Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Rcn1Q05186 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Rcn1Q05186 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27,06■■□□□ 1,92
Rcn1Q05186 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Rcn1Q05186 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Rcn1Q05186 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26,96■■□□□ 1,91
Rcn1Q05186 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26,95■■□□□ 1,91
Rcn1Q05186 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,92■■□□□ 1,9
Rcn1Q05186 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26,9■■□□□ 1,9
Rcn1Q05186 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,88■■□□□ 1,89
Rcn1Q05186 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,87■■□□□ 1,89
Rcn1Q05186 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,85■■□□□ 1,89
Rcn1Q05186 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,84■■□□□ 1,89
Rcn1Q05186 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,83■■□□□ 1,89
Rcn1Q05186 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26,83■■□□□ 1,88
Rcn1Q05186 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,82■■□□□ 1,88
Rcn1Q05186 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26,82■■□□□ 1,88
Rcn1Q05186 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,75■■□□□ 1,87
Rcn1Q05186 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26,72■■□□□ 1,87
Rcn1Q05186 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26,72■■□□□ 1,87
Rcn1Q05186 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26,71■■□□□ 1,87
Rcn1Q05186 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,69■■□□□ 1,86
Rcn1Q05186 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,67■■□□□ 1,86
Rcn1Q05186 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26,66■■□□□ 1,86
Rcn1Q05186 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,64■■□□□ 1,86
Rcn1Q05186 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,58■■□□□ 1,85
Rcn1Q05186 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26,58■■□□□ 1,85
Rcn1Q05186 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,57■■□□□ 1,84
Rcn1Q05186 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26,54■■□□□ 1,84
Rcn1Q05186 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26,53■■□□□ 1,84
Rcn1Q05186 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26,52■■□□□ 1,84
Rcn1Q05186 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,51■■□□□ 1,83
Rcn1Q05186 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Rcn1Q05186 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26,5■■□□□ 1,83
Rcn1Q05186 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26,5■■□□□ 1,83
Rcn1Q05186 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26,49■■□□□ 1,83
Rcn1Q05186 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26,48■■□□□ 1,83
Rcn1Q05186 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,46■■□□□ 1,83
Rcn1Q05186 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26,45■■□□□ 1,83
Rcn1Q05186 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,42■■□□□ 1,82
Rcn1Q05186 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26,41■■□□□ 1,82
Rcn1Q05186 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26,41■■□□□ 1,82
Rcn1Q05186 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26,4■■□□□ 1,82
Rcn1Q05186 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Rcn1Q05186 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Rcn1Q05186 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,37■■□□□ 1,81
Rcn1Q05186 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,36■■□□□ 1,81
Rcn1Q05186 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Rcn1Q05186 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,35■■□□□ 1,81
Rcn1Q05186 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,34■■□□□ 1,81
Rcn1Q05186 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Rcn1Q05186 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,32■■□□□ 1,8
Rcn1Q05186 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,31■■□□□ 1,8
Rcn1Q05186 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26,28■■□□□ 1,8
Rcn1Q05186 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Rcn1Q05186 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Rcn1Q05186 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,21■■□□□ 1,79
Rcn1Q05186 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,19■■□□□ 1,78
Rcn1Q05186 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26,18■■□□□ 1,78
Rcn1Q05186 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26,17■■□□□ 1,78
Rcn1Q05186 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,17■■□□□ 1,78
Rcn1Q05186 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Rcn1Q05186 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26,16■■□□□ 1,78
Rcn1Q05186 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26,14■■□□□ 1,78
Rcn1Q05186 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Rcn1Q05186 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,13■■□□□ 1,77
Rcn1Q05186 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Rcn1Q05186 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26,11■■□□□ 1,77
Rcn1Q05186 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,08■■□□□ 1,77
Rcn1Q05186 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,07■■□□□ 1,76
Rcn1Q05186 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rcn1Q05186 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rcn1Q05186 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,06■■□□□ 1,76
Rcn1Q05186 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26,05■■□□□ 1,76
Rcn1Q05186 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,03■■□□□ 1,76
Rcn1Q05186 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Rcn1Q05186 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,02■■□□□ 1,76
Rcn1Q05186 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Rcn1Q05186 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Rcn1Q05186 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26,01■■□□□ 1,75
Rcn1Q05186 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1,75
Rcn1Q05186 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,98■■□□□ 1,75
Rcn1Q05186 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25,98■■□□□ 1,75
Rcn1Q05186 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25,96■■□□□ 1,75
Rcn1Q05186 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,75
Rcn1Q05186 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Rcn1Q05186 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25,95■■□□□ 1,74
Rcn1Q05186 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,94■■□□□ 1,74
Rcn1Q05186 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,92■■□□□ 1,74
Rcn1Q05186 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Rcn1Q05186 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,9■■□□□ 1,74
Rcn1Q05186 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25,89■■□□□ 1,74
Rcn1Q05186 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rcn1Q05186 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rcn1Q05186 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,88■■□□□ 1,73
Rcn1Q05186 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,87■■□□□ 1,73
Rcn1Q05186 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,87■■□□□ 1,73
Rcn1Q05186 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,86■■□□□ 1,73
Rcn1Q05186 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,85■■□□□ 1,73
Rcn1Q05186 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,83■■□□□ 1,73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms