Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC93

Hs1bp3, HCLS1-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hs1bp3Q3TC93 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Hs1bp3Q3TC93 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Hs1bp3Q3TC93 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
Hs1bp3Q3TC93 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Hs1bp3Q3TC93 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Hs1bp3Q3TC93 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Hs1bp3Q3TC93 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Hs1bp3Q3TC93 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Hs1bp3Q3TC93 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Hs1bp3Q3TC93 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Hs1bp3Q3TC93 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.2■■■■□ 3.07
Hs1bp3Q3TC93 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Hs1bp3Q3TC93 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Hs1bp3Q3TC93 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC34.16■■■■□ 3.06
Hs1bp3Q3TC93 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Hs1bp3Q3TC93 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Hs1bp3Q3TC93 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Hs1bp3Q3TC93 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Hs1bp3Q3TC93 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Hs1bp3Q3TC93 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Hs1bp3Q3TC93 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Hs1bp3Q3TC93 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Hs1bp3Q3TC93 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Hs1bp3Q3TC93 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Hs1bp3Q3TC93 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Hs1bp3Q3TC93 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Hs1bp3Q3TC93 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Hs1bp3Q3TC93 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Hs1bp3Q3TC93 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
Hs1bp3Q3TC93 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Hs1bp3Q3TC93 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3.01
Hs1bp3Q3TC93 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hs1bp3Q3TC93 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
Hs1bp3Q3TC93 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
Hs1bp3Q3TC93 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Hs1bp3Q3TC93 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
Hs1bp3Q3TC93 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Hs1bp3Q3TC93 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
Hs1bp3Q3TC93 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Hs1bp3Q3TC93 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
Hs1bp3Q3TC93 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
Hs1bp3Q3TC93 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
Hs1bp3Q3TC93 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Hs1bp3Q3TC93 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC33.58■■■□□ 2.97
Hs1bp3Q3TC93 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Hs1bp3Q3TC93 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
Hs1bp3Q3TC93 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
Hs1bp3Q3TC93 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
Hs1bp3Q3TC93 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
Hs1bp3Q3TC93 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
Hs1bp3Q3TC93 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Hs1bp3Q3TC93 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Hs1bp3Q3TC93 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
Hs1bp3Q3TC93 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Hs1bp3Q3TC93 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Hs1bp3Q3TC93 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Hs1bp3Q3TC93 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Hs1bp3Q3TC93 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Hs1bp3Q3TC93 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
Hs1bp3Q3TC93 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Hs1bp3Q3TC93 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Hs1bp3Q3TC93 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Hs1bp3Q3TC93 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC33.34■■■□□ 2.93
Hs1bp3Q3TC93 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
Hs1bp3Q3TC93 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
Hs1bp3Q3TC93 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
Hs1bp3Q3TC93 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
Hs1bp3Q3TC93 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
Hs1bp3Q3TC93 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Hs1bp3Q3TC93 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
Hs1bp3Q3TC93 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
Hs1bp3Q3TC93 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hs1bp3Q3TC93 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
Hs1bp3Q3TC93 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC33.16■■■□□ 2.9
Hs1bp3Q3TC93 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.16■■■□□ 2.9
Hs1bp3Q3TC93 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC33.15■■■□□ 2.9
Hs1bp3Q3TC93 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Hs1bp3Q3TC93 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Hs1bp3Q3TC93 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Hs1bp3Q3TC93 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Hs1bp3Q3TC93 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
Hs1bp3Q3TC93 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hs1bp3Q3TC93 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Hs1bp3Q3TC93 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Hs1bp3Q3TC93 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
Hs1bp3Q3TC93 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
Hs1bp3Q3TC93 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC32.92■■■□□ 2.86
Hs1bp3Q3TC93 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
Hs1bp3Q3TC93 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Hs1bp3Q3TC93 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.85■■■□□ 2.85
Hs1bp3Q3TC93 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.84■■■□□ 2.85
Hs1bp3Q3TC93 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Hs1bp3Q3TC93 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Hs1bp3Q3TC93 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hs1bp3Q3TC93 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.8■■■□□ 2.84
Hs1bp3Q3TC93 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC32.79■■■□□ 2.84
Hs1bp3Q3TC93 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Hs1bp3Q3TC93 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Hs1bp3Q3TC93 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Hs1bp3Q3TC93 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms