Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Rcn1Q05186 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Rcn1Q05186 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Rcn1Q05186 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
Rcn1Q05186 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Rcn1Q05186 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Rcn1Q05186 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
Rcn1Q05186 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Rcn1Q05186 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Rcn1Q05186 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Rcn1Q05186 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Rcn1Q05186 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Rcn1Q05186 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Rcn1Q05186 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Rcn1Q05186 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Rcn1Q05186 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rcn1Q05186 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Rcn1Q05186 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Rcn1Q05186 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Rcn1Q05186 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Rcn1Q05186 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Rcn1Q05186 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Rcn1Q05186 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Rcn1Q05186 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Rcn1Q05186 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Rcn1Q05186 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Rcn1Q05186 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Rcn1Q05186 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Rcn1Q05186 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Rcn1Q05186 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Rcn1Q05186 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Rcn1Q05186 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Rcn1Q05186 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcn1Q05186 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcn1Q05186 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Rcn1Q05186 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Rcn1Q05186 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Rcn1Q05186 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Rcn1Q05186 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Rcn1Q05186 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Rcn1Q05186 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Rcn1Q05186 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Rcn1Q05186 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Rcn1Q05186 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rcn1Q05186 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rcn1Q05186 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Rcn1Q05186 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Rcn1Q05186 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rcn1Q05186 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Rcn1Q05186 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Rcn1Q05186 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rcn1Q05186 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Rcn1Q05186 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Rcn1Q05186 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Rcn1Q05186 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rcn1Q05186 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rcn1Q05186 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Rcn1Q05186 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Rcn1Q05186 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Rcn1Q05186 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Rcn1Q05186 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Rcn1Q05186 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rcn1Q05186 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Rcn1Q05186 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Rcn1Q05186 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rcn1Q05186 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Rcn1Q05186 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rcn1Q05186 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Rcn1Q05186 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Rcn1Q05186 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Rcn1Q05186 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rcn1Q05186 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rcn1Q05186 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Rcn1Q05186 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Rcn1Q05186 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Rcn1Q05186 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rcn1Q05186 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Rcn1Q05186 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rcn1Q05186 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rcn1Q05186 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Rcn1Q05186 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Rcn1Q05186 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Rcn1Q05186 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Rcn1Q05186 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Rcn1Q05186 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Rcn1Q05186 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rcn1Q05186 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Rcn1Q05186 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Rcn1Q05186 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Rcn1Q05186 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rcn1Q05186 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Rcn1Q05186 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Rcn1Q05186 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rcn1Q05186 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rcn1Q05186 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Rcn1Q05186 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rcn1Q05186 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Rcn1Q05186 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Rcn1Q05186 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Rcn1Q05186 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms