Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1N2

Srebf2, Sterol regulatory element-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srebf2Q3U1N2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,13■■■□□ 2,57
Srebf2Q3U1N2 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31,09■■■□□ 2,57
Srebf2Q3U1N2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,08■■■□□ 2,57
Srebf2Q3U1N2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31,08■■■□□ 2,57
Srebf2Q3U1N2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC31,05■■■□□ 2,56
Srebf2Q3U1N2 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31,04■■■□□ 2,56
Srebf2Q3U1N2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31,03■■■□□ 2,56
Srebf2Q3U1N2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC31,01■■■□□ 2,55
Srebf2Q3U1N2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC30,97■■■□□ 2,55
Srebf2Q3U1N2 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,92■■■□□ 2,54
Srebf2Q3U1N2 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC30,91■■■□□ 2,54
Srebf2Q3U1N2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,9■■■□□ 2,54
Srebf2Q3U1N2 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,9■■■□□ 2,54
Srebf2Q3U1N2 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30,88■■■□□ 2,53
Srebf2Q3U1N2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30,86■■■□□ 2,53
Srebf2Q3U1N2 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC30,85■■■□□ 2,53
Srebf2Q3U1N2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,78■■■□□ 2,52
Srebf2Q3U1N2 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,77■■■□□ 2,52
Srebf2Q3U1N2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC30,75■■■□□ 2,51
Srebf2Q3U1N2 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC30,74■■■□□ 2,51
Srebf2Q3U1N2 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Srebf2Q3U1N2 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,72■■■□□ 2,51
Srebf2Q3U1N2 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Srebf2Q3U1N2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,69■■■□□ 2,5
Srebf2Q3U1N2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,65■■■□□ 2,5
Srebf2Q3U1N2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,6■■■□□ 2,49
Srebf2Q3U1N2 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,49■■■□□ 2,47
Srebf2Q3U1N2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Srebf2Q3U1N2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC30,48■■■□□ 2,47
Srebf2Q3U1N2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,42■■■□□ 2,46
Srebf2Q3U1N2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,41■■■□□ 2,46
Srebf2Q3U1N2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,36■■■□□ 2,45
Srebf2Q3U1N2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC30,34■■■□□ 2,45
Srebf2Q3U1N2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC30,33■■■□□ 2,45
Srebf2Q3U1N2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC30,31■■■□□ 2,44
Srebf2Q3U1N2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,29■■■□□ 2,44
Srebf2Q3U1N2 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,28■■■□□ 2,44
Srebf2Q3U1N2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC30,27■■■□□ 2,44
Srebf2Q3U1N2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30,26■■■□□ 2,43
Srebf2Q3U1N2 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Srebf2Q3U1N2 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,24■■■□□ 2,43
Srebf2Q3U1N2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC30,22■■■□□ 2,43
Srebf2Q3U1N2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC30,22■■■□□ 2,43
Srebf2Q3U1N2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Srebf2Q3U1N2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC30,19■■■□□ 2,42
Srebf2Q3U1N2 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,19■■■□□ 2,42
Srebf2Q3U1N2 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30,18■■■□□ 2,42
Srebf2Q3U1N2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Srebf2Q3U1N2 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30,18■■■□□ 2,42
Srebf2Q3U1N2 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC30,13■■■□□ 2,41
Srebf2Q3U1N2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Srebf2Q3U1N2 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Srebf2Q3U1N2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,1■■■□□ 2,41
Srebf2Q3U1N2 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Srebf2Q3U1N2 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,07■■■□□ 2,4
Srebf2Q3U1N2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Srebf2Q3U1N2 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC30,04■■■□□ 2,4
Srebf2Q3U1N2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Srebf2Q3U1N2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Srebf2Q3U1N2 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Srebf2Q3U1N2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Srebf2Q3U1N2 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Srebf2Q3U1N2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC29,99■■■□□ 2,39
Srebf2Q3U1N2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC29,99■■■□□ 2,39
Srebf2Q3U1N2 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,99■■■□□ 2,39
Srebf2Q3U1N2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Srebf2Q3U1N2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,95■■■□□ 2,39
Srebf2Q3U1N2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC29,93■■■□□ 2,38
Srebf2Q3U1N2 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Srebf2Q3U1N2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Srebf2Q3U1N2 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,87■■■□□ 2,37
Srebf2Q3U1N2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC29,85■■■□□ 2,37
Srebf2Q3U1N2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,84■■■□□ 2,37
Srebf2Q3U1N2 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,81■■■□□ 2,36
Srebf2Q3U1N2 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Srebf2Q3U1N2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Srebf2Q3U1N2 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC29,78■■■□□ 2,36
Srebf2Q3U1N2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Srebf2Q3U1N2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC29,73■■■□□ 2,35
Srebf2Q3U1N2 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Srebf2Q3U1N2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Srebf2Q3U1N2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Srebf2Q3U1N2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Srebf2Q3U1N2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Srebf2Q3U1N2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Srebf2Q3U1N2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,56■■■□□ 2,32
Srebf2Q3U1N2 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,56■■■□□ 2,32
Srebf2Q3U1N2 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Srebf2Q3U1N2 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Srebf2Q3U1N2 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Srebf2Q3U1N2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,52■■■□□ 2,32
Srebf2Q3U1N2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,51■■■□□ 2,31
Srebf2Q3U1N2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Srebf2Q3U1N2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Srebf2Q3U1N2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,47■■■□□ 2,31
Srebf2Q3U1N2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC29,46■■■□□ 2,31
Srebf2Q3U1N2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29,45■■■□□ 2,31
Srebf2Q3U1N2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Srebf2Q3U1N2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Srebf2Q3U1N2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,42■■■□□ 2,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9,3 ms