Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC46

Patl1, Protein PAT1 homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl1Q3TC46 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC25,79■■□□□ 1,72
Patl1Q3TC46 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,79■■□□□ 1,72
Patl1Q3TC46 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,78■■□□□ 1,72
Patl1Q3TC46 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,73■■□□□ 1,71
Patl1Q3TC46 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,72■■□□□ 1,71
Patl1Q3TC46 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,66■■□□□ 1,7
Patl1Q3TC46 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25,61■■□□□ 1,69
Patl1Q3TC46 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Patl1Q3TC46 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Patl1Q3TC46 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Patl1Q3TC46 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Patl1Q3TC46 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Patl1Q3TC46 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Patl1Q3TC46 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Patl1Q3TC46 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Patl1Q3TC46 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25,4■■□□□ 1,66
Patl1Q3TC46 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,4■■□□□ 1,66
Patl1Q3TC46 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25,26■■□□□ 1,63
Patl1Q3TC46 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Patl1Q3TC46 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Patl1Q3TC46 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Patl1Q3TC46 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Patl1Q3TC46 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,21■■□□□ 1,63
Patl1Q3TC46 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Patl1Q3TC46 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Patl1Q3TC46 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Patl1Q3TC46 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,14■■□□□ 1,62
Patl1Q3TC46 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Patl1Q3TC46 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25,09■■□□□ 1,61
Patl1Q3TC46 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Patl1Q3TC46 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,08■■□□□ 1,61
Patl1Q3TC46 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC25,07■■□□□ 1,6
Patl1Q3TC46 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25,07■■□□□ 1,6
Patl1Q3TC46 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,05■■□□□ 1,6
Patl1Q3TC46 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Patl1Q3TC46 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Patl1Q3TC46 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Patl1Q3TC46 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Patl1Q3TC46 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Patl1Q3TC46 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Patl1Q3TC46 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,97■■□□□ 1,59
Patl1Q3TC46 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Patl1Q3TC46 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24,96■■□□□ 1,59
Patl1Q3TC46 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24,95■■□□□ 1,58
Patl1Q3TC46 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,95■■□□□ 1,58
Patl1Q3TC46 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,94■■□□□ 1,58
Patl1Q3TC46 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,92■■□□□ 1,58
Patl1Q3TC46 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Patl1Q3TC46 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,91■■□□□ 1,58
Patl1Q3TC46 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Patl1Q3TC46 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24,88■■□□□ 1,57
Patl1Q3TC46 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24,87■■□□□ 1,57
Patl1Q3TC46 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,86■■□□□ 1,57
Patl1Q3TC46 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Patl1Q3TC46 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24,82■■□□□ 1,56
Patl1Q3TC46 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24,81■■□□□ 1,56
Patl1Q3TC46 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24,79■■□□□ 1,56
Patl1Q3TC46 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24,79■■□□□ 1,56
Patl1Q3TC46 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,78■■□□□ 1,56
Patl1Q3TC46 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Patl1Q3TC46 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Patl1Q3TC46 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,77■■□□□ 1,56
Patl1Q3TC46 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Patl1Q3TC46 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,76■■□□□ 1,55
Patl1Q3TC46 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,75■■□□□ 1,55
Patl1Q3TC46 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,74■■□□□ 1,55
Patl1Q3TC46 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Patl1Q3TC46 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Patl1Q3TC46 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24,73■■□□□ 1,55
Patl1Q3TC46 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,73■■□□□ 1,55
Patl1Q3TC46 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,69■■□□□ 1,54
Patl1Q3TC46 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24,68■■□□□ 1,54
Patl1Q3TC46 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,68■■□□□ 1,54
Patl1Q3TC46 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,67■■□□□ 1,54
Patl1Q3TC46 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Patl1Q3TC46 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Patl1Q3TC46 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Patl1Q3TC46 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,65■■□□□ 1,54
Patl1Q3TC46 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Patl1Q3TC46 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24,65■■□□□ 1,54
Patl1Q3TC46 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24,62■■□□□ 1,53
Patl1Q3TC46 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,61■■□□□ 1,53
Patl1Q3TC46 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24,61■■□□□ 1,53
Patl1Q3TC46 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24,6■■□□□ 1,53
Patl1Q3TC46 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Patl1Q3TC46 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,57■■□□□ 1,52
Patl1Q3TC46 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Patl1Q3TC46 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,56■■□□□ 1,52
Patl1Q3TC46 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Patl1Q3TC46 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24,54■■□□□ 1,52
Patl1Q3TC46 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,53■■□□□ 1,52
Patl1Q3TC46 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,52■■□□□ 1,52
Patl1Q3TC46 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24,52■■□□□ 1,52
Patl1Q3TC46 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,51■■□□□ 1,51
Patl1Q3TC46 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Patl1Q3TC46 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Patl1Q3TC46 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,5■■□□□ 1,51
Patl1Q3TC46 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,47■■□□□ 1,51
Patl1Q3TC46 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,46■■□□□ 1,51
Patl1Q3TC46 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24,45■■□□□ 1,51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,4 ms