492 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
KcpQ3U492 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
KcpQ3U492 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KcpQ3U492 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KcpQ3U492 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
KcpQ3U492 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
KcpQ3U492 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
KcpQ3U492 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
KcpQ3U492 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
KcpQ3U492 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KcpQ3U492 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
KcpQ3U492 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
KcpQ3U492 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
KcpQ3U492 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
KcpQ3U492 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KcpQ3U492 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
KcpQ3U492 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
KcpQ3U492 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KcpQ3U492 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
KcpQ3U492 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
KcpQ3U492 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
KcpQ3U492 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
KcpQ3U492 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
KcpQ3U492 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KcpQ3U492 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
KcpQ3U492 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
KcpQ3U492 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
KcpQ3U492 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
KcpQ3U492 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KcpQ3U492 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
KcpQ3U492 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
KcpQ3U492 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
KcpQ3U492 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
KcpQ3U492 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KcpQ3U492 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
KcpQ3U492 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
KcpQ3U492 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
KcpQ3U492 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
KcpQ3U492 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
KcpQ3U492 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
KcpQ3U492 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
KcpQ3U492 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
KcpQ3U492 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
KcpQ3U492 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
KcpQ3U492 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
KcpQ3U492 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
KcpQ3U492 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
KcpQ3U492 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
KcpQ3U492 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
KcpQ3U492 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
KcpQ3U492 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
KcpQ3U492 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
KcpQ3U492 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
KcpQ3U492 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
KcpQ3U492 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
KcpQ3U492 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
KcpQ3U492 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
KcpQ3U492 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
KcpQ3U492 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
KcpQ3U492 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
KcpQ3U492 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
KcpQ3U492 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
KcpQ3U492 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
KcpQ3U492 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
KcpQ3U492 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.1 ms